HMM Seed Alignment: TIGR04397
Download Alignment>gi|47526169|ref|YP_017518.1|/5-781
VKKLLGDSQKRKLKKYEQLVQEINNLEEKLSDLSDEELRHKTITFKDMLRDGKTVDDIKVEAFAVVREAAKRVLGLRHYD
VQLIGGLVLLEGNIAEMPTGEGKTLVSSLPTYVRALEGKGVHVITVNDYLAKRDKELIGQVHEFLGLKVGLNIPQIDPSE
KKLAYEADITYGIGTEFGFDYLRDNMAASKNEQVQRPYHFAIIDEIDSVLIDEAKTPLIIAGKKSSSSDLHYLCAKVIKS
FQDTLHYTYDAESKSASFTEDGITKIEDLFDIDNLYDLEHQTLYHYMIQALRAHVAFQCDVDYIVHDEKILLVDIFTGRV
MDGRSLSDGLHQALEAKEGLEITEENQTQASITIQNFFRMYPALSGMTGTAKTEEKEFNRVYNMEVMPIPTNRPIIREDK
KDVVYVTADAKYKAVREDVLKHNKQGRPILIGTMSILQSETVARYLDEANITYQLLNAKSAEQEADLIATAGQKGQITIA
TNMAGRGTDILLGEGVHELGGLHVIGTERHESRRVDNQLKGRAGRQGDPGSSQFFLSLEDEMLKRFAQEEVEKLTKSLKT
DETGLILTSKVHDFVNRTQLICEGSHFSMREYNLKLDDVINDQRNVIYKLRNNLLQ-EDTNMIEI-IIPMIDHAVEAISK
QYLVEGMLPEEWDFASLTASLNEILSVENMPSLSANNVHSPEDLQSVLKETLSLYKERVNELDSNTDLQQSLRYVALHFL
DQNWVNHLDAMTHLKEGIGLRQYQQEDPTRLYQKEALDIFLYTYGNFEKEMCRYVARHL
>gi|138896718|ref|YP_001127171./5-778
LKRAIGYTNERQLKKYMRVVEQINRMEPQMEKLTDAELRRKTDEFKEQLASGKSVNDIQVEAFAVVREVAKRVLGMRHFD
VQLIGGLVLAEGNIAEMATGEGKTLVASLPSYLRALEGKGVHVITANDYLAKRDRNLIGQIHEFLGLTVGLNLPLMSPQE
KKQAYQADITYGIGTEFGFDYLRDHMVYDASDKVQRPYHYAIIDEIDSVLIDEAKTPLIIAGKTRSSTELHYIAARLVKR
FEREVDYIYDGETKTVNLTDEGIEKVEKAFGIDNLYDAEHQVLYHYVIQALRAHVLFQRDVDYIIRDGKVLLVDAFTGRV
MEGRSLSDGLHQAIEAKEGLEITEENKTYASITIQNYFRMYPILSGMTGTAKTEEKEFQRIYGIDVIPIPTNRPKIRVDL
PDRVYMTRHDKYVAVAKEVKRRHESGQPVLIGTTSILQSEEVAKYLDQEQVPYELLNAKTVEQEAEVIARAGQRGRVTIA
TNIAGRGTDILLGEGVNELGGLHVLGTERHESRRIDNQLKGRAGRQGDPGSSQFFISLEDDMFRRFAAEETEKLKAKLKT
DETGCILNNDIHEFVDKVQRIVEGMNFSVREYNLKLDDVMNEQRNVIYQIRDRVLE-EN-DRVAL-VVPMIRSACDRIVD
AYALSEQIPEEWDVRRMTEELNRIVYRTPIT--FDQPPADLEDVKRKVAEAVESYVALLEKKKAHTQLQTLLKSVMLTVI
DDYWMRHLDQMALLKEGIGLRHYQQEDPIRLYQKEGFEMFKAMYEVIEKEISVHTARLL
>gi|312109417|ref|YP_003987733./5-777
VKKLLN-SDERRLKRYYKIVDHINALEPKFAKLSDQELREKTAYFKNELANGKTVFDIQAEAFAVVREAAKRVLGMRHFD
VQLIGGLVLAEGNIAEMATGEGKTLVASLPSYLRALEGKGVHVITVNEYLARRDRELIGQIHEFLGLTVGLNLPMMETEE
KKAAYQADITYGIGSEFGFDYLRDNMVYDISQRVQRPFHYAIIDEIDSILIDEAKTPLIIAGKTGVSSELSYLCARIVKT
LERDVDYYYDEETKATNLTEEGIAKIERGFGIDNLYDVEHQTLYHYIIQALRAHVLFQRDVDYIVRDGKIVLIDMFTGRP
MEGRSLSHGLHQAIEAKEGLELTEENKTQAAITIQNYFRLYPILSGMTGTAKTEEKEFQTLYGMDVVQIPTNKPVIRVDE
PDRVFLTIDQKYKAVAKEVKRVHETGQPVLIGTTSILQSEKVAKYLEAENLPFRLLNAKTIEQEAQLIALAGQKGQITIA
TNMAGRGTDIMLGEGVAELGGLFVLGTERHEARRIDNQLKGRAGRQGDPGRSQFFISLEDDMFRRFAKEETEKWMKKAKT
DENGEILNKEIHEFVDRVQRICEGNSFSIREYNLKLDDVLNDQRTAVYRLRNRILE-GD-RLIPL-VIDMLHSYVPYEIE
QHCPADMLPEEWDLEKLTEQLREIIPFPAVQ--LSGNINDIEDVKSNVQHSLEQYIHYLETMNDAEQVKAEIRPSLLSIV
DYYWLNHLDAMERLKEGIGLRFYSQEDPIRQYQREGFELFVYMYHQIEADICRRLAQAV
>gi|288554179|ref|YP_003426114./5-777
IKKLIGDSQQRKIKSYEKVVAKINELEPHMEKLSDEELRQKTSLFKEQIQNGTSINELKAEAFAVVREASKRVLGLRHYD
SQLIGGLALSEGNISEMPTGEGKTLVASLPSYLRALEGKGVHVITVNEYLASRDREIIGPVHEFLGLKVGLNVPMISPEE
KKLAYDADITYGVGNEFGFDYLRGNMVYATSQRVQRPYHFAIIDEIDSVLIDEAKTPLIIAAKTQVSPNLYHICAKVARS
FKENDDYMYDPLLKAASLTDNGITKIERAFGVDNLYDLEHHTLYHFMIQALRARVMFKLDVDYIVKEGEIQLVDMFTGRI
MEGRTFSDGLHQALEAKEGLEITEENKTQASITIQNYFRMYPNLCGMTGTAKTEEREFRMVYGMDVIQVPTNKPRIREDR
NDLVFATSEDKYKAVAAEVEERHKTGQPVLIGTTSIIQSETMASYLDDKKIPYELLNAKSVEKEVQLISLAGQKNQVTIA
TNMAGRGTDIMLGQGVHELGGLYVIGTERHESKRIDNQLRGRSGRQGDPGESQFIISIEDELLLRFGGEMIEAFKEEIKT
DDNGLVQNENINKLVDKIQKMSEDHNYSAREYTLKLDDIINEQREVIYKLRNKLLE-SE-NNFDT-VREMIDTTWKDYVD
HYCADELLPEEWNLEELTQRIQLILP-TFKG--FTQRPDEKKEVQAYITATYEQFIGDVEPLHEQEKIRIQIDRILLSNL
DIHWTQHLEEMNRLKEGIGLRSYGQEDPMRIYTREGFELFTMMYKTLQRNSSIQYSKMT
>gi|169826720|ref|YP_001696878./5-777
FKSNKEQTSARQLKRYYKIVDQINNLEQKYVDKSDAELREMTFIFKNQLEQGEPITSIIPDAFAVVREASKRVLGMRHFD
VQLIGGLVLTEGNIAEMPTGEGKTLVASLPSYVRALEGKGVHVITVNDYLAKRDYELVGQIHRFLGLTVGLNIPMMEADE
KKEAYNADITYGVGTEFGFDYLRDNMSYSLADKVQRPYHFAIIDEVDSVLIDEAKTPLIIAGKMPSKDELHRIAAMLAKR
FKKDEDYDFDDETKATSLTDKGIEKIEAAFNVENLYDLEHQTLFHYVIQAVRAHVMFKRDVDYIVKDDKIELVDMFTGRI
LEGRSLSDGLHQAIEAKEGVTITDENKSQAQITIQNYFRMYPKLSGMTGTAKTQEKEIREVYGMEVVQIPTNRPRQRVDQ
PDIIFSTQEAKYKYVAAETKKRHEKGQPILIGTTSILQSETVADYLKKEKLTFQLLNAKTVEQEVELISQAGQKGRITVA
TNMAGRGTDIVLGDDVHELGGLYVIGTEKHESRRVDNQLRGRSGRQGDIGESRFILSIEDDMFRRYAKEEVEKFSAKMVV
DEQGIIQNKEVQELIDRTQRIVEGSQYGMREYNLKLDDVINDQRTVLYGLRDKILA-GE-DLMGE-LKKMLHETVDFAVL
DAAPEDVSSIDWDYDRMEHALNSLFI-TPVT--IDREVGKVKQILADIQPSEQELLNHMEKFAENERVIEVLPQIMLSYI
DSGWVRHLEAMTHLKEGIGLRHYQQEDPMRIYQREGLELFGKNFQELRRSIIIEITGFM
>gi|345020981|ref|ZP_08784594.1/4-777
ISRIKQNESFREVKKYYALVEKINNLENEYEALSDDELKGKTIEFRNRLEKGETIHDLTVEAFATVREASKRVLGMRHFD
VQLLGGIVLLHGNISEMATGEGKTLVASLPSYLVALEGKGVHVITVNDYLAQRDRDIVGQIHEFLGLKVGLNIPGLGTQE
KQAAYNCDITYGVGTEFGFDYLRDNTVNELSQKVQRPYHYAIIDEIDSVLIDEAKTPLIIAGKDKPSGRLYKVCASVIKS
LKEEEDYTYDLELKTVNFTEKGLNKCEKVFGIPNLFDLEHSSLFHSLLQALRARVLYKRDVDYIVEDGEIKLVDMNTGRI
MEGRSLSNGLHQAIESKEGLVNTEENKTMALITVQNYYRMYPLLSGMTGTAKTEESELRETYGMNVVQIPSNKPNQRVDM
SDRVFMTKEQKYDFLLKEVKERHQTGQPILIGTTSILQSEEVAKLLDREQLEYQLLNAKSVQQEAKLISLAGQKDRITIA
TNMAGRGTDIMLGEGVAELGGLHVIGTERNESRRIDNQLKGRSGRQGDPGSTQFIISVEDYLFIRYAADELERMKPKFKA
NEIGEITSSNVHKFVETAQKISEGIHYQFREYNLKLENVTNKQRDIVYQLRDKLLE-EE-NAIQF-VMKQTADLPKKLIQ
TFCEEDSLPEEWDLERLSEELNKISLVPFQL--EEKEFQSDEELIDFVKDHFKQNLEELSQYEDNEEIQMNAKGVVLFVI
DTLWKKHLDTMNQLKEGIGIRQYQQEDPVQLYEKEGYKLFETLFNDIEYEIATRLIILI
>gi|229916556|ref|YP_002885202./5-777
VKQLTN-DQSRRLKAYERRVARINELETTMKALSDDEMRTYTETLKARLLDGKKVDDIAEEGFALVREASVRVLGMRHYD
VQLIGGFALLEGNISEMPTGEGKTLVAALPSYVKALEGKGVHVITVNDYLARRDAEQIGKIHDFLGLTVGLNVPDIEADE
KRSAYQADITYGVGTEFGFDYLRDNLVHKPEERVQRPFHFAIVDEVDSILIDEAKTPLIIAQKDRSHIRLKQLAQQIISE
FEET-DYEVDLESKSATFTEEGIVKIEELFAIDNLFSASHQVLYHYLVQALRANVLFELDVDYIVREDKIELIDLFTGRI
MEGRSLSEGLHQALEAKEGVTITEENKTTAEITIQHYFRMYPLVGGMTGTAQTSRQEFLKTYNMDVVQVPTNRERQRVDH
PDRIFMTTEQKYAAVTEKVAELHTTGRPILIGTTSIAQSEAISKHLKKKRIEHDVLNAKTVAQEADIIADAGQFGKVTIA
TNMAGRGTDITLDAKAKEAGGLFVIGTERHESKRVDNQLRGRSGRQGDPGATEFFVSLEDEIVKRYAAQKLERVEKKLKP
SATGEVSSKDAIEIIEYAQTTIEGLGVSIRDYLFKLDDVLNEQRNIIYTIRNQAVN-ADADAITKNVLGMMRLALENSID
MHVSDELVPEEWPIDELKDDLRYLTMQEPT---WAKDIADTRELKDALNDWMEAIIATTASRLEQDDIVLFAKESLLRAV
DMKWTDHLTTMSGLKEGIGLRSYGQEDPSRQFGKEGLEIFEQTYINIARDVTTELCQLD
>gi|319768286|ref|YP_004133787./5-780
VKQLFD-ESAREVQRLAKLAAQINEWEPTISSLSDEQLRQKTVAFKERLERGETLDDIKTEAFAVVREAARRVLGLRHYD
VQLMGGLAMHEGNIAEMQTGEGKTLAATLPSYLHALLGKGVHIITANEYLARRDCEQMGRVFRFLGLTVGLNVSQMTASE
KKEAYAADITYGTGTEFGFDYLRDNMVYRLEDKVQRPLYYAIIDEIDSILIDEARTPLIIANKSGIGAELFPIMARIVRT
FEEGKEYERSPETKQIFLTEEGAQKIERAFGIDNLYDWEHHVLLHHAMQSLRAWFIMRRDVDYIVKNGKVMIVDPFTGRV
MEGRSFSDGLHQAIEAKEGVEITEENDIQATITIQNYFRMYEKLAGMTGSATPSKEEFWQTYRLRVITIPTNRPSRRTDW
DDLVYQTYEAKVRKIIDEVKKMNAIGRPVLIGTTSVAQSERLSEAFSKAGIPHHLLNAKTEEEEARIIATAGQKGQVMIA
TNMAGRGTDILLGEGVKELGGLHIIGTERHESHRIDMQLRGRAGRQGDPGSSQFIISLDDDLFRLYDQDELKKWKSKVET
DETGRIVSPDPIKFVQKVQTTIENAHYSARLHLLKLDTVIDQQSKVIYHMRDRVLALKQAEVLSE-LLRHIQRYITQTID
RYCPENVFFEEWNIEGLHNELRRAFF-QFVYPIDDLRHKQKEEIAQLVWDEYKSLEAALTDLPCDEEQTMRLKHLMVETI
DAHWIRHLNQLNLLKEGIHLRSYGQEDPYRAFEMDAYREFVALQQAIDAGICTTAMNYL