HMM Seed Alignment: TIGR04216
Download Alignment>gi|110667179|ref|YP_656990.1|/200-987
TVSSGAIVFQGEDNLGFSG-PNAPTSS-SQLSRAGGANEGTPLD--RPVAQ---DAPTGTYDLNGGDPGDGGFNVTVQTP
RVSTLDVNNNNGEDVNGGTLVADQT--DANVLIEFNYGASEDIELTVEDSSGTEITNEIL---------DDSQPSIISGV
DPDGNATIEIDPSQVDEGEYTFTAAGIEDLDFGDATRSTTVTIASDRNAELSLGNDEATQGENVGFTIDNSPEGSFHAVV
VESSDFRDNIDANNADNIFREVGDTEDSGIVSPGG--DVLEIGTDIGATDAVDSDNVAYAFAIVEIDGGNGVGGIETQFI
DDTSVTVDLYTSSSTAQTP-YLDSNNNHIDANLVELESNGN-----------IQTDDDQDLDVLEGEVSLENPDNTYIVN
SEIELNGTTAPGVDEVAIYARDQGDYELVQIDGSDTVTVDADNTFSEDDVSLTDGDGPGNDLLSIPGSYRIGVIDASDA-
-GGVGNIAAELDTSDFNGGVSSSKSIRVTDTELSGDFTFYNGQIAEEDRFNAVDVEGLAPGQSEVGVIFVGPRGNTETEL
VSVDSDDTFDEEDLSLGGQIAQGTVSAHFLSDGRDGEIGA----TGTDLEDFVNNDIPNFEDTAGGSATGEQVREQIIAD
SVDDTASDDLFITETFRLADGLTTIEEVN---------TPVSNNGTIEVTGQTNRKPDDTTIVLELLDQEDNVITTASTD
TWDTDGTYTASLSLD--AVETGNYTLEADDSENTDRVPVQVVEQVTEETPTPEPTATEEPTPTATPEPTATEEPTPTATP
EPTA-----------TSTPETGTGTPGFGIVVALIALIAAALLAVRRN
>gi|169237159|ref/66-852
SVASGATIFQGEEDVTFRKLDNEKEVSPATLSRTGGSDEGVPLQ--MPIPE---DQSTGSYDSNGPDNDEADFGVTVQSP
SVTMLEVRNNADNDVTGGVLNTQQD--ESSIAVDYNYYAAEDLELTVEDEDGLDVTDEILAADQSGGAYEDG--TGNNGP
N---TLRFDIDPNNVDAGDYTVSVEGVEDLDFGDATESASVTISSSNKASLNLAEDEVVQGANLKYTIENSPEGNYHAVT
IDSSDFRDSSSGADAAKVMRSVGDTVDTGLVVDND--STTEIVDDYENTS---ISDVDYAYAIVEIDDGNGVGSIETQYL
DDSSADIDLYPASDTEDAPDYVNSNEELTNGSALDG----------------VSTDDDTDFDVTQGDITLDNPTGAYVVG
SEVDINGTANEGTDDVVLYARDNNDFELVTVDGEKSIEVDSDDTFEEEDITLSDGDKGGDDILGLPGTYRLGIIAKSDA-
VNSSGGVKDNIDTSDFNQGVSSTSSIRVTDTELTASFETYNGQVADDD--NQIDVEGTAPGKDNVAAIIIGSRGKVKFQS
ISVDSDDTFDEEDIDISE-LRQGSASAHILSSGRDGKFGE-------DTANSISDLEDEVGNYTSGSPTGDQIRDRILSN
TVDDTASDDLIVTQQFRLVDGLTTIEATEGG----------EAGGSLTVMGTTNRKADDNTITVELLQGDA-SIEINSTD
EWNSDGQWSVDVPLS--NVEPGNYTVEADDGDNTDRQNVEIVE----ELEEPDQTTVDQPENNQTMTTTMTETTTETTTE
MTTTQENTTENGSEGTSDGESGGSIPGFGVGVALVAVLGAALLALRQN
>gi|292656200|ref/49-826
TIQSGDRVFLGEE-ISTDA-GLGASN--PLLTGTAGNSEGVSLDLSSPIPQTTENQPLGTYDVDGSGSATTP-NVTLLAP
RITDSEILTSSGGDVTGSAISSSDAG-NLYVNADYNYESAEKVEVTVEDPSGTDITNEVLSGT------DTFVDDGSIGS
TSSTGGGVGIDMSDQDAGEYTIILEGAEDLDFGDATETMTLTISSQDEIGIELDSESVTQGTDVQYTVTNGIDGNEHVVA
MDLSDLQNDATTEQAKEVFRNIGDTSEVGIANSS---ATNTSGSSTGPT----VETADIAYAVVEIDGASAVGGIETQYL
DDSEVDLEVYDAGVSATA----AVGQDATN---------------------------DITLTIEEGGTTLSSPTGQYVVG
SEVDINGTATSS-DSVAIYVRDDGDWQLLEIGGDNEISVDSDDTFEEEDIALSGLSGDGSSILSLTGTYRIGVIDASDAD
VGGDGSVDDSLTTSEFTSGVSSSNSIRVTDQALTGQFTTINGQVAPVET-GTVDINGTASGANSVLVIFVDERGNVNYQE
VSVDSDGTYDEDDITVG--LTQGRVTAHILSVGRDSAIGDGSLPSGPSNGATLNDLTGYLDTLDQNNNNGEQINELIASE
TVDETASDDLIVTETFRLAESSTSIDSIYPDAAEAAGINPVATGETMVIAGSTNLKPDDNTISIEVTNEDGTSVALEDTD
EWNNDGQWMVEIDTT--DFETGTFTVEADDGDNTDTVNVEVVS------EREDTTTSSDNATDTTTTTDGPTETTTTAEP
TETTEEP--------TEETTTSSNTPGFGIAVALVALVGAALLALRRE
>gi|55376403|ref|YP_134256.1|/73-886
QVGPGAVVFQGEEDLEDGG-NFGSNTDIGQLQKVSGDNSGILLG--NPIPQ---DQPTGSYTFDGNSGTD---GVTLQTP
RVTSVEVQNGGSGDVTGSTLQTSSSGPDAFVRADYNFQEAEDLEITVEDENGLEVTNEIVVQKTGLPTADRNNDNGASGS
NGDFDVGWELDTTDIDEGQYTITVEGTEDLTFGDASETVTVNITSDQQASLNLDNDEVVQGENLQFNVENSPEGNYHVVL
VESSEFRDGITADQASRIFRNVGDVQEVGLVDNTGPVSASTVASNVGSDQEV-ADVTRYAYGVVEIDGGSGVGSIETQFL
DDSSVDVELYPASDSSNDG-YASGGSHASSVTVRDTDGDGTDDSEDAIVTDLLETDDDQSFDVVEGEITLDSPSGAYITG
SQIDVNGTANQGVDQVALYARDNNDYELIEIDGSNTVSVDGDDTFSEEDVVLSQGSKGGNSIVSLPGSYRIGVIDVQDAD
LDSDGTVDDTLTTSDFNSGVSGATALRVTDTALNGTFTTYNGQIASDD--GQIDVDGQAPGKDNVIVAFVDSRGNAAAQV
VSVDDDDSFSEEDIDITS-LSEGTVTAHILSSGRDGEYGD----TGTSSDSAFVNTIET--GYAGGSSTGDQVREQILAN
TVDDTASDDLIVNEQFRLTDGLTTIESVS---------SPVEANGTLEVQGNTNRVPDDNTITVEILNSEDESVTVESTD
EWGSDGQWSVNVDLSDVDIEPGNYTVEADDGDNTDRTSVTVVEAGSLEEEQPDTETPEPDTETPEPDTETPEPDTETPEP
DTETPEPDTE-----TEEATTEASGPGFTAAIALIALVAAALLAVRRD