HMM Seed Alignment: TIGR04208

Download Alignment

>gi|20091122|ref/784-936
EPAKNVEVK-ELSQVF--ITNDKAVKFDFVK-----NATCVVYVGFDAKKTAGKTTTIVEELKGK---SSLVSELPSGDV
YKSFNVWV--GNSGYATSENIENPVICFKVEKAWLQDKNIDQASIALNRYSDE--KWEQLPANLSG--EDDTYMYFTAGV
PG--FSPFAITG
>gi|20092209|ref/160-312
ELQSNVEAK-ELSQAF--VTNGTHVRFDFPN-----GVTCIRYVEFDAKKTLGKITTIAEMLKGQ---SKLVPNLPEGTV
YKNVNIWV--GSGGIANSDNIENAVVGFRVEKAWLEENEIDADSLNLWYYDNS---WNKLDTEKLDE-ESDTYVYFEAKT
PG--FGSFVIVA
>gi|21228491|ref/519-671
EPASNVRIK-ELSQQY--ITSGKYAKFAFPR-----NATCVTHVAFNSRRTAGKTTTIVEMLKNK---STRVPDLPAGKI
YENVNIWV--GNKGTADPENIENAVVGFRVEKSWITLNDVDPASVRLWRLSSG--EWEELSIRQSG--EDDRYSYFEAQT
EG--FSHFVITA
>gi|21226367|ref/640-792
EPASNVEVK-ELAQEF--ITTGDRIKFEFTR-----NATAIVYVKFDSKRTLGKTTTMIEQLKGR---SVLTPKEPPGKV
YKYLNIWV--GNEGIAAPQNIANAIIGFRVRSTEISKNETEGPSVFMYRYSEG--KWNALPTRKMG--EDGQYMYFESRT
PG--FSPFAIIT
>gi|20090865|ref/970-1122
EPASNVESK-ELVQNF--VTSGRHIRFDFTR-----NATPVTAVEFDARKNAGKVTVTAEMLKNQ---SVLVSGLPEGEV
YGHFNIWA--GNSGFASPDNIQNPTVSFRVEKDWISENRIGPASVSLYRYSDS--NWTELPSRITG--EDEAFFYFESET
PA--FTTFAVAG
>gi|20091919|ref/1170-1322
EDQDNVEIK-ELSQKF--VISGTHVKFAFPR-----GVTVVSSIELDARRSFGKVSTFVEMLKGK---STLVTSLPEGKV
YKNLNIWV--GSGGAVTSDNIGNASIQFKIEKAWIRDNNISLSTITLHRYGEG--SWTALPTTQVR--EDRAFYYFKAKT
PG--FSPFSITG
>gi|20090061|ref/302-454
ESSRNVELK-EVANEQ--VFKGIHTCYTFQG-----ETNEIVSIEFDPKKNFGKTTTIVEMLKNT---SSIVEEPAPGTV
YKNLNIWV--GNSGFSSSDNLENARINFRVNGTWLSENRISETTMTLYRYSDD--TWNALPTNLTG--EDQNYFYFSSET
PG--FSPFAIAG
>gi|20089838|ref/311-462
EPAKNIEIK-ELATRN--VISGYHIKYEFPE-----NVTCITYIEYDAKKTFRRTTTIVEVLKNK---STLVPKLPSGRI
YKHVNIWV--GDSGEGLPTSLKNGSVGFKVEKEWIKENNINESLITLQWYNES---WKPLSTEKVS--EDENYTYFKAKT
SG--YSSFAITE
>gi|21227292|ref/399-551
EPEKNIKKK-DSCQQF--VSNGKKVKFYFKN-----AATPVGYIEFYSRKTAGRITAFVEELKGK---SSKVTEEPEGEV
YKYINIQV--GDGKLSSSKNIKDAIVGFKVSKEWIDENHIDTDTIVLQHYTED--QWNPLKTEKTG--EDDEYIYFEAET
TS--FSPFAIVA
>gi|298676136|ref/1696-1848
EDFENIVFK-DVKSEY--VMKGDSVFYDFDD-----TENVIEYVRFDALRTRGDVSTTIEVLDDT---SALVENEAPGNI
YCNVNVWV--GKAGFAIPENIENPVIGFRVEKSWIENNNIDESTIRLCRCNDG--TWDPLTTRKLS--EDEGYMYFESDT
PG--FSPFAITA
>gi|91773602|ref/191-343
EEYENIEVK-DVVHKH--IVMDEETSYEFKD-----ESNAIETIKFTALKNAGEISATIEVLKGK---SALVKNDPPGRV
YQNLNIWV--GKSGFATSDNIADVKVGFKVEKSWIEANDIVVATIRLCRHHND--VWNPLPTNKSG--EDDTYIYFEAKT
PG--FSPFSIIG
>gi|91772201|ref/196-348
EEYENIELK-EITERN--VILGQVISFGFDD-----PGNPIVSVNFTGLKNSGDISTTIEVLKDT---SALVDVGPNGLV
YKNLNIWV--GKAGFATPGNIDSPTIYFRVNNSWMDMYGVDSSAIRLNHYSEN--SWSGLETKVMY--EDVEYVYFESKT
SG--FSPFTITA
>gi|298675180|ref/1045-1195
EEYENIKEE-LVQQEY--VNYGEQVSYEFRT-----KENKIKRVQFEAKKTAGKVETRIEVLKDK---SALVDENAPDKV
YQNMNIWV--GKAGFN--NNIKNASIDFDVEKSWIEENDINESTIKMCRYHDD--KWNKLQTQKLT--ENETVIKYRANT
PG--FSPFAITG
>gi|298676163|ref/2034-2184
EDLDNIIDD-FVNQKY--VGNDRHIWYNFDN-----KISKVKSVHFDAAEARGKTNTRLVILKSN---STMVDEKPPGKA
YQNINIWV--GKAGFD--NIVENASIDFIVDKTWIRNNNIERSTIKMCRHHGS--SWDELETEKLS--ENETIIKFRSDT
PG--FSPFAITG
>gi|91773513|ref/444-597
EAPENIVLE-DNLQTI--ITVGNRANYEFNN-----PSNCIMSISFDPKMNAGYKAAKIEILKST---SSYA-TPISGEV
FQNMNIWV--GKVGFATPENMENINVEFKVLRSWINENNIDRSSIKLNRYHDE--KWNSLNTVEITEREDQDSLYFSAET
PG--FSPFVITG
>gi|294495964|ref/196-347
EEFENIASK-HAQVSK--VAAGEDVRYEFSE-----DDIDLMTIQFTSLSNEGQTKTSVEVLKDT---SALVDSSAPGKV
YQNLNIWV--GNVAFD-EDDMEDPVVGFRVSKEWISDNDVEPSSIVLCRYNDG--EWTQLPTEVIG--EDKDYFTYESET
PG--FSPFAITA
>gi|294494762|ref/681-829
ESRENIVSK-SSQIQK--VVADENVRYDFKD-------DSISSIEFKGTDNFGYVKVLVENLDDT---SSLVDQEPPGKI
YRNLNIWV--GDNRFD-GEGMTDTVIGFKVSKDWLSANDTNPDSVVLLHYTNA---WQILETVQTE--EDADYFYFEAHA
DG--FSPFAISA
>gi|294494806|ref/395-544
EPYRNVEQR-EAHGQF--IAMNTRAEYNFAQ-----GSTPVDSIIITPLINAGYTSVLVEVLKDT---STRVDTQPPGLI
YSNLNILI--GSR--ITEEGIEQATISFGVDKTWLDENDLDPSNIRLLRYTT---QWTPLSTTMTG--EDEDKVYYTAET
PG--FSSFAIVA
>gi|298676194|ref/1383-1534
EPYENIADK-SVKMKY--LNKNDPVKYEFEE-----KSNPIKSVEYTPLINAGYVDVVVEMLKDT---STFVDNEPKGNV
YKNLNIFI--GKGKWAEKGNLENLTISFSVNKSWIDRNNVNADDVILSSYDES---WNKLSTTKIS--EDSNKVYYRANI
PE--YSPFMAIN
>gi|91772891|ref/2244-2396
ESYENILEK-AVTSMH--IIKDVEKSFTFTN-----EMIDITYINVTADLNVGNVKAIVESLNTT---SSLVSKPPEGRV
YKNINIWL--GDFGFE--KRITDSSIGFRVERSWLKENSVPEFSVKMSVFKNN--KWGILPTEKIG--EDEIYVYYEATP
SGEIFSSFAIIE
>gi|91772937|ref/1139-1290
EYFENIYHK-EVVTEY--VSRDVETTFMFSE------DARIEYVVLLADSNVGSVKAIIEVLVNT---STLVPNKPDGEV
YQNLNIWV--GNYGLK--KNIVSSSVGFKVRNDWIDENGIEADSISMKMYYND--VWVALPTKIIG--KDDGFVHYETDT
SVDILAPFAIVG
>gi|294494797|ref/1032-1184
EDYSNIIFK-DFSIRS--ITVDEPVTYEFKE-----PKNPVRQIDLISARNAGQVKFTVELLKNT---SSLVNKPSAGLV
YHNLNIWA--ENSAFS--ENIQNSSVIFRIDQDWFDQENVDVKDIVLEVFENG--TWIALPTEYIN--KSTNYLYFKADT
DRYLNAPFVIMG
>gi|298676185|ref/242-396
DLADNVEVS-ETEKRK--MRSNQLVKSEFNK-----ESNPVKYINITSKITTLDLRINVEVLKDT---STIVEKEPDGIV
YKNLNIWV--GYDGYATTENIINSTVEFKVDNNWIENNNIDPDSITLIHYNRDQKKWIELNTEKIK--ENDFDTYYIAHP
SH--FSPFAIIG
>gi|294494807|ref/207-361
NSNNNVDAE-ELITQR--VFSDTPVNFQFSD-----PEVPVKSINLTSAITVMDVPVRIEVLKDV---SVMVKKEPSGNV
YKHINMWV--GNRGFAIAENIKSAKIHFQVENDWIDNNNINPESVVLMHYEEDADQWTRLPTDMIS--GNEQYTLYKASA
TH--FSPFAIAG
>gi|91773942|ref/222-376
KDAKNVLIT-ESTNLR--VISGTPAEHHFEH-----TSNPVTYIKFTSSVTARSVPITIEILKET---SELVKETPEGIV
YKNLNIWV--GYEGFAIPKNIKDALLEFNVNTAWLEENNIDPHRVSIMHYNSGSDQWETVPTTYIK--TLDGIAYYQSTP
DS--FSPFAIVG
>gi|21226455|ref/42-190
SSQTNIQYI-ETTQIN--MDNSQTVTVDVKN-----DNSVVNNIYFESTKDSGKAKVVIEDLKDD---TGLVEK-PSGDV
YKSFNIWI--DSDNV---NNIENAAVDFKVEKTWLKANGIDESSIVLNMYDNG--KWVKVPITITG--QDSTYVYFTAKV
SE--YSTFAITS
>gi|294494796|ref/1084-1235
MPAENVQNT-DSGIKR--VLAGSNVKYDFSE-----NAGSVFGISFDAKDDKGNVVAKVQVLKDK---PDDVDT-PSGNS
YQMMSITV--GNQDTISENNADNILIEFKVSKEWTEQNNIDPTTIRMTRFHDG--DWQDLPSNEVG--EDDEYFYFTAET
SG--FSVFSIVG
>gi|294494767|ref/992-1139
VSSSNIISR-DTDTQI--VGRDAQVRYTFAA-----NQTPVTGIAFNTQQNQGYVMTTVSLLHEL---PADIDA-PAGKA
YRTMEIAT--GSQNPLS----DNITIEFSVSRDWIEENNIDIATIRLAHYNEG--EWEELPGDQVD--EDDENIYFTAET
AG--FSIFSIVG
>gi|21228085|ref/1337-1492
ESKNNINNTVVLPVRK--VEENESVSFNFTEEPDNTDDNSILAISFNASST-GNVSVFVEVLKDR---ASEVTKNPEGEV
FQHINIHF--SNHTVMNETGSDSKFIDFKVNRAWME--TVVKGTVRLNRYQNG--EWQPLNTWETS--SDAEYHYFRAET
PG--FSLFSVTA
>gi|284162070|ref/335-482
EIVQRITSKPKIVRILPVIEPGKPTTIRIGG--------IVDSIKLKVKSKVENVAVNVKKLQEL---PKNVPKL-NFKV
YAYLEINV------NISANNIEEATISFKVDKSWLRENGLKARDIVLMKFLNG--RWIQLETSVVG--EDDHYVYYEAKT
TS--FSIYAIAT
>gi|126179160|ref/1070-1216
GGDSTPSFS-AGIREN--LRSGE--TFTFSD----ISVTSVSSVNVTAASTIPKMMLTVKKAK-----ASSAAEPPAGDV
YEYIEITP-----QWVSQNQIGNATVFFSVPANWLESHNATAEDVVLMRYVNG--IWESLETEVIG--EENSKYNFRATT
PG--FSIFAIIA
>gi|298676165|ref/364-520
EPQNNVLIN-ESFSVD--FNSGQEFYKELKN------TEVITGLTLTPDKNSDGVVILVEELNGNLQHSELVDGKAPDQV
YRNFNIWISKGNHNIESENYIKSGKIKFKVSNDWIKDNNINKNDINLYRWDET--HWSILKTNHIN--EKNGNHQYESEI
TT--FSAFSISG