HMM Seed Alignment: TIGR04203

Download Alignment

>gi|116515899|ref/1396-1432
TPTVTI-----TEGQNGTHTLTV---HNP---G----SPDVTTTIRDGATGQ
>gi|260583563|ref/706-742
TPTVTI-----TEGKNGTHTLTV---HTP---G----QADVSTVIRDGAQGR
>gi|116515899|ref/1814-1854
SPTVTAVRKD-EAG-HKGVEITV---DNH--DG----SQPTTVFVQDGAKGK
>gi|240948803|ref/1020-1056
SPTVTIT----DNK-NGTHTITI---TNA--DG-----TQTTSIVKDGATGE
>ORF03188|scr/898-942
SAMATV-----ETKADGTKVITTGYDQDG--DGTISNNERTSATVKDGATGA
>ORF03150|scr/41-85
AGFVDVK----DNN-NGTKTVTTGTDTNG--DGIVSEDEKTSATVSDGAQGV
>ORF03150|scr/110-154
AGYINVV----DNH-DGTKTLTTGTDTNG--DGVVSEDEKSSVTVSDGAKGD
>gi|197122065|ref/44-76
GTSCTVT----DNH-DGTHTITC-----T--DG-------TSVTVSNGATGG
>ORF03188|scr/1453-1489
SASATVT----DNN-NGTKTITI---TNA--DG-----STTTATVKDGATGA
>ORF03190|scr/582-618
SPSVAIT----DNG-DGTKVIII---SNA--DG-----STTTATVRDGATGA
>gi|148652858|ref/269-308
EVPATVK----DNG-DGTSTLTP---TKPLTEG----EHTVAVATKDPAGNV
>gi|261381415|ref/15-51
NAEAEVK----DNG-DGTHTVTI---KDG--NG-----NTTTTVVKDGATGA
>gi|261381415|ref/107-149
SAEGKVE----RDEAKGTSTITI---NNFDKDG--KVISTTTATVKDGKDGK
>ORF03188|scr/1659-1695
SATARVI----DNG-DGTYTITI---TDA--DG-----KTSEVTVRNGKDGR
>ORF03190|scr/637-673
SVSATVT----DNG-DGTYTITI---TDT--DG-----NISEITVRDGKDAK
>ORF03150|scr/443-479
SATATVK----DNG-NGTYTITL---MNG--DG-----TTSSVTVRDGRDGK
>gi|116515899|ref/2123-2159
TPTASVR----DNG-DGSHTIVI---TNP--EG-----VTTETTVRDGKSPK
>gi|116515899|ref/2225-2261
SPTAKVV----DNG-DGTHTITV---VNS--DG-----ITTTTTVRDGREPK
>ORF03188|scr/1705-1742
SPSVEVV----DNG-DGTYTIIT---RDG--DG----KEISRVTVRDGKDGK
>gi|289549724|ref/157-199
TPSVEQQAIQDKDGKQIGVTIII---KDG--DG----KEISRQNILNGQDGK
>gi|289549724|ref/561-597
VPSLD------KEGKQNGIIVII---KDG--DG----KEISRQNIYNGEKGQ
>gi|289549724|ref/463-505
TPTIEQLPILDKNGKQVGVTVIV---KDG--NG----KEISRQDIYNGRDGQ
>gi|289549724|ref/656-698
TPSIEQQPVKDEKGNQVGVVIIV---KDG--DG----KEISRQVIVNGKDGK
>gi|289549724|ref/215-251
MPALD------KDGKQIGVTIIT---RDG--DG----KEIGRQTVTNGQDGK
>ORF00034|spo/752-794
TPTVEQTPIKDASGKTIGTTIIV---KDG--DG----KEVSRSNILNGKDGV
>gi|116515899|ref/1673-1710
TPEVTV-----TPGKDGHSTDIT---FTV--PG----KDPVTVNVKDGENGL
>gi|289168364|ref/1107-1144
TPVITT-----ARGKDGHSTDIT---FTI--PG----EEPVVANIKDGRDGR
>ORF00034|spo/612-649
SPTITT-----KPGADGNSTDVT---ITI--PG----KEDTTINIKNGRDGL
>gi|116515899|ref/1864-1901
TPTITT-----QRGQDGQSTVVT---ITT--SG----KDPVTFTVKDGKNGK
>gi|241888979|ref/1253-1290
TPTVTT-----QRGADGRSTIVT---FTT--PG----KDPVSFVVKDGKDGR
>ORF03190|scr/469-509
APTMNIT----SDG-SGNYTVTY---TDT--FGQEISSNFSVATIK-GEKGD
>ORF03150|scr/483-519
TPTVQVT----DNH-DGSYTITV---TNA--DG-----STSTVTVRDGKDGR
>gi|116515899|ref/906-943
TPTVTVK----DNKNDGTHTITI---NDG--RG-----NVTSTVVRDGFDGA
>gi|116515899|ref/1016-1052
TPTVKV-----TDGQDGTHTITI---NDG--KG-----GITTTVVRDGFDGA
>gi|116515899|ref/2046-2082
TPKVEVT----DNN-DGTHTVKV---TDG--DG-----NVTNAIIKDGKDGK
>gi|116515899|ref/2370-2406
SPKVSVE----DNG-DGSHTITI---INS--DG-----TVTKTVIKDGKDGR
>gi|116515899|ref/2333-2369
SPTVTVK----NNN-DGTHVVTI---TNP--DG-----SKTEMVIKDGKDGK
>gi|116515899|ref/1113-1150
TPEVTVT----DNN-NGTHTITI---TQP--DN----RPSLTTIVKNGEDGK
>gi|259046711|ref/1321-1358
PPTISVK----ENN-DGTHTITI---TQP--DG----QSPIETIIKNGKDGE
>gi|116515899|ref/2009-2045
TANITTT----ENP-DGSHTITV---TNP--DG-----STKETVVKNGKDGK
>gi|116515899|ref/2083-2119
AATATTT----ENP-DGSHTVTI---TNP--DG-----TKNEFVVKNGRDGV
>gi|259046711|ref/1662-1698
SPVITLT----DNN-DGSYTISV---TNP--DG-----TKQEVVVKNGKDGK
>gi|222153235|ref/344-380
SPIINVK----DNG-NGSHTITF---LNP--DG-----SRKEVTISNGKDGQ
>ORF00034|spo/702-742
SPKVTVTPGKDKDG-QPGHTITI---QKP--DG-----STEDVFIKDGKDGK
>gi|116515899|ref/1972-2008
APTITTK----DNG-DGTHTITV---QNP--DG-----SESTTVVKDGKDGK
>gi|289168364|ref/2360-2396
SPVVNVT----DNG-DGTHSITV---RNP--DG-----SESTTKVKDGKDGK