HMM Seed Alignment: TIGR04180

Download Alignment

>gi|237666568|ref|ZP_04526553.1/4-300
VLVTGADGFIGSHLTEILIKEGYKVKAFVNYNSFNSWGWLDSIDKEIINEIEIFSGDIRDPNGVKVSMKGIEEVYHLAAL
IAIPFSYHSPDSYVDTNIKGTLNVLQAARELETSRVLITSTSEVYGTAKYIPIDELHPYQGQSPYSATKIGADRLAESFY
RSFNMPISIVRPFNTYGPRQSARAVIPTIITQLLSGEKQIKLGALSPTRDFNYVKDTVNGFIK--IAQSKKTI-GEEINI
ATQHEISIGKLAEELIKQINPSAEIVCDEQRIRPEKSEVNRLLGSNEKIKKLTDWEVQYT
>gi|237755680|ref|ZP_04584290.1/8-304
VLVTGSGGFIGSHLVERLLEEGCEVVAFVKYNSLNKWGWLDSFDKKVLDKIEIFTGDIRNSDSVRKAVKSVDVVFHLAAL
ISIPYSYISPESYVETNINGTLNILQACMDYSIEKVLITSTSEVYGTAKFVPITEDHPKQGQSPYSATKIAADYLAESFY
RSFDLPVVIVRPFNTYGPRQSARAVIPTIITQLLSGYEEIKLGSLHPTRDLVYVKDTVEGFVR--LAECDSAI-GKEVNI
ATQSEISIQDLAKKLINKINPNAKIVSEDVRIRPQNSEVERLLGSNEKLKELTGWIPETD
>gi|170761061|ref/8-304
VFITGAEGFIGSHLTEKLVQLGANVTALVQYNSFNNWGWIDTFSKEVKDSINVVTGDMREYDGMKRIIKGQDVVFHLAAL
IAIPYSYLSPMAYVKTNVEGTTNVLEACREYEVEKIVHTSTSETYGTALYVPIDEKHPMQGQSPYSASKIAADKMAESFY
RSFNLPVAIIRPFNTYGPRQSARAVIPTIISQILEGKTEIKLGSLSPTRDFNYVKDTAEAFIK--VAESDKTI-GQVINA
GSNYEISIGDTVKKIINIMGNDVKILCDEERIRPEKSEVNRLWADNRKIKELTSWNPRYN
>gi|254478847|ref|ZP_05092212.1/8-302
VLVTGAGGFIGSHLVEKLVEMGAKVRAFVRYNSKNNWGWLETSP--YKDEIEIYAGDIRDYDSVKDSMKGVEVVFHLAAL
IGIPYSYVSPLAYIKTNIEGTYNVLQAARELGVEKVIHTSTSEVYGTAKYVPIDELHPLQPQSPYSATKISADNIALSFY
NSFNLPVTIVRPFNTYGPRQSARAVIPTIITQILSGKKQIKLGNLRPTRDMNYVIDTVDGFIK--IAECDKLL-GEVTNI
GSGKEISIGDLVRLISRLMGVEVEIVQEEQRFRPEKSEVERLVCDNKKIREFTGWEPRYS
>gi|281411855|ref/3-297
ILVTGAGGFIGSHLTEFLIEKGHDVRAFVRYNSRNFWGWLEKSK--VIDKIEVYTGDVRDYDSVYNAMKGVDVVFHLAAL
IGIPYSYISPLAYIKTNVEGTYNILQAARERKVSRVVHTSTSEIYGTAQYVPIDEKHPYNPQSPYAASKAAADHLALSFY
RSFGLPVTIIRPFNTYGPRQSARAVIPTIIIQILSGKERIKLGNLRPTRDFNFVIDIVRGFYE--VGLHPDSV-GEVFNL
GTGREVSIGDLPKIIAKLIGKKVEVEMDKNRFRPEKSEVERLCADATKAAELSGWKPKYS
>gi|296134269|ref/8-302
VLVTGAGGFIGSHLTERLVELGAEVTAFVRYNSRNYWGWLEESC--YLKDIRVVNGDIRDYDSVRSAAKGAEVIFHLAAL
IGIPYSYESPIAYLKTNVEGTYNVLQAARELGTEKVIVTSTSEVYGTAQFVPISEAHPINPQSPYAASKSGADFLALSYY
RSFDLPVAVIRPFNTYGPRQSARAIIPTVIAQIAAGSRKIRLGSLTPTRDLTFVKDTAEGFIQ--VAVSEGSV-GQVINV
GSNFEISIGDLAGLIARIMGAEIEIETEKERQRPAKSEVERLLADTAKAKALINWAPRYT
>gi|124021826|ref/7-303
ALVTGADGFIGSHLVEYLLNKGCNVRAFCLYNSNGSWGWLDRIDKEYKKNIEVVLGDIRDPICVKNALKGCDHVYHLAAL
IAIPYSYMAPASYVETNIMGTLNVIQAARELDVSKVVHTSTSETYGTAQFVPITEDHPLVAQSPYAASKIGADQIALSYW
RSFETPVSVIRPFNTYGPRQSCRAVIPTIITQIAGGEKRIKLGSTTPTRDFNFILDTCSAFYE--VGKSEACV-GQVVNA
ASNYEISIGETVSLIADAMGARVEISSEAERVRPERSEVNRLFGDNSRIKRLTEWRPKYD
>gi|159903781|ref/5-301
VLVTGADGFIGSHLVESLLDNGYEVKPFCFYNSSGSWGWLEELCDEKSKELDVFLGDIRDPVCVKEAMKGCDMVFHLAAL
IGIPYSYIAARSYIETNIIGTLNVLEAAKDLGVSKIIHTSTSETYGTAQSVPINEKHPLSGQSPYSASKIGADQIALSFW
HSFNIPVTVIRPFNTFGPRQSNRAVIPTIISQIASGAKKIELGSLSPTRDFTYVLDTCSAYIA--IANSNKVT-GKVINA
ASNFEISIGDTASLIASLMQSKVDLCTDSKRIRPINSEVNRLYGDNSLIKDLTDWQPKFS
>gi|157413781|ref/5-301
VLVTGADGFIGSHLVETLVRDGYKVKAFCLYNSLGSWGWLDHSSPEIIQNVEIILGDVRDQFCVENSLVGVDIVFHLASL
IAIPHSYKAPQSYVETNINGTLNILQSSKKLGIEKIIHTSTSETYGTAQYVPIDEKHHLVAQSPYAATKIAADQLAMSFF
KSFNTPVTILRPFNTYGPRQSARAVIPTIISQLASGKNKVSLGKLSPTRDFNYVQDTVNAFKA--VAFSKNTT-GKIINC
ASNFEISIEDTAYLIADIMNKKIEISSESERERPENSEVNRLFGDNNLIKEITNWHPKYS
>gi|126696749|ref/7-303
VLVTGADGFIGSHLTEMLVRKGYEVNAFCLYNSFGLKGWLDFVAPEIKNNINYIFGDIRNYDSISKAVKSNNFVFHLAAL
IGIPYSYTSPSSYVDTNIKGTLNVLEACRKFDIEKLIHTSTSETYGSAQYVPINEEHPLVAQSPYAATKIAADQLALSFF
KSFNTPVSILRPFNTYGPRQSCRAVIPSIILQILEKKEFISLGSLMPTRDFNYVSDTCEAFEK--ICISNKTT-GQILNA
ASEYEISIADTVKEISKIMNSKISIISDQKRLRPDKSEVNRLFGDSSRLQELSNWKPKYK
>gi|294506509|ref/4-300
ILVTGADGFIGSHLVEGLVDQGKEVRAFVRYNAFNSWGWLETVDDDVLEAIEIFSGDVRDPNGVRESMRGVDVVYHLAAL
ISIPYSYHSPDTYVDTNVTGTLNVLQAARDSGTEKVVHTSTSEVYGSAQFVPITEEHPLQGQSPYAASKIGADQMALSFY
RSFDTPVAVIRPFNTYGPRQSTRAVIPTIITQIASGRRTLELGNLHPTRDFSYVEDTVRGFMA--VADSDEVV-GEVVNV
GSGFEISIGDLVDLIAEAMDVEVSVETDKERTRPEKSEVDRLYADISKAEKLLGWTPTHG
>gi|83309176|ref|YP_419440.1|/10-307
ILVTGADGFIGSHLTEELVRRGYDVRAFALYNSFGSWGWLDAAEPAVRNSLDVFLGDIRDPHGVRKAMEGCDAVLHLAAL
IAIPYSYHSPATYVETNVTGTLNVVQAARDLGVSRVVCTSTSEVYGTARYVPIDEDHPLQGQSPYSATKIGADQMALSYH
RSFATPVTVLRPFNTYGPRQSARAVIPTIITQIAAGARTLKLGALHPTRDFSYVADTAAGFIA--MLNAPETVLGEVINI
GSGFEISIGDTARLIAEVMGAQVDITCDDQRLRPEKSEVERLFAGTDKAARLLGWQPAHG
>gi|116327928|ref|YP_797648.1|/4-300
ILVTGADGFIGSHLTEALVRLGFEVKAFVYYNSFNTWGWLDYCSSDVRGKFEIFTGDVRDPNGVRTAMKGIDAVLHLAAL
IGIPYSYHSPDTYVDTNIKGTLNVLQAARDLNLSRVIHTSTSEVYGTAQFVPITEEHPLKGQSPYSASKIGADQLAYSFY
SSFSTPVIIVRPFNTYGPRQSARAIIPTVITQLLSGKTKIQLGSTSPTRDFNFVTDTVNGFIS--ALKSKQGL-GEVINI
GNGFEISVGDTVKLIASILDKEVEIVSDVNRIRPEKSEVERLWSSNQKAKDLFGWQPAYS
>gi|27381100|ref|NP_772629.1|/9-307
VLVTGSDGFIGSHVVEELVKAGARVKAIVYYNSFNSWGWLDTVPADVMKSVEVVAGDIRDPHFMIAAASGCTDVLHLAAL
IAIPFSYVAPDSYVETNVRGTVNVLQAARLAGVRRFVQTSTSEVYGTAQTVPIKENHPLVGQSPYSASKIASDQMALSFQ
ASFDMPVVVIRPFNTYGPRQSARAVIPTIISQIATGKRKIRLGAVSPTRDFSFVTDTARGLIAGLTAPAEQSV-GQTINL
GSGFEISVGATVEMIADVMGVDIEIETDEARLRPANSEVERLWADNSKARQQLGWAPEFG
>gi|261855245|ref/12-306
ALVTGADGFIGSHLVEMLVSRGYTVRALAQYNSFNHWGWLEDVA--YKDAIEVVAGDIRDAHFCRHMMKDVDVVFHLAAL
IAIPYSYIAPDSYVDTNVRGTLNVCQAALDAGVKRVIHTSTSEVYGTARYVPIDEKHPLQPQSPYSASKIGADAIAQSFQ
NSFSLPLTVARPFNTYGPRQSARAVIPTIISQIASGKQRIELGDLSPTRDFNYVEDTCRGFIA--LAESDATV-GEVVNI
GSNFEISIGDTLHLIRELMGSDIEVVHDDQRVRPANSEVFRLWCDNSKIHSLTGFKPEVD
>gi|254785444|ref/10-304
VLVTGADGFIGSHLVERLLQQGYKVRALAQYNSLNHWGWLEDVP--AHPHLEIITGDILDATCCREITRDIHTVFHLAAL
IAIPFSYRAPSRYIETNVTGTLNMCQAALDQGVVRFLQTSTSEVYGTAQYVPIDEAHPLQAQSPYSASKIGADALATSFH
RSFELPLTIVRPFNTYGPRQSARAVIPTIITQIAAGAESIQLGDLSPTRDFSFVTDTCDGFIA--LANCPQAI-GETVNV
GSNFEISVADTLEKIREIMGSNVKFMTDQARLRPSASEVMRLWCDNSKYRALTGKQPEFS
>gi|78485803|ref|YP_391728.1|/11-305
VLVTGADGFIGSHLTEQLVKAGAKVRALALYNSFNSWGWLDQSP--YLDEIEVVSGDVRDPFLCKKITQDCHTVFHLAAL
IAIPYSYIAPNSYVETNVNGTLNMAQACLDNNVTRFMHTSTSEIYGTAQYVPIDEKHPSQPQSPYSASKIGADAMAMSYF
NAFEMPVSIARPFNTYGPRQSARAVIPTIITQIANGMKEIKLGDTSPTRDFNFVTDTCRGMMA--IAESDKAI-GETINI
GSNFEISVQDTLEMIKDIMQSDVVFVTDEQRLRPKDSEVFRLWCDNTLIQSLTDFKPQYN
>gi|209548016|ref/4-298
ALVTGADGFIGSHLVETLVRSGVEVRALCQYNSFSSWGWLDQSE--YRGKFEVILGDVRDPAQMRSVARDVDTIFHLAAL
IAIPYSYQAPSSYIDTNVHGTLNVLQGALDAGVGRVIQTSTSEVYGTARFVPISESHPLQAQSPYSASKIGADAIAYSYH
SSFDLPVTIARPFNTYGPRQSARAVIPTVISQLLSGRRTLKLGALSPTRDFNFVQDTCDGFLA--LAACDKAI-GQTVNI
GSGGEISIGDTVRLIADIIGVNIEIECDEQRLRPANSEVERLCCDNSLIKSLTGFSPRYS
>gi|239908669|ref/5-301
VMVTGADGFIGSHLAEALLQAGCDVRAMVQYNSFNSWGWLDCSPGATSGDMEILAGDVRDSGFVRRAVAGCEVVFHLAAL
ISIPFSYVAPESYIDTNIRGSLNVVQACRDLGVSRLVHTSTSEVYGTALFTPITEAHPLQPQSPYSASKIGADQIVLSYH
HAFETPVAVMRPFNTYGPRQSARAVIPTIIGQLAAGQRRIRLGALTPTRDFNYVADTVRGFMA--MAESPHVL-GKTVNF
GSNFEISIADIAALIGEVMGVEFEIACDAERLRPAGSEVDRLWCDHSLARELTGWTPDFA
>gi|121611760|ref|YP_999567.1|/7-303
ILITGAEGFIGSHLVEALVAQGRRVRAMALYNSFGHYGWLDTLAPATRARIDLVMGDVRDAASVRQAMQGCDAVMHLAAL
VAIPYSYTAPSSYVDTNVTGTLHVLQAARDLELRKVVHTSTSEVYGSAQIIPIPETHPLLAQSPYAASKIGADQMAYSYY
CAFGTPVATARPFNTYGPRQSLRAVLPCIMLQALSAAPRLRLGALAPTRDFNFVTDTVAGLIA--ILDSDKAV-GETIHL
GSGHEISIGDAVRLVAEITGKPLEIEAEPARLRPAASEVGRLVCDPAKACALLGWQSSLA