HMM Seed Alignment: TIGR04043

Download Alignment

>gi|118469593/5-348
VDLALLGFRGRP-PV----HRNAGAGPSADGHLVIDGLNAAIPRNPL----SPFVFD--------GTRVLLDGEDTGLDV
EVIDRPRFYDLTTGDGVPYEKLARLHGRNVLATTVVQTCIRYSPDQR-CRFCTIEESLRSGATTAVKRPAELAEVAAAAV
RLDGVTQMVMTTGTSAGTDRGARHLARCVRAVKAAVPALPIQVQCEPPADLAVLSELRAAGADAIGIHVESLDDEVRSRW
MPGKATVALDAYRAAWREAVRVFGRNQVSTYLLVGLGENPDELVAGAGELIDMGVYPFVVPFRPQSGSLATDVDGAIAPD
SGLVEKVSRAVADLLRQAGMSGADQRAGCAACGACSVLQNLG
>gi|111020319/8-351
VDVAVRGIRSLNVPV----TRTSGAGPSDDGHVLIGGIGGAIPIRSD----SPYEVS--------GNRLLMNGTDMGVEI
EPVRRPRFYDLDTADGISYEKIARLHGTNVLATTVVQTCIRYDPQQR-CRFCSIEASLQSGSTIAVKKPEQLAEVAEAAV
RLDGVTQMIMTTGTSAAKDRGARHLARCVAAVKAVAPDLAIQVQCEPPGDLGTITDLRNAGADSIGIHVESLDEEVRRRW
MPGKATVPLDEYRAAWREAVRVFGRNQVSTYLLVGLGEDPDELVAGAAELIDMGVYPFVVPFRPLAGTLA-VEDGAQAPS
PALLADVTSRVAKELQAGGMRGADQKAGCAACGACSVLQNAG
>gi|152966025/22-373
VDVAIRGVRLAA-PV----RRTGGAGPSDDGHVVLGGLATALPLRSD----SPYLVREGRLVREDPLGALLEVTDLGIEV
EPVQRPRFYDLATTDGIPYEKIAKLHGRDVLATTVVQTCSRYAPEDR-CRFCAIESSLESGSTIAVKTPAMLAEVAEAAV
RLDGVKHVVMTTGTSTAPDRGARHLARCVRAVTEAVPGLPVQVQCEPPGDLATLTELKDAGASSIGIHVESLDEAVRRRW
MPGKSTVPMAEYRAAWTEAVRVFGRNQVSTYLLVGLGEDPDELVAGAEDLVELGVYPFVVPFRPLAGTLAVDVDGAGAPG
AAVLEDVSRRVAKALRAGGMRGADQMAGCAACGACSVLQNLN
>gi|111225308/8-351
SDLAVHGVAVDA-PV----ARRGGAGPSDDGHVLLGGVGTALPIVPT----SPYRVS--------EGRLLLDGADLGLTV
EPVRRPAFYDLRTADGVPYDQLARLHGADVLATTVVQTCIRYRAEER-CRFCAIEESLRHGATTAVKTPEQLAEVAEAAV
RLDGVRQMVMTTGTTAGRDRGARHLARCVRAVAAAVPGLPVQVQCEPPGDLAVLTELREAGAVSVGLHVESLDDAVRRRW
MPGKATVAMAQYRAAWREAVRVFGRNQVSTYLLVGLGENPDELVAGAAELVEMGVYPFVVPLRPIAGTLAFDVDGASPPP
AATVADVTVRVAALLRAAGMAGSGQRAGCAACGACSPLPSAG
>gi|220720886/2-355
TELQSFGLRLVD-PSAGVASRRGGAGPSDHKAVTVDGHTIMVPVHTSSAWHSPFTAE--APDARGVSRVMRGSIPIAS-I
SFPKQPRFYAMQTFDGVPYSHIATLHGSDVLATTVLQSCIRYESRKKSCKFCAIGQSLAAGRTIARKTPEQLAEVARAAV
LLDGVKHMVMTTGTPNATDRGAAILCESAFAIKAAV-DLPIQGQCEPPDDDQWFHRMKAAGIDTLGMHLEVVTPEVRERI
MPGKASVPVSRYMSAFEAAVRVFGRGQVSTYILAGLGDTREAILDTCDQLLARGVYPFVVPFVPISGT---PLEDHPAPS
PEFMKSLLAPLGERVVAAGLRSADIKAGCGKCGACSSLSIYE
>gi|170746695/8-361
NALQSYGVRLAD-SRAGAPSRRGGAGPSDHKAMTIAGRTVMVPVHTEAAFDSPFLVR--PPDADGIAVIEHAGVVVGR-V
TFPGRPRFYALSTFDGVPYAKIAVLHGRDVLATTVLQTCIRYQSRAKTCQFCSIGQSLAAGRTVARKTPEQLAEVARAAV
LLDGVKHMVMTTGTPNATDRGAAILCESAFAVKAAV-DLPIQAQCEPPDDDRWFERMRASGVDALGMHLEAVTPEVRARI
MPGKASVPLERYFDAFAAAVPVFGRGQVSTYILAGLGDAPDAILATADRLIGMGVYPFVVPFVPISGT---PLESHPAPG
PDFMHAVLKPLAEMLGRADLRSADIKAGCGRCGACSALSTYE
>gi|217978150/8-361
NELQSLGVRLID-PDAGASGRRGGAGPSDHKALTIDGLTIMAPVHTAPASGSPYLVE--KPDASGRSRILRDGLPLGV-V
SFPAQPKFYGLTTADGVPYSKIATLHGRDVLATTVLQSCVRYKSRAKTCQFCAIGESLAAGRTIERKTPAQLAEVAKAAV
ELDGVRHMVMTTGTPPGKDRGAAILAESAAAVKAAV-DLPIQVQCEPPDDDAWFGRLREAGADALGMHLEAVTDEVRARI
MPGKAQVPVERYFSAFRAAVPVFGRGQVSTYILAGLGDARDDILDICRRLIDIGVYPFVVPFTPISGT---PLENHPTPS
PAFMDDLLAPLALMLSEGGLASSDVKAGCAKCGACSALSAFE
>gi|116250431/14-367
NELQSYGARLVD-PKAGHESRRGGAGPSDHKALTIDGMTVMVPVHTAPAFESPYLVE--KPDEMGRSRISRDGTVLGE-V
SFPLRPRFYERSTADGIPYSQIAVLHGKDVLATTVLQTCIRYQSRTKTCQFCAIGQSLAAGRTIAHKTPEQLAEVAKAAV
ELDGVKHMVMTTGTPKGDDRGAAILADSARAIKAAV-NIPIQAQCEPPEDDIWFTRMKEAGVDALGMHLEAVTPEVRARI
MPGKAQVSIAKYMASFSAAVGVFGRGQVSTYILAGLGDSREAILEICEKLVALGVYPFVVPFVPISGT---PLESHPAPS
PDFMHSILGPLSRMLVASGLKAVDIKAGCGKCGACSALSTYE
>gi|209544748/16-368
TDLQSFGLQVDG-QVGGI-ARKGGAGPSDHRTVTIAGQTVMVPVYTAGARRSPFQAG--PPGADGSHVLVRDGRPVGT-I
RFPAPPRFYGLTTADGVPYWKIALLHGRDTLATTVHQTCIRYADRRTSCQFCAIGQSLEAGRTIAYKTPQQLAEVAKAAV
DLDQVRDMVLTTGTPNIVDRGAAVLAESARAIKAAV-DLPLQVQCEPPRDHDWFQRLRDAGADTLGMHLEAATQRVRERI
MPGKATVSVDRYMDAFASAVPVFGRGQVNTYILAGLGDTAEEILALAGRLIALGVYPFVVPFVPISGT---PLEDHAPPS
AEFMASLFTPLGKMLRTAGMTSSDIRAGCGRCGACSSLSAYE
>gi|158335384/8-360
TELQSNGLQVIA-PSIGVAGRRGGAGPSDHKAVTVDGTTVMVPIYTGTASQSPYTAQ---VNQGRQAVLEKADQAVAT-V
EFPRQPQFYQLQTAEGIPYWKIALLHSHDVLATTVLQTCMRYRDPDTACQFCAIEKSLEADRTIARKTPEQLAEVAEAAV
RLDGVQHMIMTTGTPNTRDRGAAYLAECAQAIKARV-NLPIQAQCEPPDGFGWFAQMKAAGIDSLGMHLEAVDPQVRSQI
MPGKAEVPLSHYFEAFDAAVQVFGWGQVSTYLLAGLGDSLDTLVEASQRLIDLGVYPFVVPFVPISST---PLANHPAPS
SEFMFTLYQQVGAMLKQAGMSSADINAGCAKCGACSALSTFE
>gi|16331917/8-361
TELQSKGLRLVD-PNAKDLGRKGGAGPSDHRAVTVDGTTVMVPIYTSTAAASPYSIN--LASMPPKTVLSKGDEEIAA-I
ALPRQPKFYDLKTADGIPYSHIALLHSNNVLATTVQQTCIRYRDESTVCQFCAIEKSLDAGRTITRKLPEQLAEVTEAAV
RLDGIEQVIMTTGTPNSGDRGAAYLTKCAAAIKARV-NIPIQAQCEPPDDFIWFERMKAAGVDSLGMHLEAVDPDVRAKI
MPGKAEVPVSYYYEAYEAAVKVFGWGQVSTYLLAGLGDSFETLVEASEKLVNMGVYPFVVPFVPISET---PLANHPAPD
SDFMFALYQRVGTIIKQSQISSVDMKAGCAKCGACSALSTFA
>gi|87283695/14-367
TELQVNGVAVP--AVGGNPGRRGGAGPSDHRAISVDGTTVMVPVYNTASQDSPYALE--RHDDGMVWLRHRDQSGSRQLV
DTPPEPRFYGLSTSDGTPYRSIALLHGRDVLATTLLQTCIRFRDRAESCQFCAIEQSLDDGRTLARKTPEQVAEVAEAAV
RLDGVKQLVMTTGTPNTDDRGARLMAETARAVKARV-PLPIQAQCEPPDDPIWFRRMQEAGVDSLGMHLEVVEPEVRRRI
LPGKAELSLERYFTAFEQAVAVFGRGEVSTYLLAGLGDSAESIVSCSERLIALGVYPFVVPFVPIAGT---PLEHHPAPS
TDFMVEVYTAVGGLLEVSDLSSAAMTAGCAKCGACSALSLFE
>gi|126696652/9-361
TDLQVNGISST--PKKGNRGRKGGAGPSDHRALTIEGKTVMVPVYNHLSKKSNYQLS---EESDGQFILQNSEDSKIKEL
STTKEPNFYSLKTKDGIPYKSIALLHSKDVLATTILQKCIRFRNREESCQFCAIEQSLKNEQTIVRKTPDQIAEVAEAAV
RLDGIKQLVMTTGTPNTSDRGARIMAEAAKAVKAKV-DIPIQGQCEPPDDPIWFQKMKDSGVDSLGMHLEVVEEEIRKKI
LPGKSEIPLERYYKSFEESVAVFGRGEVSTYLLAGLGDSKESLINCSKKLISIGVYPFIVPFVPIAGT---PLEHHPSPS
TDFMIDIYQSVSHLLNEGNIKSDEMSAGCAKCGACSALSLFE
>gi|37525197/14-365
TDLQCNGLKWEG--NFGL-SRKGGAGPSDHKALSLDGQTMMIPVLNLAVQDSPYTAK--PEPHSDKVIVFKNRIPVAT-L
TAPARPRFYDLKTAEGIAYQQIATLHSRDVLATTVLQHCIRMKDKATACQFCSIDQSLKEGRTLIRKRPEQLAEVAKAAV
ELDGVKQMVITTGTPNTGDRGAKILYDSVKAIKAQV-DLPIQVQCEPPDDFAWFQRLKDAGAVSIGMHLEAVSERVRQKM
MPGKAEVSLEKYFAAFEAAVAVFGRGQVSTYILAGLGDTELEIVEMSAKLTEMGVYPFVVPFVPIRGT---PLEHHPKPD
QAFMQSLYPKIGQQLKQHGLNSENTQAGCAKCGACSSLKAYE