HMM Seed Alignment: TIGR03987

Download Alignment

>gi|228764929/5-123
LASAITFITAALIFYTIGVWSEKFQKTLKFWHVIIFWLGLVCDTIGTTLMEKMAE-------AGSLFSFHGITGLSAILL
MLFHAVWATIVLIKKDT------KMMTTFHTLSVIVWFIWLIPYISGLIYGM
>gi|110800076/5-122
LIIAIIFMNLALLFYSIGVWSEKIQKTLKLWHLAFFYLGLICDTTGTGAMEKIA--------GGINFSFHTITGGAALIL
MLVHAIWATVVLVKKDK------NMIAKFHKFSIIVWVIWLIPFFTGAAMHM
>gi|169295655/2-120
LAKAIIFITLALIFYTIGVFSEKKQGTLKKWHVIIFWCGLVCDTLGTSFMGKIAG-------SMFEMNVHGITGLLAIIL
MLFHAIWATIVLVRNSE------ESKKTFHKFSIIVWLIWLVPYLSGMIVGM
>gi|126698431/5-130
LILAIVFITSALIFYTIGVFGERKAKILKKKHVIIFWLGFIFDTLGTFTMSNIANSHTFEVKSALSQNLHSITGLLAIVL
MLFHASWATFVLYKDDE------EKKKFFHKFSIVVWTIWLVPYFIGMFIGM
>gi|169257667/5-124
LILAIITITLALVFYTIGVFSERKAKRLKSAHVIFFLLGLVCDTTGTTIMSFIAKA------NSSSFGIHGITGLIAILL
MLFHAVWAIIVLRKNNE------EMQRNFHKFSIVVWLIWLIPYFIGMFMGM
>gi|188589917/5-129
LILAIIAITLALVFYTIGVFGERKAKTLKKGHVIIFWLGLLCDTIGTLLMGQISKSQVQIA-TTATQSIHGVTGALAIVL
MLFHAVWATLVLYKNDE------NKKAVFHKFSIAVWLVWLVPYIIGMIIGM
>gi|237656997/5-128
LIFAIIFITAALVFYTIGVFSERRAKSLNKNHVLFFWLGLLCDSTGTFLMGQIAKNQVTI--SKSAGMIHGITGFAAIVL
MIFHAVWATYVLKKNDD------DKKRDFHKFSIIVWLIWLIPYVIGMVIGM
>gi|220705816/5-123
LIMAIITITLALVFYTIGVFSERKSGILKKPHLIIFWMGLVFDTIGTTIMSSMAK-------GASLLSPHGITGALAIIL
MLFHAIWATVVFKGQER------KKLENFHKFSIVVWLIWLVPYVLGVFIGM
>gi|169297827/5-130
LIPAIIFITLALIFYTIGVWSEHRAGILKKKHVIIFWCGLVCDTLGTYTMSRIVASGTDKGITPTDLLIHQSTGMLAIIL
MLIHAVWATIVLNKGSE------KAKAIFHKFSLVVWFIWLIPYFVGMYIGM
>gi|226949523/5-129
LVFAIVTITLALAFYTAGVWSEKKSNTLKKWHVITFWIGLVFDTTGTLTMEKIAKAGSTSI-SSDQLALHGFTGGLAIVL
MLLHALWATCVLYKKDE------NKKVIFHKFSITVWVIWLIPYIIGMIIGM
>gi|227089015/5-125
LILAIVTITLAFVFYTIGVFSERHSGSLRIKHVVMFGLGLFFDTIGTTIMSAIAKNG-----ATANFSLHQITGMAAIIL
MAFHLLWAIYVLIKGTE------KAKSKFHKFSLLVWLFWLIPYIVGMIIGI
>gi|226314173/2-119
LVAAVIFINLALIAYTIGVWSEKRSGELKLKHLIFFGLGLAFDTIGTTFMKLLA--------ENSSLNLHGITGLIALIL
MFFHTVWACVVLWKKKE------HQIKQFHKFSLIVWILWLVPYSIGVALSF
>gi|156111282/11-130
LIAAICVISSALIFYTIGVWGERLQRKLKFWHLIFFLLGLLADTVGTSLMEHIAEL------THLHDEMHTVTGAIAILL
MFVHALWAIWTYVKGTP------IEKRHFNRFSIVVWCIWLIPYLIGVYLGM
>gi|150007632/11-130
LITAICVISSALICYTIGVWGERFQGQLKAWHLWFFVLGLYADAIGTGLMEHIAQL------THLHDTVHTVTGIIAICL
MLIHAIWAIWTYFKGSL------KAKQHFNRFSIVVWFIWLIPYCIGIYMGM
>gi|229808374/5-131
LIFASLAITSALVLYTIGVFKERADGSLRGSHVVLFWIGLACDTTGTTLMSIMARTS-----AEAAPAIHGITGLAAILL
MLFHAGWATLVYFQGKRGGAAALKRERTFHRLSAAVWVAWLVPYVIGMLVGI
>gi|221184770/22-140
LGFATTIITGALVFYTIGVFAERQSGTLKLSHIVLFYLGLACDTTGTACMSFIAQ-------NGSQSPVHATTGALAIIL
MIVHAVWATIVYSKKNP------TTLARFHRLSIGVWLVWLVPYICGMLMGI
>gi|227324373/5-125
LIVASVAITCALVLYTFGVFGERRSGTLSLRHVLLFWGGLVCDTTGTMIMSNIAQQS-----SAGGFGIHAVTGLLAIVL
MLVHAVWATVTYVRHNE------RGMHRFHTFSTFVWLAWLVPYIIGMLVGI