HMM Seed Alignment: TIGR03955

Download Alignment

>gi|145846284/2-473
YDVNSKHADDFINHEEILETLAYADENKNNMKLIDAIIEKAK........KRKGLTHREASVLLACSDEEKNKEIYKLAE
QIKKDFYGNRIVMFAPLYLSNYCVNGCTYCPYHAKNKHIMRKQLSQEEIRREVIALQDMGHKRLALEAGEDPVRNTMDYY
LESIKTIYSIKHKNGAIRRVNINIAATTVDNYRLLKEAGIGTYILFQETYHKESYLELHPTGPKHDYNYHTEAMDRAMEG
GIDDVGLGVLFGLDKYRYEFAGLLMHAEHLEAAFGVGPHTISVPRLKHADDIDPDQFDNGIDDDTFAKIVACIRIAVPYT
GMIISTRENQKTRERVLHLGISQISGGSRTSVGGYCEPEPE...DAKSEQFDVSDTRTLDEVVRWLMEMDYIPSFCTACY
REGRTGDRFMSLCKSGQIQNCCHPNALMTLKEYLMDYASPETKAIGDRLIDREVLNVPNEKARAVVLENLKLIEQDNRRD
FRF
>gi|167657397/4-474
YDPKSLKAEEFINHEEIEETLRYAEENKHNAELIDSILEKAR........LRKGLSHREAEVLLDCNIPEKNEEIYKLAE
QIKKDFYGNRIVMFAPLYLSNYCVNGCLYCPYHAKNKHICRKKLTQDEVRQEVIALQDMGHKRLAIEAGEDPVNNPLEYI
LECIKTIYSIKHKNGAIRRVNVNIAATTVENYRKLKEAGIGTYILFQETYHKESYERLHPTGPKHNYAYHTEAMDRAMEG
GIDDVGIGALFGLELYRYEFAGLLMHAEHLEAVHGVGPHTISVPRVRRADDIDPDEFDNGITDDTFAKIVACLRIAVPYT
GMIVSTRESQKSRERVLHLGISQISGGSRTSVGGYAEPEPE...EENSAQFDVSDNRSLDEVVNWLMRLGYIPSFCTACY
REGRTGDRFMSLCKAGQIQNCCHPNALMTLKEYLVDYASEDTRKIGEELIARELKTIPNEKVRAKATEYIDNIIH.GQRD
FRF
>gi|158450240/9-479
YDVRSMKAEDFIDDAEIRETLDYADRNKDNVELIDSIIEKAK........LRKGLTHREASVLLACEMPDKTAEICDLAE
QIKKDFYGNRIVMFAPLYLSNYCVNGCVYCPYHIKNKHIARKKLSQDEVRREVIALQDMGHKRLAIEAGEDPQMNPIEYI
LECIDTIYSIRHKNGAIRRVNVNIAATTVENYRKLHEAGIGTYILFQETYDKDAYEKLHPYGPKHDYAYHTEAMDRAMEG
GIDDVGLGVLFGLDKYRYEFAGLLMHAEHLEAVHGVGPHTISVPRVKKADDIDPDAFDNGISDDIFCKIAACIRIAVPYT
GMIISTRENPKVRDEIIRLGVSQISGGSKTSVGGYYEPEP...EDEKSEQFDVSDTRTLDQVVNWLMTKGYIPSFCTACY
REGRTGDRFMSLCKSGQIQNCCHPNALMTLEEYLVDYASPETAELGRRLIQDELKNIPNEKVRQIVVERLDRIKHG.DRD
FRF
>gi|218216417/4-482
YNPKSLKAEEFINHEEILETIEYAEKNKRNVELIDSILNKARPQKTEHGVHCEGLTHREASVLLACDIPEKIEEMYKLAN
EIKQAFYGNRIVMFAPLYLSNYCVNGCVYCPYHMKNKHIKRIKLTQDQIRDEVIALQDMGHKRLAIEAGEDPVHNSIEYI
LESIKTIYSIQHKNGAIRRVNVNIAATTVENYRKLKEAGIGTYILFQETYNKESYLELHPTGPKHDYDYHTEAMDRAMEG
GIDDVGLGVLFGLEGYQYEFAGLMMHAEHLEAVHGVGPHTISVPRVKHADDIDPEAFDNSLDDEIFEKIAACIRIAVPYT
GMIISTRESQEVRGKMLHLGVSQISGASRTSVGGYTEEDR....PHDSEQFDVSDQRTLDEVVNWLMQLGYIPSFCTACY
REGRTGDRFMSLCKTGQIQNCCHPNALMTLCEYLVDYASEDTKKIGFELIEKELNKIPNAKAQQIARENVDAIKSSNRRD
FRF
>gi|229790053/4-482
YDAKSLKAEEFINNEEILETLAYAEANKDNIELIKTILDKARPVKKDKGYVCQGLSHREASVLLACEIPEITEEINKIAE
EIKLAFYGNRIVMFAPLYLSNYCINGCVYCPYHAKNKTIARKKLTQEEVKEQVVALQDMGHKRLAIEAGEDPFHNPIEYI
LDSIKTIYSVNHKNGAIRRVNVNIAATTVENYKKLADAGIGTYILFQETYNKKSYEELHPTGPKHDYCYHTEAMDRAMDG
GIDDVGLGVLFGLEGYKYEFAGLLMHAEHLEAVHGVGPHTISVPRIKKADDIDPTAFDNSISDDIFAKITACIRLAVPYT
GMIVSTRESEQVRGRLLNLGISQISGASRTSVGGYEKEER....AHDSEQFEVSDTRTLDEVVGWLMDNGHIPSFCTACY
REGRTGDRFMALCKSGQILNCCHPNALMTLTEFLVDYASGETKKKGFDMIERELEKIPNEKRKEIAKSNVKDIMASNRRD
FRF
>gi|212671578/2-472
YDSHSLHAEEFIDHDEVQETLAWASEHARDAELIDGILAKAA........LCKGLSHREASVLLACELPDRVEALYRLAN
RIKHEFYGNRIVMFAPLYLSNYCVNSCVYCPYHARNKHIIRKKLTQEEVASEVIALQDMGHKRLALEAGEHPTMNPISYI
LDCIRTIYGIRHKNGAIRRVNVNIAATTVEEYRMLKDAGIGTYILFQETYHKQSYEKLHPAGPKHDYAWHTEAMDRAMQG
GIDDVGLGVLFGLEGYRYEFAALLMHAEHLEAVHGVGPHTISVPRIKKADDIDPDVFDNGIDDETFARICACIRVAVPYT
GMIISTRESQAVREKVLPLGVSQISGASRTSVGGYCEPEP...EDENSAQFDVSDRRTLDEVVRWLMDQGHIPSFCTACY
REGRTGDRFMSLCKSRQILNCCHPNALLTLKEYLQDYASPATRAVGLDMIAKELDKIPSDKVRARTIQCLGAIEAG.QRD
FRF
>gi|225096171/7-477
YDPKSSKAEEFINHQEILETLDYAEKNRENFELIDAIIEKAR........KKKGISHREASVLLACQDEERNEQIFKLAR
EIKREFYGSRIVMFAPLYLSNYCVNGCLYCPYHLKNKHIPRKKLTQEEIVREVTALQDMGHKRLALETGEDPVNNPIEYV
LESIKTIYSIKHKNGAIRRVNVNIAATTEENYRKLKEAGIGTYILFQETYHRESYEILHPTGPKHNYCYHTEAMDRAMTA
GIDDVGIGVLFGLELYKYEFAGLLMHAEHLEARFGVGPHTISVPRVKKADDIDPDEFDNGIDDDTFAKIVALIRVAVPYT
GMIISTRESAKCRERLLNLGISQISGGSRTSVGGYAEEEPE...DESSAQFDVSDSRTLDQVVRWLMELGYIPSFCTACY
REGRTGDRFMSLLKSGQIGNCCHPNALMTLKEYLEDYASEETRKLGDQLIEKEILNVPSERVREILRKNLKAIAE.GRRD
FRF
>gi|169259651/5-475
YDVMSSKAEEFINDEEIMETLKYAEDNKHNEKLIDEILEKAR........KKKGLTHREATILLDCDIKEKNEEIFKLAK
EIKEEFYGNRIVTFAPLYLSNYCVNGCTYCPYHYKNKHICRKKLTQEEIKREVVALQDLGHKRLALEAGEDPVNNPIEYI
LESIKTIYSIKHKNGSIRRVNVNIAATTVENYRKLKDAGIGTYILFQETYNKEAYEELHPTGPKHNYAYHTEAMDRAMDG
GIDDVGVGVLFGLNLYRYDFTGILMHAEHLEAYKGVGPHTISVPRLRSADDIDPDDFDNGIDDDTFAKIVACLRIAVPYT
GMIISTRESKECREKVLNLGISQISGGSKTSVGGYADDEEE...EENSAQFELSDNRPLDEVVDWLIGMDYIPSFCTACY
REGRTGDRFMQLVKSKQIANCCQPNAIMTLAEYLEDYASEKTRKDGYELIAKEIEKIPSDKMRELVKKNLENIKE.GKRD
FRV
>gi|156867724/2-470
YDVKSSKAEEFISDEEILDTLDYAEKNKSNKELIEALLQKAA........SLKGLTHREAAVLLDCDLPEENEKMYRLAE
QIKKDFYGNRIVMFAPLYLSNYCVNGCTYCPYHYKNKHICRKKLTQDEIRREVIALQDMGHKRLALETGEDPVNNPIEYV
LESIKTIYSIKHKNGAIRRVNVNIAATTVENYRKLKEAGIGTYILFQETYNKKAYEQLHPTGPKSNYAYHTEAMDRAMDG
GIDDVGCGVLFGLNLYRYDFVGLLMHAEHLEAAKGVGPHTISVPRIRPADDINPDEFENGINDDIFAKIVAVLRIAVPYT
GIIISTRETQKTRERVLHLGVSQISGGSRTSVGGYCEEEE.....EDSAQFEVSDTRTLDQVVNWLLGMGYIPSFCTACY
REGRTGDRFMRLVKSGQIANCCQPNALMTLKEYLEDYASPDTKEKGLKLIQSEIPKIPSEKVRQVVLKHLNEMEN.GMRD
FRF
>gi|224948315/2-470
YNPKSSIATEFINHDEILETLEYAKKNKDNLELINSLLERAT........DYKGLSHREAAVLLECEDKETIEKMYALAE
HIKKRFYGNRIVMFAPLYLSNYCVNGCRYCPYHGSNKHIARKQLTQEEIVKEVIALQDMGHKRLALETGEDPQRCPIDYV
LESIKTIYSIKHKNGAIRRVNVNIAATTVENYRKLKEAGIGTYILFQETYHKDNYEYLHPTGPKHNYAYHTEAMDRAMEG
GIDDVGCGVLFGLNLYRYDFVGLLMHAEHLEAKFGVGPHTISVPRIRPADDVDMNDYSNAISDDIFKKIVAILRIAVPYT
GLIISTRESEETRAEVLKYGVSQISGGSRTSVGGYVEPEK.....ENSAQFEVADTRTLDEVVNWLMTMGYIPSFCTACY
REGRTGDRFMRLVKSGQIANVCQPNALMTLKEYLEDYASEDTRKKGEALIQNEIPNIPNPKVKELVLQHLDELHS.GMRD
FRF
>gi|167668502/2-470
YDPKSKKAEEFIDDAEIKETLRYAAENRNNIPLIESILEKAA........RLGGLSHREAAVLLECGDPASIEKIYALAR
EVKRRNYGNRIVMFAPLYLSNYCVNECRYCPYHHHNTHIARRQLSQEDIVREVVALQDMGHKRLALETGEDPVNCPIEYV
LESIKTIYGIKHKNGAIRRVNVNIAATTVENYRRLKEAGIGTYILFQETYNKESYEYLHPAGPKSNYAYHTEAMDRAMEG
GIDDVGCGVLFGLNLYKYDFVGLLMHAEHLEAVFGVGPHTISVPRVRTADDIDPDEFDNGISDEIFQKIVAVLRIAVPYT
GMIISTRETQQTREKVLELGISQLSGGSRTSVGGYAEDET.....ENSSQFDVSDNRTLDEVVGWLLDLGHIPSFCTACY
REGRTGDRFMHLVKSQQIGNCCDPNALMTLKEYLEDYASPETRAKGEAMIAQMLPCIPNEKVRRLTAEHLAEIAA.GKRD
FRF
>gi|164603736/3-476
YNPKSCKAEEFINHEEILESLEYAQKNKGNKELIEGILDKAN........RAKGLTHREAAVLLECDDEELTDRMFKLAE
DLKKRFYGNRIVMFAPLYLSNYCVNGCVYCPYHAKNKTIARKKLTQDEIRREVIALQDMGHKRLALEAGEDPVNNPIEYI
LECINTIYSIKHKNGAIRRVNVNIAATTVENYRKLKEAGIGTYILFQETYNKDSYEKLHPTGPKHDYAYHTEAMDRAMEG
GIDDVGLGVLYGLSTYKYELVGILMHAEHLEARFGVGPHTISVPRLRPADDIDPADFPEALSDEIFQKIVAIIRLAVPYT
GMIVSTRESQKTREKVLHLGISQISGASSTSVGGYADRELGVKEEVTSAQFDVDDDRTLDEVVNWLLKMGYIPSFCTACY
REGRTGDRFMSLCKSGQIANCCQPNALMTLKEYLEDYASEDTTKVGEELIEKEVKKIPRDRTREIVGERLAKIEE.GERD
FRF
>gi|149127826/3-473
YKVDSPEAEEFIHHEEILETLEYARTNKDNRALIEQLIEKAA........LCKGLTHREAAVLLECDQPDLIEHIFHLAK
EIKQKFYGNRIVMFAPLYLSNYCVNGCTYCPYHAKNKTIARKKLTQEEIRQEVIALQDMGHKRLALEAGEHPTLNPIEYI
LESIRTIYGIKHKNGAIRRVNVNIAATTVENYRRLKEAGIGTYILFQETYHKENYEALHPTGPKSNYAYHTEAMDRAMEG
GIDDVGVGVLFGLNTYRYDFTGLLMHAEHLEARFGVGPHTISVPRICSADDIDAGDFPNAISDEIFSKIVAVIRIAVPYT
GMIISTRESQESRKKVLELGISQISGGSRTSVGGYAEREL..PENN.SAQFDVSDTRTLDEVVNWLLDLGHIPSFCTACY
REGRTGDRFMSLVKSGQIANCCAPNALMTLKEYLEDYASEDTRKKGLKLIEKETEHIPNPKIREIAIRNLKAIAE.GKRD
FRL
>gi|167659305/2-472
YQVASSKAEEFIHDGEIVETLAYARENRANRPLIEAILQKAA........EGKGVTHREAAVLLECELEDLNQRMFTLAK
QIKEKIYGNRIVMFAPLYLSNYCINGCVYCPYHQKNKTIPRRKLTQEEIRREVIALQDMGHKRLALEAGEDPRNNPIEYI
LESIKTIYSVHHKNGAIRRVNVNIAATTVENYRKLRDAGIGTYILFQETYNKTAYEALHPTGPKSDYAYHTEAMDRAMEG
GIDDVGIGVLFGLNTYRYDFTGLLMHAEHLEARFGVGPHTISVPRICPADDIDTKDFPDAISDEIFRKIVAVIRIAVPYT
GMIISTRESQRSREQVLEIGISQISGGSRTSVGGYAETTH..AEQD.SAQFDVSDHRTLDEVVRWLLELGYVPSFCTACY
REGRTGDRFMSLVKTGKIADCCTPNALMTLKEYLEDYASPETRALGEKMISKEVPMLLNERVRRITEKNLAAIAE.GKRD
FRF
>gi|167703691/2-473
YNVKSNKAEEFIDDQEILETIAYAKENKDNRELIFSLIERAK........DCKGLTHREAMLLLECEIPEAIDEMEKVAK
MIKQKLYGNRIVMFAPLYLSNYCVNGCVYCPYHLKNKHIARKKLTQEEIKKEVIALQNMGHKRLALETGEDPINNPIEYV
LESIKTIYGIKHINGAIRRVNVNIAATTVENYKKLKEAGIGTYILFQETYNKKNYEALHPTGPKHDYAYHTEAMDRAMDG
GIDDVGIGVLFGLEMYRYDFVGLLMHAEHLEAAKGVGPHTISVPRICPADDIDKSDFSNAISDKIFEKIVMIIRMAVPYT
GMIISTRESKRVRERVLELGISQISGGSKTSVGGYDEPET..EEDTTSAQFDISDNRTLDEVVKWLCELNYIPSFCTACY
REGRTGDRFMQLCKSGQISNCCHPNALMTLKEYSQDYAGDDTKLKADNLIMKELDNITSDKVRKICQERLTMIED.GKRD
FRF
>gi|167709723/2-472
YRPESGIAEEFIDDQEIKDTLAYADANKDNKELILSIIEKAK........KLKGISHREASVLLACEDKELIQKVFDLAI
KIKEEFYGNRIVMFAPLYLANYCVNGCTYCPYHYKNKHIRRKKLTQEEIKKEVIALQDMGHKRLALETGEDPVNIPIEYV
LESIKTIYSIKHKNGAIRRVNVNIAATTVENYKKLKDVGIGTYILFQETYHKDNYEVLHPTGPKHDYAYHTEAMDRAMTA
GIDDVGIGVLFGLDMYRYDFAGLLMHAEHLEAKFGVGPHTISVPRIRPADDIDPDDFENAINDDIFEKIVAILRIAVPYT
GIIVSTRETQESRERVLKVGVSQISGASSTSVGGYAEKEKP...EDNSAQFEKNDNRTLDEIIGWLMDLGHIPSFCTACY
REGRTGDRFMTLVKSGQIANCCAPNALMTLKEYLEDYASDEVKAKGEVLIKQELEKIPNPVVKQKATEYIENIHE.GKRD
FRF
>gi|226905528/5-473
YNPASSKADEFINHEEIMETLAYADEKSQDKEFCLSLVEKAS........HLKGLSHREASVLLKSEDSDVTEAIYDLAR
KIKDKIYGQRIVLFAPLYLSNYCINGCVYCPYHAKNRHIARKKLTQEEIVREVTALQDMGHKRLALETGEDPVNNPIEYV
LESIHTIYSIKHKNGAIRRVNVNIAATTVENYRKLKEAGIGTYILFQETYHRKNYEILHPHGPKHDYAYHTEAMDRAMTG
GIDDVGVGVLYGLNNYRYDFAGLLMHKEHLEAVFGVGPHTISVPRIRPADDISVDAFPNSISDDLFKKIIAILRITVPYT
GIIISTRESAKTRASVIEVGVSQISGASRTSVGGYAEEEE.....EDSAQFEVNDNRTLDEVINWLLTDGYIPSFCTACY
RAGRTGDRFMSLAKTGEISNCCQPNALLTLKEYLVDYASDDTRKKGEDVIAKELDKIPNPQVRSTCQAYLDKIIH.GERD
FRF
>gi|228308002/3-472
YNKQSHDACDFINHDEIIDTLRYAEQHKDDEKVISDILRKAT........EMRGLDHREAAVLLLAEDPATRQRVSQLAE
QIKLRFYGKRIVLFAPLYLSNYCINGCVYCPYHAKNRTIPRHKLTQEQIRQEVIALQDMGHKRLALEAGEDPRNNPIEYI
LESIQTIYSIHHKNGAIRRVNVNIAATTVEEYRMLHEAGIGTYILFQETYHKEHYEELHPRGPKSDYAYHTESMDRAMQG
GIDDVGLGVLFGLSTYRYDFVGLMMHAEHLEATFGVGPHTISVPRICPADDISLESFPEAIPDDTFLHIIAVARLAVPYT
GIIVSTREREAVRQRALHVGVSQISGGSRTSVGGYAQTTEA....AHSEQFEVSDPRTLDEVVYWLLQQGHIPSFCTACY
REGRTGDRFMSLCKSGQISNCCGPNALLTLQEYLEDYASPTTRELGLEMISQQLPTVPNERVRAIAQQRLQQIKA.GERD
FRF