HMM Seed Alignment: TIGR03878

Download Alignment

>gi|222529598/41-301
LFGVKTGVEGIDKLFYKLEFSKDQGKPVIKPLGGIPAYSVINVSGVADTGKSLFAEQFAVVQANEGNSVLYVTVETPAEF
LYSSLLFRANAMNIDKSKVEENIYILDVTRDFNIRGNINNFIKTIDNAASKFNVKNVVIDSITGFFESKEIYAREIVRTI
YNFLKSKKLTTLMISQKRSGQEHLSAEAAGGYAVSHIVDGTIVFSKQIIMNKFDSSTFKKPIGEVIRLLRVDGCRMCGHD
SKTYVFEIDQTGLIKVLYPLS
>OMNI|AF_0795/17-274
LFGIPTGTK-LDELFYKVEK--EGDRYVRKPLGGIPHLAVMNITGVPDTGKSLLAEQFAITQAGSGYRVLYVTVESPANF
LYTAMKERSEAMGVDFTKVESNVVVIDASESDELRENPKALMETMAYAIKEKKVTNTIIDSITGLYEHKEMMARQIVRQF
FNFMKKYRQTGIFVSQKRSAQASESAEAAGGLAVAHIVDGTIVLDKKLIESRWDVSLYGLPLGSILRTIRIDGCRIAPHD
SRVWVFEISEIGTIEIIAPLS
>OMNI|GTCORF1064/35-293
LYGVSTGIEGLDPLFYVVVS--ENGRLVKKQLGGIPAYSVFNITGVSDTGKSLMVEQFAIKQASKGERVAFITVETPANF
LAASLELRANAMGFNFKDFEDNLIIIDAASSTKLRESLPDLLATLAYVIQHYKANFTIIDSVTGLFETKEMLARNIVRRL
YNFMKKWYQTALFVSQKRSGHEELTAEAAGGYAVGHIVDGTMVLAKELIDSSFKAKMYKKEIGEIVRLFRIDGCRMCGHD
TKTRFLEITETGLVVIKEPIS
>OMNI|GAZORF0641/38-296
IYGVSTGIEGLDDLFFIVTS--ENGKIVKKTLGGIPAYSVMNITGVSDTGKSLMVEQFTVHQASKGNKVAFITVESPANF
VVASLKLRASAMGLNFDDFQDNIILIDAASSTKIRENVPDLLATLAYVIQQYKVKFTVIDSVTGLFENKEMMARAIVRRL
FNFMKKWYQTALFVSQKRSGHEELTAEAAGGYAVGHIVDGTMVLAKELIDSPFKAKMYKKEIGDIVRLFRIDGCRMSGHD
TKTHFLEITETGLVKIKQPIG
>OMNI|NTL01AA00153/35-293
LEGVPTGVEGLDELFFKSEI--REGKVVKVPLGGIPRYSVTNITGVSDTGKSLMVEQYTVKQAERGEPVAFITVESPAPF
VTMGLRERATAMGVDFDKIKDKIILIDAASHATLRENIPNLLATLAHVIKTYKVKHTIIDSVTGLYEAKEMLARTIVRQL
FNFMKKWYQTALFVSQKRSSHEELSAEAAGGFAISHIVDCTMVLAKELIMTKYQAQIYKKEIGDIVRLFRIDGCRLCGHD
TKTHFMEITETGLVKIGPPLR
>OMNI|GDTORF1591/13-271
IRGVPTGIEGLDNLFFTTKI--EKGKTKVVPLGGIPQYSVFNLTGISDTGKSLMGEQFAIKQASLGNAVAFITVESPAHF
VATSMKSRAAAMGVEENVIDENIVFIDAASYSKLREDVPTLLATLAHAIKKYKIKYTVIDSITGLYEAKEMMARVIVRQL
FNFMKKWYQTAIFISQKRSSQEEFSAEAAGGFAISHIVDGTMVLSKVLISSQYMERMYKRPMGELVRLFRIDGCRMCGHS
TDTYLLEIDKNGLVRIGQSLK
>OMNI|GTRORFA0619/25-283
LEGVPTGVPGLDELFFVTEW--REGKAVRRVLGGIPRYAVLQVTGVSDTGKSLMVEQFAVERARRGEPCIFLTTEAPGPF
VAGSLQLRAQAMGVPREAIDRAIILIDAATHTSLTHDLGTLLSTLAFAIRTYHAQAVVIDSLTGFYEAREMQAREIVRPL
YLFLKKWHQTALAVSQKRSGHELLTAEAAGGFAVGHILDGSLVLAKQPVLSYQQAKLYRTPIGETVRLFRIDGCRMSGHD
TATHLLEITPEGLVRIGPRLS
>OMNI|NTL01TT0922/24-281
LFGIPSGIPGLDELFYTAEI--EEGEIVRVPLQGLPSASVIHLAGVPDTGKTLMGQQFAITQAARGYNVLFVTVEVPAVF
TVQGLKQRCKGLGIEWGKIENSIYLLDLSHQTELKSSVDELTTKLGDIIREKNIKACVIDSITGLYEGQEMVARKLVRRL
YEVMKDNYQTAIFISQKRSSHEELSSEAAGGYAVSHILDCNIVLAK-IVASRTTASSYGVSPGEVVRTIRIDGCRMCGHD
TRVHILHIDDLGIVKVGKALS