HMM Seed Alignment: TIGR03808

Download Alignment

>OMNI|NTL03RP3544/1-451
MTLDRRRLIGLTAG....ALALSAAPLAAQPLTSQRGRDATQAGLRPDSSDDQTAALQRAIDSAARARVPLALPPGHYRT
GPLRLPSGAQLSGVRGATRLVFTGG.VSLFDSAGAETPTLSGLVLDGGAIPLPARRGLVHCVGARDLRITDCEITASGGC
GVWLETTSGMISDNTLTAIAVTGVVSFDAKGLSVTRNTIIGANSNGVEILRTSIGDDGTLVTGNRIENIKAGPGGSGQYG
NAINAFRAGNVIVSGNRIRNCDYSAVRGNSASNIHITDNSVSDVREVALYSEFAFEGAVISGNTVDGAALGVSVCNFNEG
GRLSVVQGNIIRNLKPKRPIGTAPDDDAGIGIYVEADTAVTGNVIENAPSFGIVAGWGKYLRDVAITGNVVRRAFIGIGV
SVMDGAGTAAINGNVIAEAPRGAVVGLDHARPVTPDLTAPGAAKFAQIALGSNSVR
>OMNI|NTL01BJ3046/1-455
MDLNRRHLIGASTAGIAGALAMPADAARAAPLTSLLGRDATQYGVRPGSSEDQTRGLQRAIDEAARAQMPLALPPGVYRS
GLLRLPNGTQLIGVRGATKFVFTGG.PSAIQSDGADAIGLSGITFDGGGIPLPTRRGLIHVLGGRDVRITDCEITGSGGS
GIWLEQISGDISGNIFTSIAVTAVVSFDAKGLSVARNTIIGTNDNGIEILRSAIGDDGTLVADNRIEDIKAGPGGSGQYG
NAINAFRAGNVIVRGNRIKNCDYSAVRGNSASNIHITGNSVSDVREVALYSEFAFEAAVIANNIVDGAAVGVSVCNFNEG
GRIAVVQGNIIRNLIPKRPIGTAPDDDAGVGIYIEADTSVTGNVIENVPSYGIVAGWGKYLRDVAITGNVIRKALAGIGV
SVVPGAGTALVNNNMISETPRGAVVGLDHARAVTADLSADGAQRFAQVVVGGNAVR
>OMNI|NTL05BS2517/1-456
MDVNRRRILAGSAAGAAGALALPTVAAEGAPLISTLGRDATQYGVKPNSPDDQTRALQRAIDEATRAQAPLALPPGVYRS
SMLRLSKGSKLIGVRGATRLVFTGGAPSLLSAEGADGADVTAVSLDGGGIALPQRRGLLHVAAGNDVRIIDCEITRSGGS
GIWLEQVSGDVSGNVIIDIAVTAIVSFDALGLIVSRNTIKGTRDNGIEILRTAIGDDGTMVLDNHIEDIKAGPGGSGQYG
NAINAFRAGNVIVRGNRIRNCDYSAVRGNSASNIQIVGNSVTDVREVALYSEFAFEGAVISGNTVDGAAFGVSVCNFNEG
GRIAVVQGNIIRNLIPKRPIGTAPDDDAGIGIYVEADSSVTGNVVENAPSYGIVAGWGRYLRDVVISGNVVRNALAGIGV
SVVQGAGTALVSNNLISGTPRGAVIGLDHIKPVTSDLTQDGAQRFAQLTMAGNAVR
>OMNI|NTL01NH2646/1-455
MDIRRRHILGASAAGVAGALAMPSGAARAAPLTSTLGRDATHYGVRPNSPDDQTRALQRAIDEAARANAPLALPPGVYRT
GALQLTKGSQLIGVRGATTLMFSGG.ASLLSTEGADHIGLSNLTLDGGGIPLPERRGLIHCRGGRDVRILDCEITGSGRD
GIRLENVAGEISGNVIVQTASTAIVSFDALGLTVARNTILDASDNGIEILRTAIGDDGSIVTGNRIEHIKAGPGGSGQYG
NAINAFRAGNVIISGNRISDCDYSAVRGNSASNIQITGNSVSGVREVALYSEFAFEGAVIANNTVDGAAVGVSVCNFNEG
GRIAVVQGNIIRNLLPKRPIGTAPDDDAGIGIYVEADTAVTGNVIENAPSFGMIAGWGKYLRDVAITGNVIRKSFIGIGV
SVVDGAGTALVNTNVISDTPRGAVVGLDHAKPVTPDLAAHGAAKYAQVAIGANAVR
>OMNI|NTL04RP1748/1-454
MPLSRRHLLNA.AAFAAGALALPSKPARAAPLTSSLGRDASQYGVRPNSPDDQTRALQRAIDDAARAQTPLALPPGVYRT
GPLMLPNGAQLIGVRGATRLLFNGG.RSLLESQGGNAVELSGLTLDGAQIKLPQRRGLVHCQQGRELRITQCTIANSGGN
GIWLDNIAGDISDNGFSNIATTGIVSFDAQGLIVARNSILGTNDNGIEILRSALGDDGTQVLDNRIEDIKAGPGGSGQYG
NAINAFRAGNVVVRGNRIKNCDYSAVRGNSASNIQITGNSVSNVREVALYSEFAFEGAVIANNTVNGAAVGVSVCNFNEG
GRLSVVQGNLIRNLTPKRPIGTAPDDDAGIGIYVEADTAVTGNVVENAPSFGIVAGWGRYLRDVAISGNVIRNAFVGIGV
SVADGAGTALVGNNVISETPRGAVVGLDHARPVTPDLAAPGAAKFAQVVMGINAAR
>OMNI|NTL02OC2610/1-453
MNLTRRRFVNSFSLS.AAVLTLESARAIAAPAVTPLGRDAGQLGVKHNSPDDQTIPLQRAIYATAAARTPLVLRPGIYRT
GELDLPSGAQIIGARGATRIEFTGG.TALLTAKGADGLVLTGLTLDGGGADLPQRRGLISLQACRDIHIADCDILGSRRN
AIWLETCSGDIRNTTIRQTVATAIVSVDALGLLIAQNVIQDASENGIEILRSAPGDDGTIVTDNRIENIKAGPGGSGQYG
NGINAYRAGNVIVRGNRIRNCDFSGIRGNSASNIQIIANNVTDVREVALYSEFAFEGAIIANNVVDGCTTGVSVANFNEG
GRLAIVQGNIIRNTRAKRDPGSD.IETGGHGIYVEADTTVTGNVVENAPVCGIVVGWGQYLRDVNVSDNVIRNAFVGIGI
SAMDGTGKTLVTGNLISNAPRGAIVGYDHYKPITGDLAVIGASEFPKIVLGLNTVQ