HMM Seed Alignment: TIGR03741

Download Alignment

>RF|YP_985861.1/3-107
MFEELFALACSATLTMTVSVDEQSD-RLTVNVIPKP------RQDAGE---PGLTQPLSLTATPQEFDVGFI----EALR
GYREVRQSLAQQAEATKEVIE--AAKAALVKKASDATVKAG
>RF|YP_001585552.1/1-101
MFQALEPLLRSAE-KLVLSLSMDGD-NIVVFLTP---------AGGKD---AMLRQPLILKATAAELDEGFA----SAIG
SFTTAHQSLGEQVAATNAILE--AQQQTQVKKAQKVLSKAS
>RF|NP_942946.1/1-103
MFTELVPLVRASD-KVVVTLSMHGD-VMSVVVLPVI------KNAAD----AALTSPLVLSATPADLDAEFA----AAVT
SVSESHRSLAEQAEATKSILD--AAKSTQSSNATKALAKAA
>RF|YP_195326.1/1-103
MFETLKSFLASNT--ATLMLTSEGD-QITVTVIPKP------KTEGAD---ASLKTPLVISGTAAELDEGFA----QVLA
GYVSAHKSLAEQLAETQAVLD--RAKRESAAKAVKGAPKAA
>RF|YP_899662.1/1-103
MFSAIHRLATQAD--LALNISASGD-SLRVVVIPKP------KSGETH---SALITPLILEATPEELNEQFA----GILV
QYSSKRKSLVETLEETTAYLD--AAMKEAKDKATKAATEKP
>RF|YP_552094.1/1-103
MLKAIERLALQCN-VVNILVKANAG-ELSLTFVPTL------KEGGD----PALAKPFTLHGTVEDLEAKLP----EAMA
QIACARASLAEQVEATTAVLE--IARKTSADKGSNALKGKP
>RF|NP_519783.1/1-101
MFAELHQLAQAAP--LLVSITAEGD-ALRVTTSSTS------TKNG-----GLL--PMVLIGTPDELDRDFA----AAVQ
IYEPSALSILQQAQAAATANSAAGKTKAIANEPPKASSKNA
>RF|YP_516094.1/2-109
FFKTIHRELSSRLASVGMAMTFPGENKVCLIITPTL------KAEIAEKA-PHLSAPFVLTGTPDDLDAGFV----DQFK
AYSEVHTSLQQQVTDQIKALQ--EQSEAKAAKAKEDSAKKM
>RF|YP_551824.1/3-107
LFTKFAPLVQAGV-VVHLTMRQVGK-EMQLEILPVC------DAGKT----GITVPPRAFLATPAELDEKIP----GFLD
TYVSAAVSINDQIAVTVAVMDKAQEDAREATKKAQLAKSTT
>RF|YP_001260073.1/2-114
LISSLLPMLARYS--LGFDLVAGANDTVTLTILPRK------AEGAKDNLEASETRPISITATAAEIDAELARGPDGALG
QLIASRRTLADQIAEQRQAAEAARAAAAEAAKAKAAAPKTP
>RF|YP_001298831.1/2-106
FFQAINQMITAGT-DLSINIRRVNN-NLTVAVVPR-------RSGVKD---GERIVPLILNGTPEELDAGFL----QAVG
TPVQKAQGILTNLEAFEKQAEQAASQSKAARSAAEKESKEV
>RF|YP_001202201.1/4-109
FLQSVGAVLTTGL-KATVELHGLGDGKIKLLYTPDIGPTPEKSSEAVVQLRSAIAKPMVVSGTPEEIEEAFA--------
------ELITSKAAVVRRGLSALDEIERLATKAVDEAKSKP