HMM Seed Alignment: TIGR03704

Download Alignment

>OMNI|NTL01NF3439/8-262
VVARLRAAGCVFAEEEAALLTDAAAETGTPLAELVRQRVSGTPLEYVVGWAEFRGLRVAVRPGVFVPRRRTAFLVDTALA
VARERPGTL--CVVDLCCGCGALGLAFATEMRAHGRTVELTAADVDPTAVCCARGNLAGHGT--VHEGDLFDALPTDLRG
RIDILLANVPYVPTAGIAGMPPEARDHEPRAALDGGADGLDVFRRVAAAAPDWLAPGGTVFFESSREQATAASDFLRARG
LRAARAESDERYATVVTGT
>OMNI|NTL05RS4192/13-259
LVTRLRAAGCVFAEDEARLIVS-AARTSDELASMLDRRVAGVPLEHVLGWAEFCGLRIAVDPRVFVPRRRTAFLVEQAAA
LAGPHA-----VVADLCCGSGAVGAALAETGDG----IELYAVDIDPAAVRCARRNVPDPG--RVFEGDLYEPLPTALRG
GIDVLVANAPYVPTDAIRLMPPEARFHEPRVSLDGGADGLDIQRRMTLGARDWLAPGGHLLIETSAGQAPLTAEAFADAG
LITRVETSDEMDATVVVGA
>OMNI|NTL01FS0236/65-315
VVTRLRAAGCVFAEDEARLLVN-AARTPGELAAMVRRRVAGLPLEHVLGWAEFHGLRIAVDPGVFVPRRRTEFLVDQAVE
RVAGRSRPV--TVVDLCCGSGAMGVALVAALPG----IEVHAADIEPAAVRCARRNLASAGGQ-VYDGDLYEPLPAVLRG
HVDLLAANAPYVPTDAIELMPPEAREHEPRVALDGGADGLDVLRRVAAEAPRWLAPGGHLLVETGERQAASIVEASAQAG
LIPTVASSADLNATVVIAT
>OMNI|NTL06SA1294/14-261
VVAALRSAGCVFAEDEAELILS-TARTPGEIATMVERRAAGLPLEHVLGWAGFHGLRITVDPGVFVPRRRTEFLVDLAVS
LAREVS-----VVVDLCCGSGAVAAALAASLDG----PELHAADIDPAAVRCARRNLAACGGH-VHEGDLFTALPGHLRG
RVDILAANVPYVPTDEVGLLPPEARDHEPLVALDGGSDGLDILRRVTAEASRWLSPGGSLLVETSERQASLAVETFTRGG
LDARLAVSEELCANVVIGT
>OMNI|NTL02SC6763/31-278
VMAALRAAGCVFAEDEAALILT-TARTAADLTALVGRRVGGLPLELVLGWAEFRGLRIAVAPGVFVPRRRTEFLVSEALA
HAPHAN-----VVVDLCCGSGAVGAALAAALDR----PEVHAADVDPAAVRCARGNLADAGGR-VYAGDLFDALPDALRG
RVDILAANVPYVPTGEVALLPAEARDHEPLVALDGGTDGLDVLRRVAAAAPGWLAPGGCLLVETSERQAPDAVGAFTRAG
LATRLAVCEELYAHVVIGV
>OMNI|AAur_0281/40-292
IATTLRAAGCVFAEDEAQLLID-AAHHPEQLNRMVDQRLSGQPLEHIVGWADFCGKRMSVGPGVFVPRRRTEFLVREAAM
IAKPLTARRRAVVVDLCCGSGAIGAALNDLLGS----CELHAADIDPAAVQCARRNVEPRGGT-VHHGDLYGALPRELRG
KVDILLANAPYVPTESIGMMPPEARLHEPRVALDGGADGLDVQRRIALGAAQWLGPGGAVVMETSGQQALETARILGEAG
FIAEVASDEELEATVVIGS