HMM Seed Alignment: TIGR03657

Download Alignment

>NTL08SA1076_S.aureu/1-652
MNKQQKEFKSFYSIRKSSLGVASVAISTLLLLMSNGEAKA-AEETGVTNTEAQPKTEAVASPTTTTTEKAPEAKPVAKPV
ANAVSVSNKEVVAPTTETKEAKEVKAVKEVKAPKEAKEEKPAAKADNNTYPILNQELREAIKNPAIKDKDHSAPNSRPID
FEMKKKDGTQQFYHYASSVKPARVIFTDSKPEIELGLQSGQFWRKFEVYEGDKKLPIKLVSYDTVKDYAYIRFSVSNGTK
AVKIVSSTHFNNKEEKYDYTLMEFAQPIYNSADKFKTEEDYKAEKLLAPYKKAKTLERQVYELNKIQDKLPEKLKAEYKK
KLEETKKALDEQVKSAITEFQNVQPTNEKMTDLQDTKYVVYESVENNESMMDAFVKHPIKTGMLNGKKYMVMETTNDDYW
KDFMVEGQRVRTISKDAKNNTRTIIFPYVEGKTLYDAIVKVHVKTIDYDGQYHVRIVDKEAFTKANADKTNKKEQQDNSA
KKETTPAMPSKPTTPPVEKESQKQDSQKDDNKQSPSVEKENDASSESGKDKMPVTKPAKAEVESSSTTPTKVVSTTQNVA
KPTTASSETTKDVVQTSAGSSEAKDSAPLQKANIKNTNDGHTQSQNNKNTQENKAKSLPQTGEESNKDMTLPLMALIALS
SIVAFVLPRKRKN
>NTL11SA0993_S.aureu/1-629
MNKQQKEFKSFYSIRKSSLGVASVAISTLLLLMSNGEAQA-AEETGGTNTEAQPKTEAVASPS-TTTEKAPEA----KSV
ANAVSVSNKEVEAPTSETKEVK------------------PAAKSDNNTYPILNQELREAIKNPAIKDKDHSAPNSRPID
FEMKKENGEQQFYHYASSVKPARVIFTDSKPEIELGLQSGQFWRKFEVYEGDKKLPIKLVSYDTVKDYAYIRFSVSNGTK
AVKIVSSTHFNNKEEKYDYTLMEFAQPIYNSADKFKTEEDYKAEKLLAPYKKAKTLERQVYELNKIQDKLPEKLKAEYKK
KLEETKKALDEQVKSAITEFQNVQPTNEKMTDLQDTKYVVYESVENNESMMDTFVKHPIKTGMLNGKKYMVMETTNDDYW
KDFMVEGQRVRTISKDAKNNTRTIIFPYVEGKTLYDAIVKVHVKTIDYDGQYHVRIVDKEAFTKANADKTNKKEQQDNSA
KKETTPATPSKPTTPPVEKESQKQDSQKDDNKQSPSVEKENDASSESGKDKTPATKPAKGEVESSSTTPTKVVSTTQNAA
KPTTASSETTKDVVQTSAGSSEAKDSAPLQKANIKNTNDGHTQSENNKNTQENKAKSLPQTGEESNKDMTLPLMSLLALS
SIIAFVLPRKRKN
>NTL09SA1065_S.aureu/1-645
MNKQQKEFKSFYSIRKSSLGVASVAISTLLLLMSNGEAQAAAEETGGTNTEAQPKTEAVASPT-TTSEKAPET----KPV
ANAVSVSNKEVEAPTSETKEAKE---VKEVKAPKETKEVKPAAKATNNTYPILNQELREAIKNPAIKDKDHSAPNSRPID
FEMKKKDGTQQFYHYASSVKPARVIFTDSKPEIELGLQSGQFWRKFEVYEGDKKLPIKLVSYDTVKDYAYIRFSVSNGTK
AVKIVSSTHFNNKEEKYDYTLMEFAQPIYNSADKFKTEEDYKAEKLLAPYKKAKTLERQVYELNKIQDKLPEKLKAEYKK
KLEDTKKALDEQVKSAITEFQKVQPTNEKMTDLQDTKYVVYESVENNESMMDTFVKHPIKTGMLNGKKYMVMETTNDDYW
KDFMVEGQRVRTISKDAKNNTRTIIFPYVEGKTLYDAIVKVHVKTIDYDGQYHVRIVDKEAFTKANTDKSNKKEQQDNSA
KKEATPATPSKPTPSPVEKESQKQDSQKDDNKQLPSVEKENDASSESGKDKTPATKPTKGEVESSSTTPTKVVSTTQNVA
KPTTASSKTTKDVVQTSAGSSEAKDSAPLQKANIKNTNDGHTQSQNNKNTQENKAKSLPQTGEESNKDMTLPLMALLALS
SIVAFVLPRKRKN
>NTL02SA1119_S.aureu/1-645
MNKQQKEFKSFYSIRKSSLGVASVAISTLLLLMSNGEAQAAAEETGGTNTEAQPKTEAVASPT-TTSEKAPET----KPV
ANAVSVSNKEVEAPTSETKEAKE---VKEVKAPKETKAVKPAAKATNNTYPILNQELREAIKNPAIKDKDHSAPNSRPID
FEMKKENGEQQFYHYASSVKPARVIFTDSKPEIELGLQSGQFWRKFEVYEGDKKLPIKLVSYDTVKDYAYIRFSVSNGTK
AVKIVSSTHFNNKEEKYDYTLMEFAQPIYNSADKFKTEEDYKAEKLLAPYKKAKTLERQVYELNKIQDKLPEKLKAEYKK
KLEDTKKALDEQVKSAITEFQNVQPTNEKMTDLQDTKYVVYESVENNESMMDTFVKHPIKTGMLNGKKYMVMETTNDDYW
KDFMVEGQRVRTISKDAKNNTRTIIFPYVEGKTLYDAIVKVHVKTIDYDGQYHVRIVDKEAFTKANTDKSNKKEQQDNSA
KKEATPATPSKPTPSPVEKESQKQDSQKDDNKQLPSVEKENDASSESGKDKTPATKPTKGEVESSSTTPTKVVSTTQNVA
KPTTASSKTTKDVVQTSAGSSEAKDSAPLQKANIKNTNDGHTQSQNNKNTQENKAKSLPQTGEESNKDMTLPLMALLALS
SIVAFVLPRKRKN