HMM Seed Alignment: TIGR03444

Download Alignment

>OMNI|NTL01FA6680/83-498
ETSAGPEPSVGIGTSVGIETEWFVVD-------TRVVHQPVPPERTRR-ALGRISGLITGAAGPVLPGGSRLTFEPGGQL
ELSGPPA-GLAAAVQSTAADLHLVRAALAEDGLAIVGMGVDPLRAGVRQTTASRYAAMEEHF-RTGGGTSGEVMMRSTAS
VQVNLDLGTT---PAQ-AAERFRLAHAVGPVLTAMFAASPALAGRRTG-WRSTRQAVWSGIDAGRTGSVLDLPAQPAAGG
DAGPGAAAARSGDLADRWARYLLAAKLMMIGDPLGDVGPG-EDRRFVAATGGHTFGDWVAG-RGPVE-RAPTLDDLSYHA
TTLFPPVRPRGWWELRYLDAQPA-EGWRVAVAVATALLDDPVAAAAAAQVCAPVARR-----------WPAAAMLGMADE
PLRLAAVRCLELAAAALRR-AGCADLADAVELFSERYPQRGRCPADE
>OMNI|NTL01FS4511/72-477
DTRGNGGPTVPGGC-VGIETEWLIVD-------TQAVHCLIPPARTLA-SLARIPGTTPGPGGPVLPGGSRITFEPGGQL
ELSGPPA-ELTAAVRASSADLNLVRSALAVDGLALVGMGVDPLRVGMRQTTASRYAAMEEHF-RTGGGASGTVMMYSTAS
VQVNLDLGGS---PAE-AARRFQLVHALGPVLTALFAASPAYAGRRTG-WRSTRQAVWDGIDASRT--------RPVAAA
LTAPGSGDTEP-DLVDLWARYLLDAKLMMVENPARAGNPE-DDHHFVPVRDDSTFGDWLAG-RGPVT-RPPTREDLSYHA
TTVFPPVRPRGWWELRYLDAQPG-DGWQAAVAMPTVLLDDPVAADGAFEACLAVAHR-----------WPAAAMLGMADE
PLRRAAVRCVDLAVSALRR-GGATDLAETVESFAGRYLDRGRCPADE
>OMNI|MT_3807/32-410
YIADGCLVDGPLGR-VGLEME---------------AHCFDPADPFRRPSWEEITEVLEWL--SPLPGGSVVSVEPGGAV
ELSGPPADGVLAAIGAMTRDQAVLRSALANAGLGLVFLGADPLRSPVRVNPGARYRAMEQFFAASHSGVPGAAMMTSTAA
IQVNLDAG-----PQEGWAERVRLAHALGPTMIAIAANSPMLGGRFSG-WQSTRQRVWGQMDSARC--------GPILGA
SGD---------HPGIDWAKYALKAPVMMVRSP--------DTQDTRAVTDYVPFTDWVDG-RVLLDGRRATVADLVYHL
TTLFPPVRPRQWLEIRYLDSVPD-EVWPAVVFTLVTLLDDPVAADLAVDAVEPVATA-----------WDTAARIGLADR
RLYLAANRCLAIAAR-----RVPTELIGAMQRLV-DHVDRGVCPADD
>OMNI|MSMEG_6250/26-401
HIGANSLQDGPIGR-VGLEIE---------------AHCFDLSNPTRRPSWDELSAVIADV--PPLPGGSRITVEPGGAV
ELSGPPYDGPLAAVAALQADRAVLRAEFARRNLGLVLLGTDPLRPTRRVNPGARYSAMEQFFTASGTAEAGAAMMTATAS
VQVNLDAG-----PRDGWAERVRLAHALGPTMIAITANSPMLGGQFTG-WCSTRQRVWGQLDSARC--------GPVLGV
DGD---------DPASEWARYALRAPVMLVNSP-----------DAVPVTNWVPFADWADG-RAVLGGRRPTEADLDYHL
TTLFPPVRPRRWLEIRYLDSVPD-ALWPAAVFTLTTLLDDPVAAESAAEATRPVATA-----------WDRAARMGLTDR
HLHTAALTCVRLAAE-----RAPAELEESMTLLM-RSVQQRRSPADD
>OMNI|NTL04MS4882/27-402
HITEHCLHDGPVGQ-VGLEVE---------------AHSFDLADPRRRPDWGEVTDAIAGV--GALPGGSRITVEPGGAV
ELSGPPADGSVAAIAAMTSDRAVLRTAFAQRGLGLVLVGADPLRRPRRVNPGGRYSAMEAFFTASGTGAAGAFMMTSTAS
IQLNLDAG-----PRRGWADRVRLAHALGPTMIAATANSPLLAGRFSG-WQSSRQWVWGELDEARC--------GPVLGA
SGD---------DPASDWARYALRAPVMLVHNP-----------EPVPVTDWVPFAEWADG-QTLLGGRRPTRSDLEYHL
TTLFPPVRPRRWLEIRYLDAVSD-ALWPAVAFTLTTLLDDPAAADIAAEATESVATA-----------WDRAARIGLGDR
RLHAAALRCVETAAE-----RAPAAVMESMQQLV-RSVEEGRSPADD
>OMNI|NTL02SC0848/23-414
LVRGICFKTGPPRL-LGVEVEWL-------------VH--ELRAPRLPVSPERLQAVYTAL--RAVPLRSALTVEPGGQL
ELSSLPAASLTECVRSVSADLEAVRAVLREDGLALVGLGHDPWHPPRRYLRQPRYDAMESCLDRTGPG--GRFMMCASAS
VQVCVDAGHEEPGPLG-HVRRWWLAHHLGAVLLAAFANSPLSGGRPTG-WRSTRQLRWTQIGAGRAG-------GPPLDS
------------DPRGTWARHVLDAPVMCVR----------RDGGPWDVPEGLTLREWSRE-LVP---RPPTREDLDYHL
TTLFPPVRPRGHLELRMIDAQPGDDGWIVPLAVTAALFDDPEATETAYRAVKPLAERTLGLPAPHNPLYEDAARDALTDP
ELREAAVTCFTAALAALPRLGASTEVTDAVAAYRERYVLRGRCPADD
>OMNI|NTL01NF4897/28-432
FVGGVCFKLGPPAL-IGAELEWLTVQGGPSASATVAAPRPQLSALAAALGPHAPRSIAPDSPALPLPGGSRITVEPGGQI
ELSSAPYAEAAELCARLREDAIVLREMLAAAAIRPLALAADADRRAKRLLRSPRYRAMEQSF--AGIGPFGKLMMCNTAA
TQVSVDAGTD---PAE-VRARWTALYTMGPALVAAFACSPALRGAPPGRWASQRMRTWLRLDTLRT--------RPPVAD
WA----------DPITGYARWALDVPLLCVRSVDGTTTCAGDPGENWTAPPGATFADWMAGALDDEIGRRPDPADLAYHL
TTLFPPVRPSGHLEVRYLDAQPG-EDWTVPIHTFDALLAHPAVVAEATALAAPLADQ-----------WSQAARCGLADG
VVRTVAAELLDLAAA-----HARTPEAGAELDRAARRCRAGRTPTEE
>OMNI|NTL05RS5647/22-403
YLGGVCFKLGPPQL-IGAELEWLTAQ-------LPEYVRPDLAALAEALGPHTPRTIDPTSPAQPLPGGSAVTVEPGGQI
ELSSAPYYSARELCDYLAADQAVLTDLLSSRSILMSSEAADTRRPAQRLLQSPRYCAMESRF--TGIGPFGKLMMCNTAA
TQISVDAGAD---PVA-VEKRWHLLHAIGPALIAAFACSPRLYGVPDGQWASQRMRTWLELDSPRTIG------TPHVAD
-----------------YAGWVLDVPLLCIR----------NDGTDWTAPDGATFADWVEGALDDVIGR-PTPADLDYHL
TTLFPPVRAAGHLEVRYLDAQPG-DQWRVPIAAIDALLSGPGAMAEALDAALPTAER-----------WRDAAEFGLAEL
ELRAAATALLSLAAA-----YSPDPEFVRLLDAAAERCCRGQAPSEE