HMM Seed Alignment: TIGR03327

Download Alignment

>OMNI|NTL01NP1969/2-500
ELTVEPIDIGTERPVVLLNCADAETLGVHSLDRVEIDW--DGTTEVGIVKVTDELVAAGRIGASHGFPE---ITDGTVVA
VTPAGQPESVESIRRKLDGRELDSDELGAIVADIEADRLSDLELSAYVCASHANGLSLEETKQLTERMAEVGKQLSWEQP
VVADKHSIGGVAGNRVTPVVVAIVAAAGLTIPKTSSRAVTSPAGTADTMEVFCPVEFSREEIRDIVTETGGCLVWGGAVD
LSPVDDKVIRAQRPLSLDPPGQVIASVLSKKQSAGSSHIVVDIPYGAGAKVTSLSEARDLADDFRRVGDHLGLTIECALT
RGSDPIGHGIGPVLEARDVLAVLEG-EG-PEPLRIKSLRLADIIFDMAREAGMPVDDRSAADILDSGAALSKFRDIVAVQ
GGDPDVSRDDLQPGDRTETVTADTDGLVVDVDNQAVSQLARRAGAPNDHGAGVVIHRRTGDKAVAGDVLYTIHAESSDRL
EAAREYAAGDEIVRVGGRDEALVERR
>OMNI|NTL01TK0352/2-500
KAKIRILDMFSGRYTVLINEEDAKEAKLHPDDLVKIEA--GKKAVYGSVAL-SNLVGKGEVGISRDVLDLHNFSEGETVS
VIPAGTPESVRYIKKKMHGEKLRKVEIEAIVRDIVDRKLRDIEISSFVTALEINGLDMDEIAALTIAMAETGDMLDIDRK
PIMDVHSIGGVPGNKTNILVVPIVAAAGLTIPKTSSRAITSAAGTADVVEVFADVSFSLDEIKRIVEKVGACLVWGGALN
LAPADDITIKAERALSIDPTGLMLASIMSKKYAMGSQYVLIDIPTGKGVKVETVEEARSLARDFIELGKRLGQYVEVAIT
YGGQPIGHTVGPALEAREALSALMTGKG-PGSLIEKATGLAGILLEMGGVAPAGTGKKMAKEILESGKAWEKMKEIIEAQ
GGDPNIKPEEIPIGDKTYTFTAATSGYVTAIDNRAITAIARAAGAPEDKGAGIELYVKVGEKVKEGDPLFTIHAEHEARL
DQAIVLARRTEPIRIEG---MVLQRI
>OMNI|NTL01PH01642/2-500
RAKVKILKIKTGSFNVFISPRDAEEWKLHPNDLVKIES--GKRSIYASVAI-GDFIEDGEVGLSQDILSSYQFSEGEVVS
ITPSGTPESVKYIKKKMKGEKLRKVEIETIIRDIVDRKLRNTEISAFITAIEINGLSMDEIAALTIAMAETGDMLDIDRK
PIMDVHSIGGVPGNKTNILVVPIVAAAGLTIPKTSSRAITSAAGTADVVEVLTNVKLSLDEIKRIVEKIGACLVWGGALN
LAPADDLTIHVERRLSLDPRGLMLASIMSKKYAIGSQYILIDIPTGKGAKVETMDEARTLAKDFIELGKKLGQYVEVAIT
YGGQPIGYAIGPALEAKEALETLMTGKG-PGSLVEKATGLAGILLEMGGVAPKGMGKKVAKEILESGKAYEKMKEIIEEQ
GGDPNIKPEDIPIGDKTYTIHAQTGGYVTGIDNRAITAIAREAGAPEDKGAGVRLHVKVGEKVKEGDPLITIHAESESRL
EKAIVLARRLEPIKIEG---MVLQVI
>OMNI|NTL04MM0327/3-502
FLNAKFIDLDLGENAVIVNEDDLKGTSYYPQDRVLIES--HAGSVIGNIYSTKTMVQKGEVGMLVSELAEISISEGEEVK
LRHAEKPESIPFIKKKMDGQVLNPHEIRTIIDEIVSKKLSNIELSAFVSSTYINGMNMDEIGEMTKRIAETGDMISWEKN
LVVDIHSIGGVPGNKYALLSIPILAAAGITIPKTSSRAITSPAGTADVMEVLTNVELKEDEIKRIVKTTNGCLVWGGGVN
LAPADDIIINVERPVSIDPQPQLLASVMAKKIATGIKYSVIDIPVGKGVKIKNEAEGAKLARKFIELGELLNIKVECVLT
YGGQPLGRAIGPALEAKEAIEALQDPKNAPKSLIEKALSLAGILLELGGAAQIGEGQNLAWEILESGRALEKFNQIIIEQ
GGTP-KKPEEIELGDYIEEIIAPIDGYVTDINNTGITNVVKEAGAPRDKKAGLLLNSKIGNKVKKGDVLYTIYSGSEERL
VSAVNLARRVYPVKVEG---MLIERI
>OMNI|MJ_0667/3-500
FLKVRVLDIDL-ENLVLINSEDLKSSQYFPQDRVVVEF--KGKEVIGILHSSTTLINRGEIGLPQKVVKELGVKEGDIVT
IKHAEKPKSLPYIRKKMDGNKLKKEEIFEIIDEMVDGKLTNIEISAFVTSLYINGMDMDEIEAMTIRMAETGEMVNWEGH
-IFDVHSIGGVPGNKYALLVVPIVASAGLKIPKTSSRAITSAAGTADVVEVLTRVDLTIEEIKRVVKETNGCMVWGGALD
LAPADDITINVERPLGIDPEPLLLSSVMAKKLAMGVNKLLIDIPTGYGAKVKSIKEASSLARKFIELSDRLRIVTECAIT
YGGQPIGRAIGPALEAKEALLALEDYTQAPTSLVEKSISLAGILLEMGGVAPTGEGKELAEDLLARGKAHDKFMEIIVAQ
GGKE-VSSDEIEVGKYKADIHSPIDGYVTRISNAGITKIAKEAGAPNDKKAGIYLNVKVGNKVEKGDVLYTIYSDSEERL
KSAIKLARILYPIKVEG---MLLQKI
>OMNI|NTL06MH2262/2-501
RLTVRLVDIAA--RGILLHHNDAKSLGVLAGDRIVISSPVTGKATVDYVETTGTLIDQGRIGVYHHTNEQLTLTENEVVE
VRVADRPVSLDYIKKKMEGEKLTREDIRAIVADIVQDTLSPSEITAFVVSSYINQLDMDEIESLTRAMVETGDQLSFHAG
PIVDKHSIGGVPGNKISLIVVPIIAASGLLIPKTSSRAITGAGGTADLMEVLAPVEFSASEVQEMTIKTGGVIVWGGATN
IAPADDKIIIQEYPFKIDQIGQMIASVMAKKFAVGADVVAIDIPVGKYCKVHTIEEGKKLARQFIDLGERLNMRVECALT
YGDAPVGRAIGPKLEIKEALSVLEGSDS-PRSLIQKSCVIAGIALELAGKANRGEGANLALEILRSGKALKKFLDIIAVQ
GGTPDVSSEKITVGEHFYTVRADSTGYVIDLNNHSLITIARTAGAPADHGAGLYLHAKHGTSLSKGDPIFTIYADRKWRL
EKAIEEARRLRPVMVEG---MLIDRV
>OMNI|NTL01MM0087/3-500
QLKLEHYNIKIGQHKVLLNIVDAKELGVNPGDRVRIR---GHQSLSAIVDTTDDMVPPGTLGVFTEVYEHF-EDWDKPVE
VVPSFRSKSAAVIKKMLDKKPVVQDEIKMLVSDIVDENLSDVELSAFITASYIHGMTDDEVEWLTRAMIDTGDTIEFDTH
PIMDKHSIGGVPGNKISLLIVPIVAANGLLIPKTSSRAITGAGGTADLMEVLSPVEFSSQEVKEITEKVGGALVWGGATN
IAPADDKLIKIEYPLSIDPYYQMLASIMAKKGAIGADNVVMDIPVGPGTKVPTVQEGQKLARDLINLGHRLGMNVECAIT
YGSSPIGRRVGPSLEVKEAMKVLESMEG-PNSLIEKSAALAGILLEMGGAAPRDQGKELALETLRSGKALEKMKQIIEAQ
GGDPNIKSDDIQTGQYTADIFASTDGYVMEFDNKWIIEIARLAGAPNDKGAGVAIHKKRGEQVKKGDPILTIYAEKEIKL
DNALATAQRTNPIIVEG---MLLRRI
>OMNI|NTL03MB0254/2-500
QLKVQPIDVKVGKYKVILNTIDAKELGVHEGDRVRIK---NHVTLTAIVDFTEDMISPGMIGLYHEVKEALSKEWTETVE
VFPAEKPKSTYIIRKTMDGQKLTKEEIDILVKDIVEENLAEIEIAAFLTATYINDMTDDETEWLTRAMIDSGDKLEFDTH
PIMDKHSIGGVPGNKISLLIVPIVAANGLLIPKTSSRAITGAGGTADLMEILAPVEFDAAEIKRMTEEVGGVLVWGGATN
IAPADDKLIKVEYPLSIDPHCQMLASIMAKKGAIGADHVVMDIPTGPGTKIKNVQEGRKLARDLINLGDRLGMDVDCALT
YGASPVGRTIGPALEVIEALKVLESFEG-PNSLIEKSASLAGMLLEMGNVAGKDKGYDLAIETLKNGKALTKFKEIIKIQ
GGNPDVTHKDISVGEFTEDIIAPNNGYILEMDNKRLVQIARLAGAPNDKGAGILLHRKQGEPLKEGDPVMTIYAEKKSKL
ENAVKSAKERPPFIVEG---MMLERI
>OMNI|AF_1341/2-499
IFKAVRVPFKSGRFAVILNEEDASELGVREGDRVRVRY--GKAGVVATVQITREIVEKGFVGLTDLASMELGISDGAEVD
VFPSPKPKSVELIKKKTRGEKLSQDEIRRIVEDITNNALSEVELTAFVISSMLRGMDFDEIEWLTRSMIETGERIEFDRG
TVVDKHSIGGVPGNKISLLIVPTVAAAGLLIPKTASRAITSASGTADTMEVLANVNLSVDEIKEITERVGGVIAWGGATN
IAPADDKIIRVEHPLSIDPRPQLLASVMAKKGSVGAKHVVIDIPVGEGAKIEKVEVGRSLANDFIELGRRLGLNVMAAIT
YGGQPVGRAIGPALEAREALKTMEDRRG-PSSLVEKSLGIAGILFEMTGIAT--NGYQHARKIFESGKTLEKFREIVAAQ
GGDESVKAEDVAVGDKTYTLTSQVEGAVVSVNNKSIVKIARTAGAPKDKGAGVYVHKKRGEVVKVGDPLLTIYAEKEWKL
DNAIEVANTERPIVVSG---MVLEVY