HMM Seed Alignment: TIGR03292
Download Alignment>ORF11555|gbm/16-205
GFADPVQAT---QRVFRTLLDAMARPGTPGRIEPIGANGSDAAPA-MRVAPAAFASLLTLCDASTPV-------FLG---
APDAALASAL--RFHTGAPIAAEPRAACFAYLDDANALP----PLQCFASGAPQTPEHAVTLFVRVASLA----------
---------DGE---PRTLRGPGI-----RDARTIAPAGLPDAFWRERAQFAPRFPCGIDCYLVC-GDMLIGLPRTTI
>ORFQ00868|ntre01/19-203
GFDNPVEDA---QQVFRATLDAMARPGTVQQLPA-----SSGVPE--GLSPAQAALLLTLADADTPV-------WLPAD-
-VPAAVRSFL--RFHCGCPLVDDVRTATFVCVPAGHAQP----ALADCAQGEPAYPDRSATLIVELESLA----------
---------AGE---LLTLRGPGI-----ETTQTVRVTGLPAGFRTEWRDNHAVFPLGVDLLLTS-GEQFCALARTTQ
>ORF00155|ntrf03/10-192
GLLDGVHDS---QQAFRAVLDALARPGQVRRI-------GPALPD-VALGGAMARLLLSLSDDETPV-------WWQR--
-ADAGLQHWL--RFHTGAGLAERPEAASFAVFTGIHQGF----ALSDFASGTAAAPEFSSTLLIELPGLA----------
---------DGP---ALEWRGPGI-----RDVQCVGLQGLPDDFWAQWQANHAAFPRGVDIVFTC-GEDALGLPRTTR
>ORF03338|ntds01/9-195
GFADPVHHS---QQWYRALLNAMSRPGTVCA--PCGEAMPQQVPA--PCSPAAAGVALTLLDHETPV-------WLQ---
QPESPLAHWL--QFHCGCPLTHRPEDAAFAVITDSNTVP----DWSRFATGTPEYPDRSATLIIQVQSAA----------
---------AAG---PVTLQGPGI-----QKEAHISVSGLADAFWTMHQANAALFPQGTDTILAA-PEGVLCLPRTVR
>ORFA00526|ntml02/23-208
GFADPVFDA---QAVFRASLLATAYPGRVVPVDR-----ALASPR--PFSSATAALCLTLMDFETLA-------WLDRQ-
AASGEAVAWL--RFHCGLPVTDDPMKARFAVVTDALTMP----RLVEFHPGDVEYPDRSMTLIIQVPSFN----------
---------EGP---ATTWTGPGI-----KTSARVSIGGLPFWYWSDWEMNRELYPRGIDVIFTN-GNALVGLPRTIA
>ORF00552|gsi/11-187
GFRDAPVDA---AHAFRAAMSAMARPGDIRRIA------GAEPPA--PLSVAAGTLLLTLCDPETRV-------HLAGA-
VDTDAVRQWL--SFHTGAPLV-DAAEADFAL-GSWADLM----PLSRYRIGTPEYPDRSAALIVECDALE----------
---------NTG----AVLSGPGI-----RDTARLS---LPD--VDTLKGNAILYPLGCDFFFTC-GDRVAALPRSTT
>ORF00294|ntat01/11-196
GFSSAVFDS---QRIFKKLMDGMARPGTPQTIE------TAVAPP-LPLAAATGAVLLALCDHDTPV-------WLNGA-
LRKTAVPGWI--GFHTGAPATEEKGAAHFAVIEAGSAIA----SFGLFAQGSQEYPDRSTTLIIELSDLD----------
---------GGR---ELLLSGPGI-----RHVNIISPSGLPDIFPMLWAENNAIFPRGVDVILTA-GDKFVCLPRTTR
>ORF17376|ntbj01/63-249
GFADKVLSA---QSTFRSVMDAMARPGSVQRIVP-----MAGTPG--PMMRGAAAIALTLFDHDTPL-------WLDARM
SESSEVVKWL--KFHTGAPVIQDSSIASFALISDGALLP----ALERFALGTSEYPDRSTTLILQVDSLD----------
---------AGR---GFELRGPGI-----DGVATLRASIKPADLFERLRVNEALFPRGIDVVLVA-DDAVVAIPRTTR
>ORF03339|ntns01/9-192
GLQDPIHDA---QRTFRGLLDAHARPGTPYQMSA-----EMSVPT--GLTPACGAACLTLLDLDVVV-------WLQPS-
-FHAQVRDWL--LFHSGCRFTEYPEEANFALIQDLAMLS----ELSIFNWGTAEKPEASTTLLVQVESFE----------
---------MGQ---PVMLTGPGI-----LDKRAIAPK-LPSHFWDFWMQNHQAYPQGVDVFLFT-ENAVMGLPRTAK
>ORF02352|ntcv01/4-186
GFSQPVEAA---QSIFRAVLSAMAEPLLPRALP-------ALPPALPGLKAATAALLYTLADQDVRV-------WLP---
ALPDDTVASL--RFHTGMRVTDRPEEADFIVIAAGSPLP----DLMRLKAGSAEYPDRSATLLLEADGFT----------
---------QQQ----VEGSGPGF-----AAPRRFGADGLPASFWREWQHNRARFPLGVDAVLIT-DTHIAGLPRSVR
>ORF03006|gphas/9-193
AFTDPVLDA---QRSFRIALKALSGPGMIQTLPT-----RHQPPALQGLDSATHALCLALLDLDTPL-------WLAPE-
FDTPAIRANI--AFHCGSPIVTDRSAARFALLDASTVG-----DLHGFDTGNDRYPDQSCTLLIQLPGLQ----------
---------GGQ---TLAWSGPGI-----EQQNSVALP-LDEAFWTER-EARNVFPCGLDVFFVS-GNQMLGLPRSTR
>ORF06230|ntec04/6-190
AFMLPVQDA---QHSFRRLLKAMSEPGVIVALH------QLKRGW-QPLNIATTSVLLTLADNDTPV-------WLAAP-
LSNDIVNQSL--RFHTNAPLVNQPKQATFAVTDEAISSE----QLNALSTGTAVAPEAGATLILQVTSLS----------
---------GGR---MLRLTGAGI-----AEERMIAPQ-LPKCILHELTERPHPFPLGIDLILTC-GERLLAIPRTTH
>ORF00514|ntec06/6-189
GFAHPVFGT---QLCFRKIVKAMSEPGSLVTVP--------NVSGLESMSSATAATLLTLTSHTTPL-------FIDPK-
IGNPLLLRTL--CLHTNVPITTTFQEADFVLLSGNRFSY----DLMALSCGSEVEPEKSTTVILEVEGMH----------
---------DGP---CLKLTGPGI-----KTHRIISPR-LPGSIRHYLCNRPHAFPTGLDFLFTS-GKKLFAIPRSTH
>ORF01325|gtf/1-176
---MMALDC---QQTFRMLLEAMSCPGQRMTLP--------DSAGESPFRPACTTILHTLLDADTPV-------ALA---
YPDAAAEHWL--RTRCYAPVV-PPKDAVFAVATDWSW------EDHVFPIGTEEEPENSATLIIEIPTLQ----------
---------GGP---NLILRGPGI-----QNTRAIAPE-IGAGFLPFSQHNHGLYPRGVDLILCS-GRDFLCLPRTTE
>ORF00168|gymb/10-182
GLAEK--QS---QQVFRALVRALSYPGRLESFPAR------------SLRQAFRLIGLTLVDGNVGV-------W-----
-----APSWLLSDLRGQDPRPVALEAADFVFAEQLESLPAGPDSLLALKRGTHLEPEAGATLILGAP-LG----------
---------RGS---PVLLRGPGI-----AGEIQLAVG-LPSLFWQLR-SQILAYPLGVDILLTD-GPQVVGLPRSVE
>ORF02297|nttd01/1-184
MKHECIWLADVQQRVFRELVEAFSRPGEVRDLT----------PW-LDGATAQRAVLATLMDGETTL-------------
ADPHARLGAA--DWPLLQARIGTAEDARYVVADGRRA------PGFEPALGTLESPESGATLLIEVAAVG----------
---------SGP--LALELAGPGIDGPGIDGRRELRLDGLHPDWLLRRADWTAGFPLGVDILFTD-ATRIVALPRTTR
>ORF06193|ntte02/9-186
IWQDEVQ-----QQIFRQLLNCMSLPGTIADLSSY-----------LGESTALIGVLAALLDNTVTL-------------
HDTHELIGQS--DRHFLNSPTAPLTEARFIAVDGTNAPD----TNFNPSLGTLASPELGATIVIQGQHLG----------
---------SGE--LTLSLTGPGILS---AKENKVALNGFHHGWFSRRQEWISAFPLGIDLILVD-VTQVMIIPRTTQ
>ORF03100|ntca02/9-205
PTPIELFNS----RAFRVLLDCLARPGKIGQLPPPPYSDLPPLPDGRPPNTTAVAACMSLLDQRVSFVHAHDNRWL----
TDDQPLSRWI--TLRSGSRVVA-PAIADFALLHDTSSLS----RLSELQEGSLIYPEQSCTAFLCVSDLVA---------
---------TGS---TFRLTGPGI-----AGIATVGITSHTPIQIELLLARRDRFPLGIDLFLIDDNGRCLGIPRTTR
>ORF03932|ntcd03/1-185
----MVNYT---QEIYRKMLDSASFPGKLNNID------NINIENNTKLLNGAIGIAITLLDQEVTF-------YIENYT
QKDIKNIRAL------TVSNQIDYRKSDYIFLDINSEV-----DILQIKIGSFEYPDESATIVHQVNDLSTY--------
---------SQTKYIKLDLSGPGI-----KSKNSIYINGIREEFIERLSTINKDYPIGIDLILVDKKGEIAFIPRSSK
>ORF01200|ntoi01/1-187
MVTNFVHDT---QHTYRVLLDNMSKPGKISSIE------SKPEQE-LHCFPATFLVALTLFDAEVTF-------HV----
VERETKLANL--LSQYTVAKQVAIEKADYIISTNNADSKEVLNALKKSCVGTLADPHQSATLIVEQQNII----------
---------ENG---NLKLSGPGI-----SETHSVGLE-VSEAFWLERDRKIKEYPLGIDLIFTDQNSNIVCIPRTTK
>ORF01954|nthw01/4-198
LGIDPIHDT---QKTFRTLCAVLSNPGTIEQ---------------HSVTPVDHAVVVTLVDHELQA------------Q
IDDEKLQKEL---DAQGRYEGADVREADIIHTRGVPSW-----DIRDIPRGTLLEPSDGATVIYRVETLTTISSHSAVES
DNIHQDAVGDDTSITVVTIDGPGVPT---KTDRTVAIG-LPPEELDRIATAQSTYPRGVDVIITT-AESMLAIPRSAS