HMM Seed Alignment: TIGR02829

Download Alignment

>GB|AAP11104.1|29897829/2-383
LRRFGAKLLFACFLFFSLPVVVQASPVETN----------VVDQQLDKLGIEDVKQFWDGLVTKYG-GYLPESQKGSFME
FVKGEKEFSLKEWMIGLLKYLFHELAANGKLLGTLIMLTIFSALLQSLQSAFSKSS-VSKIADAVVYMVLIIFALNSFYV
VMTYARETIQTMVDFILALLPILLALIATGGGVVSVSFFHPIIIFLMNTSGLLMNYIVLPLLLLATILSIVSTMSDQYKV
TKLSKLLQNVSVGIIGIFLTIFLGVLSVQGTATAVADGIAVKTAKFVTGNFIPVVGRMFTEAADTVISASGLLKNTVGII
GLVILCLIVAFPAIQIFCIAFIYKFAAAVLQPVGGGAIIQCLDIIGR-SIIYVFACLAIVSFMFFLSITIIIAAG
>SP|P49782/1-393
MKRFQWVLLLAVLIIAGRAEIVQAAGNAGQTEDHAETAEQLAERTAASLETDKIGEFWNDIMTEYG-GLLPESQKGSLME
FINGDKSFSPQEWLKALFSYLFHEVLANGKLLGTLILLTIFCVILQLLQNAFQQST-VSKVAYSIVYMVLIILALNSFHV
AINYATEAIQTMTSFILALIPLLLALLASSGGAVSAAFFHPVILFLMNTSGLLIQNIVMPLIFLSAILSIVSTMTEQYKV
TQLANLLRNIAIGALAVFLTIFLGVISVQGASAAVTDGITLRTAKFITGNFIPVLGRMFTDATDTVISASLLLKNTVGIL
GVAILICIAAFPAIKVLSLAFIYKLAAAILQPLGGGPVITCLDVISKSGHLYFCSSRHCVSHVFFKPYCHNHSRK
>GB|BAB06512.1|10175414/1-390
MKRRTKHFWAMTAILIFFIFTIPNAASGADELDSLNDS--FIERQIESLEIEEIQQFWHEIATEYG-GFLPESQKGSLME
FLRGDKQFRIDEWGMGLVKYLLHELLVNGKLLGSIILLSVFSVMLQSLQNAFEQKT-ISKVAYAITYMVLMLIALNSFHV
AMDYTKEAISSMVHFMVALLPLLLALMAAIGNITSAALFHPLIVFMVNTSGMVIHHFVLPLLFISTVLSIVSTMTDHYKV
TKLANFLRTIAVGVLGVFLTVFLGIISVQGATTAVTDGITVRTAKYIAGNFVPVVGRMFTDAADTVMSASLLLKNTVGVA
GLAILLMLCAFPAIKVLSLAVIFHISAAILQPLGAGPITDCLSIIGK-AIIFIFASLAVVCLMFFLAITIMIVAG
>GB|ABB16147.1|77997248/1-372
MKKLSIFVFTLIFLILNGVVPVFANEVS--------------------LPVEAEKILNSAEQELRK-VVPQVDLKREVLA
IFRGEKEISFAEIWENLKGTLLAEIRGNIKILLKLFILAIILSLLRQLENSFSSGS-IAQISQAACYLAFMLLALQSFTL
ALKIGRDAVEGMVGVALSLLPASLGLIAAAGAVTTSALLSPTLFGVIGILGSVIKNLVFPLLYLSILVEIAAGISDRFSL
DKLIKFAQQLSIGLVGLMLSLLLGVGALETVAGGVADNFILKTARFATGTFVPVVGKVLTDAVEAVAGTVYLLKNALNAL
GIVILFGVVTAPAVKILVLGGLYKFAGAVLEPLGEENYVKTLTGMGN-ALLLIFGVLAILSLFLFFLFAVLISAG
>GB|AAM24511.1|20516289/1-377
MKKLVFVLALVITLFGCARADVIKEGIEELG----------------KEDTYQIDRFVKELNQKTGNEFPLIDVKTYLLE
VLEGKQPFEVKKIFEGILRVFFKELYSSFNLLIQLLVLGVIGSILMNLHSSFESES-VSEIAFLAIYIVFIIIAVKSFSE
AMSIGKQAIDSMVDFMQSILPLLITLLVSVGSFTSAAFLEPLVIVTVQFTAHVMRDFVIPIILFMTAVKIVGNISDKFSL
NKMGDFLKTLSTASISVLLSIFLGVITIQGLSSSIADGVISRTAKYTVGAFLPVVGGLLADSVDAVIGASLLIKGAIGTY
GLMIIIAIAAFPLIKIFSLALIYRFVAALIEPISDKRIVSSLSEVAN-SLTYILAALASVTVMMFFTITAIIGTA
>GB|AAO36132.1|28203691/1-380
MRKWKFIILIILLFTLIFNSNVQASM-DEVSD------------IKESKEIEELYDYISNMKSEYEILNDMNVRKYIESS
MKTGEGDISIKKIGKALVGFLFKELATSIKLMSIIVIIAIICTLITNLEMAFSNES-LSNIAYFACYSLLIVIMARSFYL
GVDLARITIERMSNFMLILIPVLIMILFSVGGVAEAAVMDPVIIVSINVASKIFAKILIPLISMVFVLQFVNNITEEYKI
DKLTKLLNQIALWGQGILMTVFIGIMTIRGITSKTLDKVVAKTAKYAVDNFIPVVGKCLSDAVSTVAGYSVLLKDAISGL
GLIMLIVMVSFPTIKLLINAFVYKLTAALIEPIGDKRLINSISSAGD-SLILISSCVICVSIMFFIMISIIAAAG
>GB|AAK80048.1|15025078/1-379
MKKVILMFVVILILFPVTVQAYDKSGSDVTKE--------------NEQQIMQLYDYMTKIKGKYDVLKDLNIKDYVEYY
MKNGKGNTSVSKFSRAVFSYFMQDITSCLKLVSTLVFICIVCALLTNLQKAFSSEK-LTQIAYFSCYAIIIIIIAKNFKI
CVSTAQGAMKDISNMMGAVVPILLTLLISSGSLVESTVFDPVILFSINFTEKVFTDILIPLILLSFVLEFVNNLSEDYKI
SNLSKLLKRSVIWIQGIIMTVFIGIITIRGINAKAIDNVTAKTAKFAVDNFVPIVGKCLSDAISTVAGYSILLKNAIGTV
GLIVLIVMIIFPVIKIFLLAFVHKIVAAFVEPISDKRIVNCLNSVGD-CLILIGSCLIGVAVMFFIMIAIIIAAG
>GB|BAB81535.1|18145493/1-384
MKKLINIILLSLIFVFCFNLKVLANDNLESSK----------EKIDNDSRIERFYDYINNLETEEDILGNMSAKEYIMNY
LESGEDPITLKKIGASILSYIFRELNIVLKFIASILVIALLSALLKNLQDAFNIEEGVTQIAFFACYALLIMLLTKSFFI
SLNLGKEVLTSIIDFMNVIVPVIVMLIATSGGVTSAVTIDPIVLGAVSITPRIYTYFLFPLILAYFTLQFVNNLSSEFKI
DRMCKFIKQVVMISQGFILTIFVGILTLRGMTADTLDAVAVKTVKFAVDNFVPIVGKAFSDAITTVAGYSLAMKSVITSL
GVIVLVVIVIYPIIKIGLMAICFKLTSAVIEPVVDSKISSSVETVGE-ALFMIMSCIISVSIMFFIMASMMATAG