HMM Seed Alignment: TIGR02438

Download Alignment

>GB|BAC19114.1|23494146/70-354
MTSVENQTVDPTAHDSGNKATEKFKAQR....VSSDTSKERANAIYTDLLAAIAEVAHKHEVTYEEYAVLKQWMIDVGEY
GEWPLWLDVFVEHEIEEINYNRHDYTGTKGSIEGPYYVENSPKLPWNGEMPMRDKDKACTPLYFAGQVTDLDGNGLAGAE
IELWHADEDGFYSQFAPGIPEWNLRGTIVTDEEGRYNIKTLQPAPYQIPHDGPTGWFIESYGGHPWRPAHLHLRVSHPGY
RTITTQLYFEGGDYVENDVATAVKPELILHPEAKEDG..NHVHYPFVLDKE
>GB|AAC33003.1|3452283|AF043741/1-282
MTTTE..N..PTAHASGNAATDKFKSER....VSSDTSVERAAAIYKDVLGAFAEIIHKHQVTYDEYRVLKQWMIDVGEY
GEWPLWLDVFVEHEIEEVHYNRKHFSGTKGSIEGPYYVPDSPKLPAKCTMPMREQDKAAEALIFKGQVTDLEGKGLQGAT
VELWHADKEGYYSQFAPGIPEWNLRGTIECDDEGNFEITTLKPAPYKIPADGPTGWFIDSYGGHPWRPAHLHLMVKAPGK
RAITTQLYFQGGEWVEDDVATATKPELILDPQPNADG.VDEVTYNFALDPE
>PIR|JC6206|JC6206/1-284
MTDID..TAVATAHASGNAATDKFKTAR....VSCDTSPERAAAIYRDVLSALGEVIHRHEVTYDEYRVLKQWMIDVGEY
GEWPLWLDVFVEHQVEDVNYSRNGLAGTKGSIEGPYYVPDAPQLPAVCTMPMREQDRRSTPLVFSGQVTDLDGNGLGGAT
VELWHADEDGFYSQFAPNIPEWNLRATIVCDDEGRYEITTIQPAPYQIPHDGPTGWFIESHGGHPWRPAHLHLMVKAPGR
LPITTQLYFRGGDWVETDVATAVKPELVLDPVRGADG.VNRVAYDFALDPT
>GB|CAA67941.1|2398777|ROX99622/1-280
MTTTE....SPTAAGSGSAATDKFKAER....ATADTSPERLAAIAKDALGALNDVILKHGVTYPEYRVFKQWLIDVGEG
GEWPLFLDVFIEHSVEEVLARSR..KGTMGSIEGPYYIENSPELPSKCTLPMREEDEKITPLVFSGQVTDLDGNGLAGAK
VELWHADNDGYYSQFAPHLPEWNLRGTIIADEEGRYEITTIQPAPYQIPTDGPTGQFIEAQNGHPWRPAHLHLIVSAPGK
ESVTTQLYFKGGEWIDSDVASATKPELILDPKTGDDG.KNYVTYNFVLDPA
>GB|AAA22073.1|142202|ARGCATA/1-281
.MSTET...EATAAASGAGATARFRETK...HVAAGTSKERVSALAGRVIKAINDTVLEEKVTYDEYNALKAWLISVGET
GEWPLFLDVWVEHSVEEVANENR..HGSKGTIEGPYYIPNAPTQNTPATLPMRD.DEPGTPLLFQGQVRNLAGEPLAGAK
IELWHADDLGFYSQFAPGLPEWNLRGSIIADDQGNFQINTMQPAPYQIPTDGACGALIAAAGWHAWRPAHLHLNVSAPGH
QLITTQLYFEGDEHVADDIASAVKPELVLAPTDRADGHGREVTYHFVLDPQ
>GB|BAD11154.1|42627732/1-281
.MTQET...EATAAASGSRATERFRENK...QFAADTSKERVNRLASRLVKAINDTVLEEKVTYDEYNAFKAWLIQVGED
GEWPLFLDVWVEHSVEQVANEHR..HGSKGSIEGPYYVPNSPQLQSPATLPMRE.DEAGTPLLFQGRVTNVDGEPLAGAH
VEIWHADDLGFYSQYAPGLPEWNLRGTVIADADGWFEIHTMQPAPYQIPTDGACGKLIAAAGWHAWRPAHLHLKVSAPGY
ELLTSQLYFKGDAHVGDDIASAVKPELILDPTPRADGTGKEVTYNFALDPV
>GB|AAN76673.1|25990737/1-280
MTATHH...APAAAESGASATARFKSDK..FAAVADTPKERVSLLAREVLSAVHETIRKHKVTYDEYNALKAWLIQVGED
GEWPLFLDVWVEHVVEEVATSHR..KGNKGTIEGPYYVPGAPEQGSRRSVPMRE.GEGGTRCV.DGPLTSVDGTPLKDAK
VELWHADADSLYTQFAPGIPEWNLHSTFSVEEDGSFEIHTVRPEPYQIPTDGACGKLIAAAGWHAWRPAHLHVKVSAPGH
ELLTAQLYFPGDEHNDDDIASAVKPELVLDPKP.SDG.GETVTYDFVLDPA
>OMNI|GMSORF1915/14-296
LAEKAG...KATAAASGASATERFHLDKSPFDAVRDVPAERVDLLAREVLDAVHATIRRHKVTYEEYNALKAWLINVGED
GEWPLFLDVWVEHVVEEVATAHR..HGNKGSIEGPYYVPDSPELGADATMPVRP.GEAGTPLVWEGTITSTDGRPLAG.K
VELWHADSEGFYSQFAPGIPEWNLRGTISTGDDGAFRITTMRPAPYQIPTDGSCGKLIAAAGWHAWRPAHLHVKVSAPGH
ELLTAQLYFPGDPHNGDDIATAVKPELMLDPQPQPDG.SEKVRYDFVLDPE