HMM Seed Alignment: TIGR02388

Download Alignment

>PIR|AF2005|AF2005/2-1256
IFRNRVVDKGQLRNLISWAFTHYGTARTAVMADKLKDLGFRYATRAGVSISVDDLMVPPSKRSLLEAAEEEIRATEVRYQ
RGEITEVERFQKVIDTWNGTSEALKDEVVTHFKQTNPLNSVYMMAFSGARGNISQVRQLVGMRGLMADPQGEIIDLPIKT
NFREGLTVTEYIISSYGARKGLVDTALRTADSGYLTRRLVDVSQDVIIREIDCGTTRGIPVRPMTEGSKTLIKLSTRLLG
RVVGEDVIHPKTKEVIAPRNTPISDDLAKEIEKAGVAEVVVRSPLTCEAARSVCQHCYGWSLAHAKMVDLGEAVGIIAAQ
SIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTGEVAQQVRSKMDGTIKLPRKLRTRTHRTRHGEDALFVESNGIMILEPRKEGSETPAPQE
IHVTQGSTIYIVDGQQVKKGQLLAEVALGGRTTRTNTEKAVKDVASDLAGEVKFAEVV.PEQKTDRQGNTTTTAARGGLI
WILSGEVYNLPPGAELVVKNGDRVETNGVLAETKLTTIHGGVVRLPEATPGKSTREIEIITASVVLDQATVTVQSSQGRN
NYLITTGNNQVFNLRATPGTKVQNGQVVAELIDDRYRTTTGGFLKFA.GVEVQKKGKAKLGYEVVQGGTLLWIPEETHEV
NKDISLLLVEDGQYVEAGTEVVKDIFCQNSGVVEVTQKNDILREVVVKPGELLMVDDPEAVI..GRDNTLLQPGEELL.G
QVATELRYIQYVE.SPEGPALLSRPVVEFAVPSNPDVPSTTSVSQQTGRSIQMRAVQRLPYKDSERVKSVEGVELLRTQL
VLEIEQEGEQEHNASPLAADIELIPDLEDADVQRLQLVILESLVLRRDIAADATQGSTQTSLEVKDGDTIVPGSVVARTQ
ILSKEGGIVRGVQKG.SEAVRRCLVLRHSDMATLNIS.AKPKVKAGDLIVAGTELAPGIFAEESGQIVGVKNAGESTTTQ
DAALSTQNYAVTIRAGRPYRVSPGAVLQIEDGDLVQRGDNLVLLVFERAKTGDIIQGLPRIEELLEARKPKEACILAKRG
GEVKVVYGDGDEAIAIKVIESNGVVTDYPLGPGQNLAMPDGSVVPAGQPLSDGPSNPHEILEVFFSLGSE.DGVYACASH
ALQKVQTFLVNEVQMVYQSQGIDIADKHIEVIVRQMTNKVRIDDGGDTTMLPGELVELRQVEQVNEAMAITGGARAQYTP
VLLGITKASLNTDSFISAASFQETTRVLTEAAIEGKSDWLRGLKENVIIGRLIPAGTGYNTYDE
>SP|Q8DL57|RPC2_SYNEL/7-1233
IFFNRIIDKKGLRDLIAWSFSNFGTARTAEMADKIKDLGFHYATRAGVSISVDDLLVPPKKQELLEAAEKEIKTAQERYS
RGEITEVERFQKVIDTWNSTNEELKNEVVRHFRNTDVLNSVYMMAFSGARGNLSQVRQLVGMRGLMANPQGEIIDLPIKT
NFREGLTVTEYIISSYGARKGLVDTALRTADSGYLTRRLVDVSQDVIIREEDCETERGITLRSMTVGDK.VLALQDRLLG
RVVLNDVRHPQTGEVLVAKNQAISADLAKKIVDAGIEEVVVRSPLTCEATGSVCRLCYGWSLAHARLVDMGEAVGIIAAQ
SIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTGEVARQERAPFAGTVEYGKKLRVRPYRTRHGDDAFIVETAGKLVVKGGQQR......QE
FDLSQGSIVLVADGETVAAGQLLAEVAQAARSVRKATEKVTKDVASDLAGQVKFVNLD.AEEKRDRQGTTTRIAPKGGLI
WVLSGEVYNLPPGAEPVVKNGDRIEAGAVLAETTVKTEHGGVVRLPEQQDSKGGREVEIITASVMLDKAKVLKETQQGRE
HYIIETATGQRFSLKAAPGTKVANGQVVAELIDDRYHTTTGGILKYA.DIEVAKKGKAKQGYEVLKGGTLLWIPEETHEV
NKDISLLMVEDNQYVEAGTEVVKDIFCQNSGVVEVIQKNDILREIIIKPGELHLVDDPEAAR..LKHGTLARPGEEVLPG
LVVDTLSQVDYLEDTPEGPAILLRPVQEFSVPDEPSVPSQDS.SDGSGQSIRLRAVQRLPYKHDERVKSVDGVDLLRTQL
VLEIGSEAPQ......LAADIEIVTDEVDPEAQRLQLVILESLIIRRDIAADQTQGSTFTSLLVKDGDHIGPGAVIARTD
IKAKQAGEVQGIVRS.GESVRRILVVTDSDRLRVETNGAKPTVKVGDLVRPGDELAKGVTAPETAAVMAV..A.......
.....DD..HVILRLARPYLVSPGAVLQIEEGDLVQRGDNLALLVFERAKTGDIIQGLPRIEELLEARHPKEKCVLAVRP
GTCQVTYNS.DDSVEIKVIEEDGTIQEYPVLPGQNPLVVDGQKVNLADPLTDGPVDPHDILSIYFEYYKP.QGLLKAAQT
SLEKVQSFLVNEVQSVYLSQGIEIADKHIEVIVRQMTSKVRIDDAGDTILLSGELMTLRQAEQANEPMALTGGAPAQYTP
VLLGITKASLNTDSFISAASFQETTRVLTEAAIEGKSDWLRGLKENVIIGRLIPAGTGFNSYEE
>SP|P73334|RPC2_SYNY3/2-1228
TFYNYTIDKGRLKKLIALAYRRYGSARCSQLADELKELGFRFATKAGVSISVDDLTIPPEKKQMLEAAEKEIRTTEERYA
RGEITEVERFQKVIDTWNGTSEELKDQVVVNFRKTDPLNSVYMMAFSGARGNMSQVRQLVGMRGLMADPQGEIIDLPIKT
NFREGLTVTEYVISSYGARKGLVDTALRTADSGYLTRRLVDVSQDVIVREQDCGTERSLRVTAMTDGDQVKISLADRLFG
RLLAKDVVGPD.GEIIAKRNDEIDEALANRIAAV.TDEVYVRSPLTCEAARSVCQNCYGWSLAHGHKVDLGEAVGIIAAQ
SIGEPGTQLTMRTFHTGGVFTGEVARQEKAPEDGTVKWGKGLSTRKVRTRHGEDAEQVEIAGDLIWKGEGKK...AATQT
YSLTPGSLLFVQDGQTVTAGQLMTEISLS..KTQRSTERATKDVAGDLAGEVLFDRLV.PEEKTDRQGNTTRIAQRGGLV
WILSGEVYNLPPGAEPVVKNDEQVEVGSIMAETKLVTNDGGVVRLVS.....N.REIEIITASVLLDQAQVKLESSGGRE
QYVIYTADKQRFLLKAAPGTKVQNHSIVAELIDDRYRTTTGGMIRYA.GVEVAKGG.RKQGYEVTKGGTLLWIPEETHEI
NKDISLLIVEDGQYVEAGTEVVKDIFCQSSGIVEVVQKNDILREIIIKPGDFYQDVDPGSVK..IESGQLLQPGQDVFPG
VTVSTLSQAEWIE.SPEGNGLLLRPVEEYKVFDEPAAPSQGSQNEEGGRQIELRSVQRLFYKDGDRVKSVEGAPLLSTQL
VLEIYGSGNE..GISHLSADIELQDDEEE.DCQRLQLVILESLVLRRDQESDPLGGASKTRLLVQDGDQIPPGAVVARTE
IQCKEAGTVRGIKEG.QESIRRVLLERAADRLVVDLP.SAPEVKPGQLLVAGQELVPGVKLEESGKVLEINGK.......
.....GDNYQLVLRRARPYRVSPGAVLHIEDGDLVQRGDNLVLLVFERAKTGDIVQGLPRIEELLEARKPKEACVLARAP
GVCQVEYLE.DESVDIKVVEDDGTVSEYPLLPGQNAMVTDGQRIDVGHALTDGYNNPHEILDVFFSYYVDKDGCYQAALR
GLQAAQKFLVNEVQTVYQSQGVDISDKHIEVIVRQMTAKVRIDDGGDTTMLPGELVELRQVEQVNEAMGITGSAPARYTP
VLLGITKASLNTDSFISAASFQETTRVLTEAAIEGKSDWLRGLKENVIIGRLIPAGTGFSSHEE
>SP|Q7V008|RPC2_PROMP/36-1261
SFKNKVVDKKALKNLVSWAYKTHGTAVTAAMADNLKDLGFKYATQAAVSISVNDLKVPEAKQDLIGQAEAQITATEECYR
LGEITEVERHTKVIDTWTETNERLVDAVKNNFNQNDPLNSVWMMANSGARGNMSQVRQLVGMRGLMANPQGEIIDLPIRT
NFREGLTVTEYVISSYGARKGLVDTALRTADSGYLTRRLVDVAQDVIVREEDCGTERSIVIN..SEDGK....FGSRLIG
RLSAEDILDSE.GNLIVPKNTAIDPSLSKTLETSLISKVNIRSPLTCEANRSVCRKCYGWALAHNHLVDLGEAVGIIAAQ
SIGEPGTQLTMRTFHTGGVSTAESG.VVRSKIKGKVEFGSKAKIRGYRTPHGVEAKQAEVDFLLKIIPTGSITN..KAQK
IEVTSGSLLFVEDGQDIDSDITVAQITSG..AVKKSVEKATKDVICDLAGEVRYDKVIQPKEVTDRQGNITLKAQRLGRL
WVLAGDVYNLPPNAKPVVSTETKVEQGTVLAEASQSSEFGGEVRLRESVG..DSREVQIVTTSMLLSNFKLIEESTHSGE
LFHLESNDGTIYRLNTSPGSKISSGEVIADLADERFRTKTGGLVKYAPGLSVKKARSSKNGFEVSQGGTLLWIPQETHEI
NKDISLLMTEDMEWIEAGTEVVKDIFSQTSGIVTVTQKNDILREITVRNGSFHECEDEEILSRFTEEGKLVNPGEKIIDG
VDNDEILFVQKLE.TSKGKGLLLRTVEEYTIPNEAELPELSHVKQEKGPSLALKAIQRLSYKDGELIKSVEGVELLKTNL
SIESFDATPQ......MTIDVETIQDKSDKSINRLNLVILESILVRRDTISDSSHGSTHTELQINNNQLVKAGDVIATTQ
ILCKERGVLQLPDSVEGEPIRRLIVERNEDKIKINIK.DKAVVKTGDRVVDGDLISKGVKSTSCGEIEEVS.........
.......SEYVILRIGRPYMVSPDSVLHVKDGDLVLRGDGLALLVFERQKTGDIVQGLPRIEELLEARRPRDSSILCKKS
GVVQIKEGTDEESVSLSVIERDDSISEYQLLMGQNIMVSDGQQVTGGELLTDGPINPHDLLDCLFTDLKDQKPLMEAAQE
SISKLQRKMVNEVQNVYKSQGVAISDKHIEVIVRQMTSKVRIEDAGDTTLLPGELIELRQVEDTNQAMSITGGAPAEFTP
VLLGITKASLNTDSFISAASFQETTRVLTEAAIEGKSDWLRGLKENVIIGRLIPAGTGFSGFVE