HMM Seed Alignment: TIGR02348

Download Alignment

>SP|Q9KJ23|CH60_LACJO/2-526
AKEIKFSENARHSLLKGVDKLADTVKTTLGPKGRNVVLEKSYGAPDITNDGVTIAKSIELENHFENMGAKLVSEAAQKTN
DIAGDGTTTATVLTQAIVREGMKNVTAGANPVGIRRGIETATKAAVDELHKISHKVSTK.DEIAQVASVSSAS.TEVGNL
IADAMEKVGHDGVITIEESKGIDTELSVVEGMQFDRGYLSQYMVTDNDKMEADLDNPYILITDKKISNIQD.ILPLLQEI
VQQGK.SLLIIADDVDGEALPTLVLNKIRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGTVISSDLGLELKDTKIDQLGK
AGKVTVTKDSTTIVEGAGSKEAIAERVDQIKKQIADT.TSDFDREKLQERLAKLAGGVAVIKVGAATETELKERKYRIED
ALNATRAAVEEGYVAGGGTALVDVMKSIQGTVKGDSE..DAETGVKIVMKALGAPVRQIAENAGKDGAVILDHLEHE...
DPE.VGYNAATNKWENMVKAGIIDPTKVTRSALQNAASIAALLLTTEAVVADAPED
>SP|Q8PW06|CH60_METMA/3-526
SKQIMFDESARKALLSGVDKVANTVKITLGPKGRYVVLDKST.KPVVTNDGVTIAKEIELHDKFENMGAKLVKEVASKTQ
DNTGDGTTTATLLAQSMIREGLKNISAGANPIEVKKGIEIATEKVVGYLKGKSVEVKGK.DKIIQVATISANNDEEIGNL
IADAMERVGYNGVITVEDSKTMETSLDVVEGMQFDRGFVSPYMALDTEKMVCEFEDPYILITDKKINSMKQ.IVPVLEKV
ASEGR.SLLIIAEDVDGDAQAALILNIIRGALRVCAVKAPGFGNERKEMLEDIAVLTGGQVISEEKGMKLEEFSDYMLGN
ARKVTVDNHKTIIVEGRGDKADIDERVRVIEAQINIA.EADYRKTELKKRMAKLGGGVAVIKVGAATETELKEKKMRIDD
ALNATKAAVEEGVVTGGGISLFRAAATLD.SLDLDG...DRQIGVKIVQRAIEDPVRQIAANAGREGAEVVAAIKAE...
SSEHFGYNAKTDVFEDLFEAGVIDPTKVVRSGLQNAASIAGMVLTTEALVTDFDEE
>GB|AAF91444.1|9652216|AF281650/2-524
AKTIAYDEEARRGLERGLNALADAVKVTLGPKGRNVVLEKKWGAPTITNDGVSIAKEIELEDPYEKIGAELVKEVAKKTD
DVAGDGTTTATVLAQALVREGLRNVAAGANPLGLKRGIEKAVEKVTETLLKSAKEVETK.DQIAATAAISAG.DQSIGDL
IAEAMDKVGNEGVITVEESNTFGLQLELTEGMRFDKGYISGYFVTDAERQEAVLEDPFILLVSSKVSTVKD.LLPLLEKV
IQAGK.PLLIIAEDVEGEALSTLVVNKIRGTFKSVAVKAPGFGDRRKAMLQDMAILTGGQVISEEVGLSLESADISLLGK
ARKVVVTKDETTIVEGAGDSDAIAGRVAQIRTEIENS.DSDYDREKLQERLAKLAGGVAVIKAGAATEVELKERKHRIED
AVRNAKAAVEEGIVAGGGVALLHAIPALDE.L..KLEG.DEATGANIVRVALEAPLKQIAFNGGLEPGVVAEKVHNS...
P.AGTGLNAATGEYEDLLKAGVADPVKVTRSALQNAASIAGLFLTTEAVVADKPEK
>SP|Q9EZV1|CH60_THENE/2-527
PKLLKFNEEARRALERGVDKVANAVKITLGPKGRNVVIEKSWGSPTITNDGVSIAKEIELEDKFENLGAQLVKEVASKTN
DVAGDGTTTATVLAQAMIKEGLKNVAAGANPILLKRGIDKAVERAVEEIKKLSKKLSGR.EDIAHVAAISAN.SPEIGEL
IAEAMDKVGEDGVITVEDSKTLETYVEFTEGMQFDRGYISPYFVTDAEKMEVVLKEPSILITDRKLSAVKP.LIPILEKV
AQTGK.PLLVIAEDVEGEALTTLVLNKLKGTLQSCAVKAPGFGERRKAMLQDIAILTGGQVASEELGINLEDLTLEDLGR
ADLVRVKKDETIIIGGKGDPEAIKKRIAQIKAQIEET.TSEYEKETLQERMAKLAGGVAVIKVGAATETELKEKKHRIED
ALSATRAAVEEGIVPGGGVTLLRSRKAVEK.LLEELDG.DEKIGAQIVYKALSAPIRQIAENAGYDGAVIIEKILAS...
DDPAYGFDALRGEFGNMFEKGIIDPAKVTRSALQNAASIAGMLLTTEVLVVEKPEE
>GB|CAD76020.1|32446191/2-528
AKQLLFEDHARARMLAGVEKLAKAVATTMGPTGRNVIIDKSFGGPTVTKDGVTVAKEIELEDRFENMGAKLVIEVAQKTS
DLAGDGTTTATVLARAIFKEGLRNIVAGSNPTAIRRGIEKAVEAACDQLVEMGRPVSGK.QEVAHVGAISANNDNVIGEL
LADALERVGKDGVITVEEGKSRNTEVEYVDGMQFDKGYVSPYFITDSSTMEASLEDALVLLYEKKVSNIRD.LVPLLEKT
AQTGQ.PLLIIAEDVDAEALTLLVVNKLRGTLNVCAVKAPGFGDRRKAMLGDIATLTGGTLISEDLGMQLENVTLEHLGR
AKKVTVDKSNTTIVEGAGKREDIDKRVAQIRAQIEQT.DSDYDKEKFQERLAKLAGGVAVISVGAETEAEMKQTKARLED
ALHATRAAVEEGILPGGGVALVHCREAVEA.AKKKAKG.DEKIGVDIVLGALDAPMRQIADNGGIDGSVVVDEVLQK...
NDPKIGFNAHTGEYTDMVKAGVIDPVKVVRTALTNAASIAGLLLTTEALVTNFEQE
>GB|CAD76885.1|32447076/2-526
PKIIAFDQEAREAIRRGVSKLARTVKVTLGPKGRNVILQKSFGSPTVTKDGVTVAKEIELEDPYENMGASMVREVASKTS
DVAGDGTTTATVMAEAIFNEGLKAVVAGVNPIQMKSGIETAVSDITEQLHSMAVKVKDQ.EAMANVATIASNNDREIGTL
LADAMSKVGKDGVITVDEGKSLQTEQEWVEGMQFDRGYLSPYFVTDSTSMEVVLEDAYVLVFEKKISNIKD.MVPLLEKV
VQQGK.PLLIIAEDVDGEALATLVINRLRGTFTVCAVKAPGYGDRRKAMMEDIAILTGGQAIFEALGVKLESVDLPQLGR
AKKIIVDKDNTTVIEGGGKSADIKARIDQIRREIELS.TSDYDREKLEERLAKLAGGVAKVNVGAATESEMKEKKARVED
ALHATRAAVEEGILPGGGVALLRASGKVKA.ADTLT.D.DQLVGYNIVLRACRAPLTMISENAGQDGGIVCEKVLAM...
KG.NEGYNALTDVYEDLVKSGVIDPTKVTRTALGNAASVATLLLTSDALVAEKPEK
>GB|CAF22754.1|46399305/2-527
AKLLQFNEEALKSILKGVKTLAKAVKVTLGPKGRNVVINKGFGSPLSTKDGVTVAKEVVLKDKFENMGAQLVNQVAAKTS
DVAGDGTTTAIVLAEAIYSAGVKNVAAGANPMSLKRGIDQAVETITRSLDHLSTPVNTA.QEVRQIATISANNDGEIGRI
IGEAMERVGKDGIITVAEAKGIETHVDYVEGMQFDKGYVSPYFITNAEQMSVELSNADILITDKKLSAAKD.IIPVLEKI
MEKGARPLLIIAEDIDGEALATLVVNKLKAGMTVCAVKAPGFGDRRKAMLQDIAILTGGKVVSEEVGLKLDEVGPEVLGR
AKTIKVSKEETTIIDGAGQSNEVKSRLAQIKAELANASTSKYDKEKLEERLAKMVGGVAVVNVGAATETELKEKKARVED
ALHATRAAVAQGIVPGGGVALLRAVKSLEK.LQLTG...DEAIGVTIIKQAAFAPAIAIANNCGKQGNLIAEKIYEA...
TG.SYGYDGLTDEFKDLLKAGVIDPVLVTKSALINAASIAGLLLTTAAMITDKPQP
>GB|AAS11694.1|41817000/2-527
AKQLLFNEEARKSLLAGVEQISNAVKVTLGPKGRNVLIDKSFGAPTVTKDGVSVAREVELENKFENMGAQLLKEVATKTN
DVAGDGTTTATVLAYSMVKEGLKAVAAGMTPLELKRGIDKAVAIAVEDIQKNSKEIKGS.EEVAHVASVSANNDAEIGKI
IADAIAKVGKDGVIDVGEAQTMETVTDYVEGMQFDRGYISSYFVTDRDRMETVFENPYILIYDKSISTMKD.LLPLLEQV
AQSGR.PLLIIAEDVEGEALATLVVNSLRGALKTCAVKAPGFGDRRKEMLEDIAVLTGGQVVSEELGFKLEAAQISMLGQ
AKSIKIDKDNTMIIDGAGKSKDIKDRVTQIKAQLDAT.DSEYDSEKLRERLAKLSGGVAVIKIGAVTEVEMKEKKHRVED
ALSATRAAIEEGIVAGGGLAMIQAIAALEK.ADMSSLTEDEKVGFKIVKRALEEPIRQIAENAGLDGAVIAEKAKEK...
KG..VGFDAAKMEWTDMVKAGIIDPAKVTRSALQNAASIASLLLTTECAITDIPEK
>SP|Q8GBD2|CH60_ACEAC/3-528
AKDVKFGADARQRMRAGVDILADAVKVTLGPKGRNVVLDKSFGAPRITKDGVSVAKEIELADKFENMGAQMLREVASKTN
DIAGDGTTTATVLAQAIVREGHKAVAAGMNPMDLKRGIDKAVAVVIEELKKNAKKVTTP.AETAQVGTISANGESEIGQM
ISEAMQKVGSEGVITVEEAKHFQTELDVVEGMQFDRGYISPYFVTNPEKMTADLENPYILIHEKKLSSLQP.MLPLLESV
VQSGR.PLLIIAEDVDGEALATLVVNKLRGGLKIAAVKAPGFGDRRNVMLEDIAILTGGQVISEDLGIKLETVTLNMLGT
AKKVHIDKENTTIVDGAGKADDIKGRVKQIRAQIEET.SSDYDREKLQERLAKLAGGVAVIRVGGSTEVEVKERKDRVDD
ALHATRAAVEEGIVPGGGTALARATLKLEG.LHYHND..DQRVGGDIIRRALQAPLRQIAHNAGEDGAVIANKVLEN...
SDYNFGFDAQAGEYKNLVEAGIIDPAKVVRTALQDAASVAGLLITTEAMVAERPEK
>SP|P25750|CH60_BUCAI/3-527
AKDVKFGNEARIKMLRGVNVLADAVKVTLGPKGRNVVLDKSFGAPSITKDGVSVAREIELEDKFENMGAQMVKEVASKAN
DAAGDGTTTATLLAQSIVNEGLKAVAAGMNPMDLKRGIDKAVISAVEELKHLSVPCSDS.KAITQVGTISANADEKVGSL
IAEAMEKVGNDGVITVEEGTGLQDELEVVKGMQFDRGYLSPYFINKPETGIVELENPYILMADKKISNVRE.MLPILESV
AKSGK.PLLIISEDLEGEALATLVVNSMRGIVKVAAVKAPGFGDRRKAMLQDISILTGGSVISEELAMELEKSTLEDLGQ
AKRVVISKDTTTIIGGVGEKHSIQSRISQIRQEIQEA.TSDYDKEKLNERLAKLSGGVAVLKVGAATEVEMKEKKARVED
ALHATRAAVEEGVVAGGGVALVRVAGKIAD.LRGQNE..DQNVGIRVALRAMEAPLRQIVSNSGEEPSVVTNNVKDG...
KG.NYGYNAATDEYGDMIDFGILDPTKVTRSALQYAASVAGLMITTECMVTDLPKE
>SP|O67943|CH60_AQUAE/3-531
AKAIIYNEEARAKLKAGVDKLANAVKVTLGPKGREVILGKNWGTPVVTKDGVTVAKEIELKDKFENIGAQLVKEVASKTA
DVAGDGTTTATVLAQAIFHEGLRVAASGANVMEVKRGIDKAVKKIVEELKKLSKDVKER.KEIEQVATISANNDPEIGKI
IADAMEEVGKDGVITVEESKSAETTLEVVKGMQFDRGYLSPYFVTDPEKMECVLENPYILIYEKKITNVKE.LLPILEQV
VRSGR.PLLVIAEDVEGEALATLVVNHIKGVLKACAVKAPGFGQRRKDYLGDIAVLTGGQAITEDLGIKLESVTLDMLGQ
AEKVVVDKEHTTIIGGKGDPEQIKARIEQIKRQIQET.TSDYDREKLQERLAKLSGGVAIIRVGAATEAELKEKKYRVED
AVHATKAAVEEGIVPGGGVALVRASEALED.LKGDNH..DQQLGIDIIKKAVRTPLKQIAYNAGYDGSVVLEKVIELGKE
KGVSWGFNAATGEYVDMYEAGIIDPTKVVRTAIENAASVAGTMLTAEALIADLPEE
>SP|P42375|CH60_PORGI/2-527
AKEIKFDMESRDLLKKGVDALANAVKVTLGPKGRNVILSKTYGAPHITKDGVSVAKEIELECPFENMGAQLVKEVASKTN
DDAGDGTTTATILAQSIIGVGLKNVTAGANPMDLKRGIDKAVKAVVTHIAGMAKEVGDDFQKIEHVAKISANGDENIGSL
IAEAMRKVKKEGVITVEEAKGTDTTVEVVEGMQFDRGYISPYFVTNTDKMEVQMENPFILIYDKKISVLKE.MLPILEQT
VQTGK.PLLIIAEDIDSEALATLVVNRLRGSLKICAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGTVISEETGLKLENATMDMLGT
AEKVTVDKDNTTIVNGAGNKEGIASRITQIKAQIENT.TSDYDREKLQERLAKLAGGVAVLYVGAASEVEMKEKKDRVED
ALSATRAAIEEGTVPGGGTAYIRAIAALEG.LKGENE..DETTGIEIVKRAIEEPLRQIVANAGKEGAVVVQKVKEG...
KD.DFGYNARTDVFENLYTTGVIDPAKVTRVALENAASIAGMFLTTECVIADKKED
>SP|O69289|CH60_CAMJE/2-525
AKEIIFSDEARNKLYEGVKKLNDAVKVTMGPRGRNVLIQKSFGAPSITKDGVSVAKEVELKDSLENMGASLVREVASKTA
DQAGDGTTTATVLAHAIFKEGLRNITAGANPIEVKRGMDKACEAIVAELKKLSREVKDK.KEIAQVATISANSDEKIGNL
IADAMEKVGKDGVITVEEAKSINDELNVVEGMQFDRGYLSPYFITNAEKMTVELSSPYILLFDKKITNLKD.LLPVLEQI
QKTGK.PLLIIAEDIEGEALATLVVNKLRGVLNISAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGEVISEELGRTLESATIQDLGQ
ASSVIIDKDNTTIVNGAGEKANIDARVNQIKAQIAET.TSDYDREKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATETEMKEKKDRVDD
ALSATKAAVEEGIVIGGGAALIKAKAKIK..LDLQG...DEAIGAAIVERALRAPLRQIAENAGFDAGVVVNSVENA...
KDENTGFDAAKGEYVNMLESGIIDPVKVERVALLNAVSVASMLLTTEATISEIKED
>SP|Q8GJ00|CH60_FUSNP/2-524
AKIINFNDEARKKLEIGVNTLADAVKVTLGPRGRNVVLEKSYGAPLITNDGVTIAKEIELEDPFENMGAALVKEVAIKSN
DVAGDGTTTATILAQAIVKEGLKMLSAGANPIFLKKGIELAAKEAIDVLKDKAKKIESN.EEISQVASISAG.DEEIGKL
IAQAMAKVGETGVITVEEAKSLETTLETVEGMQFDKGYVSPYMVTDSERMTAELDNPLILLTDKKISSMKE.LLPLLEQT
VQMSK.PVLIVADDIEGEALTTLVINKLRGTLNVVAVKAPAFGDRRKAILEDIAILTGGEVISEEKGMKLEEATIQQLGK
AKTVKVTKDLTVIVDGGGEQKDISARVNSIKAQIEET.TSDYDKEKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATEVEMKDKKLRIED
ALNATRAAVEEGIVAGGGTILLDIIESMKD.FNETG...EIAMGIEIVKRALEAPIKQIAENCGLNGGVVLEKVRMS...
.PKGFGFDAKNEKYVNMIECGIIDPAKVTRAAIQNSTSVASLLLTTEVVIANKKEE
>SP|Q9TLZ1|CH60_CYACA/2-528
SKRILYKDQARKALERGIDVLAKAVSITLGPKGRNVVIDKKYGAPQIINDGIAIAKEIELKNHMENTGVSLIRQAAAKTN
DVAGDGTTTATVLAHAIIKQGLKYVSTGSNPISLKKGIEKASQFIIQKISENSRPIEDV.KSIIQVSSISAGNDEEIGSM
IANAIQKVGKDGVISLEEGKSAITELEITQGMKFEKGYISPYFITNSEKMEVVLENPYILMTDKKITLVKEDLLPVLTLI
NKTNR.PLLIIAEDVEKEALATLVINKLRGIVNVVAVRAPGFGDRKKALLEDIAILTNGQVISEETGLNLETITLDVLGQ
ARRATILRDSTTIVEDK.NQQAVHARCEQLKNQLLIA.KSSYEKEKLQERLAKLIGGVAVIKVGAATETEMKEKKLRLED
SINATKAAIEEGIVPGGGTALVHISANLKQWAKINLSS.DELLGANIVEQASLAPLHKIAENSGKNGSLIVEALEHK...
.NFEIGYDALSNSLVDMYDAGIIDPAKVTRSAIQNAASIASMVLTTECVIVNRDKK
>GB|BAC88968.1|35211590/2-526
AKQVVFDETARRALERGIDALANAVRVTLGPKGRNVVLEKKFGAPQIINDGVTIAKEIELENKLENTGAQLIKEVASKTN
DVAGDGTTTACVLAQSLVKEGLKNVAAGSNPMNLKRGMEKTVRHLVAELEKVAKPVEGS.QAIAQVAAVSAGNDDEIGEM
IARAMETVGKEGVITVEESKSLTTELEVTEGMQFDRGYVSPYLVTDQERMEAVFDEPFLLITDKKISIITD.LVPILEKV
ARAGR.PLVIIAEDIEKEALATLVVNKLRGVLNVAAVKAPGFGDRRKAMLQDIAVLTDGEVISEDTGIKLENVTTDQLGK
ARKMTITKDNTTIVAE.GNEAAVKARCAQIKQQIEET.DSEYDREKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATETELKDRKLRIED
AVNATKAAIAEGIVPGGGTALLHLAAGMGGFIDSLSG..EEKIGARIIQKALEGPLRQIAENAGLEGSVIAEKVRNL...
.EFNFGFNAMTNEYEDLVAAGIIDPVKVTRSALQNAASIAAMVLTTECIVVDKPED
>GB|CAE08369.1|33633164/2-524
AKLLSFSDESRSALERGVDALADAVRVTIGPRGRNVVLEKKFGAPDIVNDGDTIAREIELDDPFENLGAKLIQQVASRTK
DKAGDGTTTATVLAQAMVREGLRNTAAGASPVELRRGMEKAVAQVVDGLQQRSQPVAGD..AIRQVATVSSGGDDEVGRM
IAEAMDRVSADGVITVEESKSLATELEVTEGMAFDRGYSSPYFVTDADRQICEFENPLILLTDRKISAIAD.LVPVLEAV
QKSGS.PLLVLAEEVDGEALATLVVNRNRGVLQVAAVRAPSFGERRKAALADIAILTGGTLISEDRALTLDKVQLSDLGK
ARRVTISKENTTIVATDDHRAAVADRVAAIKRELDAT.DSDYDREKLNERIAKLAGGVAVIKVGAPTETELKNRKLRIED
ALNATRAAIEEGIVPGGGTTLLQLADGLNGLVEQLEG..DQRTGVEILQRALVAPVHHIATNAGHNGDVVIEAMRNS...
...GQGFNALTGTYEDLMAAGIVDAAKVVRLAVQDAVSIASLLITTEVVIADKPEP
>GB|CAE18911.1|33639741/2-524
PKQLSFSNESREALEKGINTVANAVKVTIGPKAKNVVIERKFGSPDIVRDGSTVAKEINLDNPISNLGAKLIEQVASKTK
ESAGDGTTTATILTQIMVQEGLKNIAAGASPIELKKGMEKGLNFVLEKLRSKSIKINGS..DIKKVATVSAGGDEDIGSI
ISKAMDIVTSDGVITVEESQSLETELDITEGMSFDRGYSSPYFVTDQERQICELENPKILITDQKISTLTN.LVPILEEV
QKSAS.PFLILAEDIEGEALTTLVLNKNSGVLNVSAVRAPSFGERRKAALEDIAILTGAKLISEDQSMKLEEVTLNDLGK
AKKITISKDKTTIVAFDDTKDLVQERVEKLKREVEIT.ESEYDKDKINERIAKLAGGVALIKVGAATETEMKYKKLRIED
SLNATKAAIEEGVVSGGGQTLIEISNELSNSRKEISD..DLTTGIDIITNALLEPTKQIAKNAGFNGDVVIADIKRL...
...GKGFNANNGEYENLNESGILDPTKVIRLALQDSVSIAAMIITTEVAVADIPEP