HMM Seed Alignment: TIGR02053

Download Alignment

>OMNI|NTL02ST1164/4-456
MRLVIVGNGAAAFAALIRANELG...VKPVMISHGIIGGTCVNVGCVPSKRMLRIGEVYDYTRKT......LGKDVYPDF
FKAFEDKQEIVETLRKEKYIDVLSSYD.VEYVEGKAHFVSPKEVKVN....GKIIEGDK.FIIATGSSPQIPDIPGLKEL
G....YWTNVEALSPNRKI..SSLAVIGGRALALEFAQMYKRLGVDVLILQRSKIIIPNWEPEISIAVQNYLSKEEGIYI
VTDV.KIKEIKKGDEGGKIIVTDKG....EAEVDEILVATGRRPNVD.LN.LDVAGVKLNEKGGILVNETLQTTNPNIYA
AGDVIGD.LM....LESLAGKEGSVAAENAILNSGKKIDRLSIPQVIFIEPNVARVGLTYLEAQRE.YSVESRVVKMSSV
AKARILREPQGLIKMNVDKNTKKI.......LGVQMFGKYAAEVINEAALAIRLRATIDDIIDTVHVFPTMAESLKLAAM
SFYRDVDKMSCCVD
>OMNI|NTL01TA01314/5-469
YDLLILGYGAAAFSAAIKASEITSGQASIAMVGTGPLGGTCVNVGCVPSKMLISAAKNLKYIAKPR..YPGLKATYAVET
GEVMDFIRMAVDEERHNKYEAVISGYENIDLYRSRAVFTGDRRVKLDD...GQELFGYN.VLIATGSRPSIPAVPGLANA
G....YITSNEFWALERIP..ESLVIIGSGPIGSEIGQAAARLGSRVHIVEIADQILPGISKDMAQMVMDAMAS.DGVEF
SLSS.MVKDVSVRN.GKKIVRFEKNGVQHEIEADEILVATGRSPNAD.LD.LEKTGVKYDRYG.IEVDSTLRTSNRKIYA
AGDVVKQRLK....LETLASKEGVIAAENMFDHAGISVDLNSFPVAVFTSPEYASVGYTEDEALKAGLNYDVRSIYTTDV
PKERILRNDRGMIKIVAEQGTGRI.......IGIQIVAENAADMINEASAILHAGMTVGDVIDTPHVFPTVNEGIKLAAQ
SFLRDISMMSCCME
>OMNI|NTL04PA1832/2-467
YDVVVLGGGSAGVAAAVKAAQLG...AKVAVVNSGPLGGTCVNVGCVPSKFLIRAAQLKRYAERPF..FKGISAKVEVAF
DALLQHMKEVVEELRREKYEEVLKYYD.VDIIEGYGYLKDAKTVKVG....EREVRGEK.IIVATGARPRVPEIPGLKEA
MARGMAFTNEEFFKLDHMP..SSIVFIGGGAIAAELSQALARLGIEVAVIYRSS.FLKYEEEIASKFVEELLAN.EGVRL
IKAA..VTAVEIR..GRE...VEVRHSGGSVRAEALFVAAGRAPNIEPLGGLLKLGP....NGGVLVNERMETSLPGVYA
AGDVTGG.LEGARFLENAAARQGVVAAVNAMG.GNAKFNPLAVPRVVFTDPAVASVGLREEDMIKGGIGCRCRAAPIEAV
AAGWTKGQTTGFIKINTYPETWKVSVKRGKIAGALVVAPEAEELINVFAMAIQLGLTVEDLIEWLPSFPSYGEALRLAAL
AFYTDPTKLSCCGG
>OMNI|NTL01AP01513/6-461
YDIIVIGGGAAGFSAVVAAAEGG...ASVLLVSEGPLGGTCVNFGCVPSKHVLYNLSTARKAG............LKISL
SEALEGARKVSETLRKEKYESLLDSLG.VDYLRGRARFKAPGIVEAD....GREVRYRKAAIIAVGARTWRPPIPGLKEA
EKAGRILDNERLFGEGPPPDMESVAVIGGRAQGVEAAQIFARSGLKTVLLQRSGRLLPRDEPEAGVYMKRVLEG.DGVEV
RTSARPLRVESVR..GAVRIDYETPQGPASVEASYIYLATGRKPVLDGLG.LENVGVRVSSDGFIVVNEKLMAS.PGVYA
AGDCIGG.IQ....LEPVAAREGYVAALNALG.GNVEMDYTVIPRAVFTDPEFASVGLTERELARKLGVCACRTVDITQI
PRARIMGYETGFVKMVVDPRTKKV.......AGVHMMAPQAAEAIHEAAFILKAGMTVDDVIDTIHIFPSISEGIKYAAL
AFYRDVSKMPCCLL
>GP|2995415|emb|CAA70224.1/85-546
YDYIIIGSGGAAFSSAIEAVKYG...AKVAMIERGTIGGTCVNIGCVPSKTLLRAGEINHLAKNNP.FVGLHTSAGEVDL
APLIKQKNELVTELRNSKYVDLIDDY.GFELIEGEAKFVDEKTVEVNG.....APISAKRFLIATGASPAKPNIPGLNEV
D....YLTSTSLLELKKVP..KRLVVIGSGYIGMELGQLFHNLGSEVTLIQRSERLLKEYDPEISESVEKSLVE.QGINL
VKGA.TYERIEQ.NGDIKKVHVEVNGKKRIIEADQLLVATGRTPNTATLN.LRAAGVEIGSRGEIIIDDYSRTTNTRIYA
AGDVTLG.PQ....FVYVAAYQGGVAAPNAIGGLNKKLNLEVVPGVTFTAPAIATVGLTEQQAKENGYEVKTSVLPLDAV
PRALVNRETTGVFKLVADSKTMKV.......LGAHVVAENAGDVIYAATLAVKFGLTVDDIRETLAPYLTMAEGLKLAAL
TFDKDISKLSCCAG
>SP|P30341|MERA_STRLI/8-474
YDLAIIGSGAGAFAAAIAARNKG...RSVVMVERGTTGGTCVNVGCVPSKALLAAAEARHGAQAASRFPGIQATEPALDF
PALISGKDTLVGQLRAEKYTDLAAEY.GWQIVHGTATFADGPMLEVALNDGGTATVEAAHYLIATGSAPTAPHIDGLDQV
D....YLTSTTAMELQQLP..EHLLILGGGYVGLEQAQLFARLGSRVTLAVRS.RLASREEPEISAGIENIFRE.EGITV
HTRT.QLRAVRR.DGEGILATLTGPDGDQQVRASHLLIATGRRSVTNGLG.LERVGVKTGERGEVVVDEYLRTDNPRIWA
AGDVTCH.PD....FVYVAAAHGTLVADNALDGAERTLDYTALPKVTFTSPAIASVGLTEAQLTEAGIAHQTRTLSLENV
PRALVNRDTRGLVKLIAERGTGKL.......LAAHVLAEGAGDVITAATYAITAGLTVDQLARTWHPYLTMAEALKLAAQ
TFTSDVAKLSCCAG
>GP|2052182|emb|CAA67451.1/97-559
LHVAVIGSGGAAMAAALKVVEGG...ARVTLIERGIIGGTCVNVGCVPSKIMIRAAHVAHLRRESPFDAGLSAMTPTVLR
ERLLAQQQDRVAELRHAKYESILESTPAISVLRGTARFQDGHTLSVKLAEGGEHIVAFDRCLVATGASAAVPPIPGLKDT
P....YWTSDQALASDTIP..KRLAVIGASVVAVELAQAFARLGSEVTILARS.AMFFHEDPAIGAAVTEAFRM.EGIEV
LEQT.QASQVSHANGEFVLATNHG.....ELRADQLLVATGRTPNTQGLN.LEAADVQLDERGGIQIDERMRTSAADIYA
AGDCTDQ.PQ....FVYVAAAAGTRAAINMTGG.EAKLNLDVMPAVVFTDPQVATVGYSEAEAQHAGIETDSRTLTLDNV
PRALANFDTRGFIKLVAEAGSGRL.......LGVQAVAPEAGELIQTAVLAIRNRMTVQELADQLFPYLTMVEGLKLAAQ
TFNKDVKQLSCCAG