HMM Seed Alignment: TIGR01943

Download Alignment

>SP|P76181|RNFA_ECOLI/2-191
TDY.LLLFVGTVLVNNFVLVKFLGLCPFMGVSKKLETAMGMGLATTFVMTLASICAWLIDTWILIPLNLIYLRTLAFILV
IAVVVQFTEMVVRKTSPVLYRLLGIFLPLITTNCAVLGVALLNINLGHNFLQSALYGFSAAVGFSLVMVLFAAIRERLAV
AD.VPAPF.RGNAIALITAGLMSLAFMGFSGLV
>OMNI|NT01MC3827/25-214
SNF.LLILISTVFVNNYVLAKFLGICPFLGVSKKVETAVGMTQAVMFVMTLASVISWLVQHYILDPLNLGYLQTISFILI
IASLVQLTEMVVHKTSPVLYASLGIFLPLITTNCAVLGVALLNIQQENNLINASFYGVGAGLGFGLVLILFAGMRERVDL
SD.VPRLF.KGSPISLINAGLMSLAFMGFAGLV
>SP|Q07396|RNFA_RHOCA/2-191
QDF.LLVLLSTALVNNVVLVKFLGLCPFMGVSRKTDAAIGMGLATTFVITVASAACWLVEALILEPLDLKFLRILSMILV
IAAIVQFIETVMRKVTPDLHKALGIYLPLITTNCAVLGLPLMYIQGHLSLAMSTLSGFGASVGFTLVLVIFAGMRERLAQ
LS.VPAAF.AGTPIAFVSAGLLGLAFMGFAGLV
>OMNI|TM0248/1-189
MKV.FLLFFSAIFVNNFVLARFLGICPFLGVSKRLETATGMGIAVTFVMTVSAAISWFLDK.LLISTGLEFLRTIVFILV
IASFVQFVELFLKKTSPDLYEALGIFLPLITTNCAILGMVLLNSLMKLNFVEAVFHALGSGLGFALALVIFAGIREKMDL
YD.LPEPF.KGTAIALITAGLLSLAFMGFQGMV
>OMNI|NTL03CP1064/1-191
MEL.FLIFIGAMLVNNFVLSQFLGICSFIGVSKKKEAAVGMGLAVTFVMVLASIISWLVYNLILDKFNITYLKTIVFVLV
IASLVQFVEMVVKKYSPSLYKALGIFLPLITTNCAVLGMAVTNVEEVYNLIQSIVHALGAAGGYMLAIVLMSFLREKIDD
NEEIHPYF.RGLPITLFTAALMSIAFLGFQGLI
>OMNI|PG0308/1-190
MEF.FMLFIAAVFVNNVVLSQFLGICPFLGVSKKVDTSIGMGAAVTFVLALATLVTFLIQKFVLDRFGLGFMQTIAFILV
IAALVQMVEIILKKVSPPLYQALGVFLPLITTNCCVLGVAILVIQKDYTLLQSFVYAISTAIGFTLAMVTFAGIREQLDM
TN.LPKAM.KGIPSALLAAGILAMAFMGFSGIA
>SP|Q8KA21|RNFA_BUCAP/2-191
KSY.FFFILSNILIDNFILVKFLGLCPFIGASNQIKQAFGISFATSFVVVVSTVLLWFVNFFILLPFDLVYLRIIVYMLI
ISFGVQLIEIILRGTSPILYRILGIFLPLITTNCAVLAIPLFSLYLNHTFLESILYAVSASFGFTLVMVIFSSIRERILL
SD.VPLAF.QGSPIVLITVSLISIVFMGFKGLV
>OMNI|NTL02MA0651/5-196
AESLFTIFLEGVFIKNFLLIQFLGLCSFVGVTKDLKSASGMSGAVVFVMAMAATVSFALYNFILVPLKLEFLRTIAFIVV
IAALVQLVEFIVRKHVPALYRSLGIYLPLITTNCAVLGAVLLNVMNDYDLAQSVVFGVAAGLGYTVAMLMMAAIRERSDL
VE.VPKSVGRGVTYAFFIATIMSMSFVNFFGVI