HMM Seed Alignment: TIGR01830

Download Alignment

>SP|O07399|FABG_MYCAV/26-252
VLVTGGNRGIGLAIAQRLAAEAHKVAVTHR.....GSGAPDGLFG........VECDVTDNDAVDRAFTEVEEHQG.PVE
VLVSNAGISKDAFLIRMTEERFTEVINANLTGAFRVTQRAARSMQKKR.FGRIIYIGSVSGMWGIGNQANYAAAKAGLIG
MARSISRELSKAGVTANVVAPGYIDTEMTRALDERIQAGALEFIPAKRVGTAAEVPGAVSFLAS.EDASYIAGAVIPVDG
GMG
>OMNI|NTL02SC1723/5-231
VLVTGGNRGIGLAIARAFADAGDKVAITYR.....SGEPPEGFLA........VKCDITDTEQVEQAYKEIEETHG.PVE
VLIANAGVTKDQLLMRMSEEDFTSVVETNLTGTFRVVKRANRAMLRAK.KGRVVLISSVVGLLGSAGQANYAASKAGLVG
FARSLARELGSRNITFNVVAPGFVDTDMTKVLTDEQRANIVSQVPLGRYARPEEIAATVRFLAS.DDASYITGAVIPVDG
GLG
>OMNI|CT2116/7-244
AVVTGAARGIGQSIALDLAAKGADLVIGDI.KAEWLTETEEALKQ.LGAKVSCKELDVTSTDACQKVFDEVAKENG.RID
ILVNNAGITRDGLLMRMSEEDWDAVLTVNLKGVFNCTKAVTRTMMKQR.SGSIINIASIIGLMGNAGQANYAASKGGVIA
FTKSIARELASRNVRANAIAPGFISSKMTDALSEEVRQKMLEAIPLGVFGTPQHVADAVAFLAS.DQSAYITGQVLSVNG
GMY
>OMNI|NTL01FN1070/13-242
AVVTGSARGIGRAIVEKLAAHGAKMVIS........CDMGETSYE.QG.NVVHKILNVTDREAIKAFVDEVEKEYG.KID
ILVNNAGITKDGLLMRMTEDQWDAVINVNLKGVFNMTQAVSRSMLKAR.KGSIITLSSVVGLHGNAGQTNYAATKGGVVA
MSKTWAKEFGGRNVRANCVAPGFIQTPMTDVLSEDTIKGMLDATPLGRLGQVEDIANTVLFLAS.DESSFITGEVISVSG
GLM
>OMNI|PG1239/9-247
ALITGAGRGIGRAIAYKYATEGADVAITDLNIDEGVQAFVEELKG.LGVRAAAYASNAADFDAAHTVVEQIKADFG.RID
ILVNNAGITRDGLMMRMTEQQWDAVINVNLKSAFNMIHAVTPIMMGQR.TGSIINMASVVGVSGNAGQSNYSASKAGMIG
LAKSVAKELGSRGVRANAIAPGFIITDMTAVLSEEVKKQWAAQIPLRRGGTPEDVANVATFLGS.DLSSYVTGQVVHVCG
GMN
>OMNI|NTL01BH3902/8-245
AMITGAGRGIGAATAKKFAREGAKVIVCDVREEE.VAKTVAEIQD.GGGEALGSVVDVTQRKDVKNVINQVIERFE.TLD
VVVNNAGITADAQLTNMTDAQWDDVIDVNLKGVFIVTQEVTTIMKEQK.RGVILNASSVVGSYGNFGQTNYAASKWGVNG
MTKTWAKELGRYNIRVNAVAPGFILTPMTEKMPEKVLKVMEEKAVLNRLGTVEEVANGYAFLAS.DEASFITGTILAIDG
GVV
>SP|Q9X248|FABG_THEMA/8-245
CLITGAASGIGKATTLLFAQEGATVIAGDISKEN.LDSLVKEAEG.LPGKVDPYVLNVTDRDQIKEVVEKVVQKYG.RID
VLVNNAGITRDALLVRMKEEDWDAVINVNLKGVFNVTQMVVPYMIKQR.NGSIVNVSSVVGIYGNPGQTNYAASKAGVIG
MTKTWAKELAGRNIRVNAVAPGFIETPMTEKLPEKARETALSRIPLGRFGKPEEVAQVILFLAS.DESSYVTGQVIGIDG
GLV
>SP|P38004|FABG_CHLTR/9-247
AIVTGGSRGIGFSIAKLFAEQGANVQIWGINGEAG.QAAAQTLSEQTGRQVSFALVDVSKNDMVSAQVQNFLAEYN.TID
VIVNNAGITRDALLMRMSEEEWSSVINTNLGSIYNVCSAVIRPMIKAR.SGAIINISSIVGLRGSPGQTNYAAAKAGIIG
FSKALSKEVGSKNIRVNCIAPGFIDTDMTKSLNDNLKNEWLKGVPLGRVGMPEEIAKAALFLAS.DGSSYITGQVLSVDG
GMA
>SP|P51831|FABG_BACSU/7-245
AIVTGASRGIGRSIALDLAKSGANVVVNYSGNEAKANEVVDEIKS.MGRKAIAVKADVSNPEDVQNMIKETLSVFS.TID
ILVNNAGITRDNLIMRMKEDEWDDVININLKGVFNCTKAVTRQMMKQR.SGRIINVSSIVGVSGNPGQANYVAAKAGVIG
LTKSSAKELASRNITVNAIAPGFISTDMTDKLAKDVQDEMLKQIPLARFGEPSDVSSVVTFLAS.EGARYMTGQTLHIDG
GMV
>OMNI|NTL01TT1377/8-246
AFVTGGSRGIGRAIAVRLAKDGFNIAITYVKDDKSAEEVVEEVKK.HGVDALAIKCDVSKYHEVEKAVEKVIEEFG.SID
VVVNNAGITKDNLILKMEEEEWDQVIDVNLKGAFNVIKFASKYMIKKR.KGKIINISSVVGLMGNVGQANYAASKAGIIG
LTKSVAKELASRGITVNAVAPGFIETDMTNVLKEDIKEAMLKSIPLKRAGKPEEVAEVVAFLAS.SASDYITGQVINVDG
GMV
>OMNI|NTL03CP1070/7-245
AIVTGGTRGIGRAIALKLADQGANIVINYRNSDKEAEELKAILEE.KGVKVLTVKCDISNFEDSKNLMDKCKEVFG.KID
ILVNNAGITKDTLIMRMKEEDFDNVIDVNLKGTFNCAKHASAIMLKQR.FGKIINMTSVVGIAGNAGQVNYSASKAGVIG
LTKSLAKELGSRGITVNAVAPGFINTDMTASLSEKVKEEASKNIPLKRLGDPEDVANLVGFLAS.DAANYITGQVINVDG
GMV
>OMNI|DR1943/14-252
ALVTGSSRGLGRAMALRLAQDGFTVAVHYGRGEAEAQQVAADIRA.AGGAAQVFGADLSQPANAGTLVEDVIAALG.RLD
VLVNNAGITRDGLAIRMKDEDWDAVLQTNLSSAFAACRAALKHMMKNR.SGRIVNVSSVVALAGNPGQANYVASKAGLIG
LTRALAKEYGGRGITVNAIAPGFIESDMTAKLPEDTKKQYQANIPLARFGQPEEVAALVAFLAS.EGAGYITGQTIGVDG
GMN
>SP|P33207|FABG_ARATH/79-318
VVITGASRGIGKAIALALGKAGCKVLVNYARSAKEAEEVAKQIEE.YGGQAITFGGDVSKATDVDAMMKTALDKWG.TID
VVVNNAGITRDTLLIRMKQSQWDEVIALNLTGVFLCTQAAVKIMMKKK.RGRIINISSVVGLIGNIGQANYTATKGGVIS
FSETPAREGASRNINVNVVCPGFIASDMTAELGEDMEKKILGTIPLGRYGKAEEVAGLVEFLALSPAASYITGQAFTIDG
GIA
>OMNI|NTL01LL0787/8-242
VFVTGSTRGIGKAIALQFAKAGSNLIINGR..SAISEELLAEFTA.YGVKAVGISGDISKSEDAKQMVAEAIETLG.SVD
ILVNNAGITRDGLSLKMSEEDFESVLKINLTGAFNMTQAVLKPMTRAR.SGAIINISSVVGLMGNAGQANYAASKAGLIG
LTKSIAREVAARNVRVNAVAPGFIESDMTEVLSDKVKDAMKGQIPMKRFGMPEEIATATQFLAE...QEYMTGQVLTIDG
GVS
>OMNI|EF2881/8-242
VFITGSTRGIGKAVALAFAKEGANIVLNGR..SEITPEQRQEIEA.FGVKCIGLSGDISDFDAAGEMIQATVDQLG.SID
ILVNNAGITNDKLLLRMTKEDFNACLDINLVGTFNMTQQAVKRMMKQR.SGRIINMASVSGLMGNVGQANYAASKAGVVG
FTKSVAREVAPRGITCNAIAPGFIQTEMTDVLSEKVKTQMNAQIPLQTFGQVEDVAATAIFLAK...SPYITGQVVNVDG
GLV
>GP|23505129|emb|CAD51911.1/63-300
ALVTGAGRGIGREIAKMLAKSVSHVICISRTQ.KSCDSVVDEIKS.FGYESSGYAGDVSKKEEISEVINKILTEHK.NVD
ILVNNAGITRDNLFLRMKNDEWEDVLRTNLNSLFYITQPISKRMINNR.YGRIINISSIVGLTGNVGQANYSSSKAGVIG
FTKSLAKELASRNITVNAIAPGFISSDMTDKISEQIKKNIISNIPAGRMGTPEEVANLACFLSS.DKSGYINGRVFVIDG
GLS
>SP|O67610|FABG_AQUAE/10-248
SLVTGSTRGIGRAIAEKLASAGSTVIITGTSG.ERAKAVAEEIANKYGVKAHGVEMNLLSEESINKAFEEIYNLVD.GID
ILVNNAGITRDKLFLRMSLLDWEEVLKVNLTGTFLVTQNSLRKMIKQR.WGRIVNISSVVGFTGNVGQVNYSTTKAGLIG
FTKSLAKELAPRNVLVNAVAPGFIETDMTAVLSEEIKQKYKEQIPLGRFGSPEEVANVVLFLCS.ELASYITGEVIHVNG
GMF
>GP|15824101|dbj|BAB69268.1/74-312
ALVTGGSRGIGRAVVARLASDGYDIGFCYRSDDQAAALVEKEVRE.LGRRVLSRRVDVTDRTQVREFVTAAEEELG.PAS
AVVTSAGITRDSPLVLMPDEDWDAVLRTNLDGTYNLCRAVAFPMIK.RGGGAVVTLSSVAGVAGNAGQTNYSASKSGIIG
FTRSLAKEGGRHGIRANSVAPGFIDTDMTSELPPKVAKEMLGRIPLKRFGRPEDVAALVAFLLS.SEAAYITGQVFQVDG
GIA
>OMNI|NTL01CJ00410/8-246
VLITGASKGIGASIAKTLAGFGLKVWINYRSKPELADALKDEIIA.SGGVAAVIKFDASKEDEFENGVKTIVESDG.ELS
YLVNNAGVTNDKLALRMKLEDFSGVVDTNLSSAFLGCREALKTMSKKR.FGAVVNIASIVGEMGNAGQVNYSASKGGMIA
MTKSFAKEGASRNLRFNCVTPGFIKSDMTEVLSNEIKQTYQDNIPLKRFAEPEEVANCVAFLLS.DYASYVTGDVLKING
GLY
>SP|O54438|FABG_PSEAE/8-245
ALVTGASRGIGQAIALELGRLGAVVIGT.ATSASGAEKIAETLKA.NGVEGAGLVLDVSSDESVAATLEHIQQHLG.QPL
IVVNNAGITRDNLLVRMKDDEWFDVVNTNLNSLYRLSKAVLRGMTKAR.WGRIINIGSVVGAMGNAGQTNYAAAKAGLEG
FTRALAREVGSRAITVNAVAPGFIDTDMTRELPEAQREALLGQIPLGRLGQAEEIAKVVGFLAS.DGAAYVTGATVPVNG
GMY
>OMNI|NTL01RS1052/10-247
ALVTGASRGIGRAIALELARQGATVVGT.ATSEAGAQAISAYFAE.AGVKGAGVVLNVNDAARCEAVIDEAIKTHG.GLN
ILVNNAGITQDNLAMRMKDDEWMAVIDTNLSAVFRLSRAVLRPMMKAR.GGRIINITSVVGSAGNPGQANYAAAKAGVEG
MARAMAKEIGSRNITVNSVAPGFIDTDMTKVLSDEQHTALKAQIPLGRLGMPEDIANAVAFLAS.PAAGYITGATLHVNG
GMY
>OMNI|NT01MC2391/6-243
AIVTGSTAGIGQEAAKLLAKRGCRVVIT.GTRETKIMETVEAIRA.EGGVAAGVAANIGVDADLDKLVAFAQEQFG.EVE
ILVNNAGITRDNLFMRMKDEEWDEVMALNLTSVFKLSKRVIRAMMKGR.YGRIVNVTSVVGFSGNAGQANYTAAKAGLVG
FTKSLAQEVATRGITVNGVAPGFIQTAMTDKLNEKTQEAILAQIPMGKMGSVEDIAAAIAFLAS.DEARYITGETIHVNG
GMY
>OMNI|CC1675/9-244
ALVTGATGGIGGAIARALHAQGAHVVLS.GTRESALAELKAELGE.R...ASTVVANLSDAEQVDGLVAKAEEAAGAPLD
IVIANAGVTRDGLIVRMKDEDWDTVIKVNLEGYFRLSRAAAKGMMKRR.AGRIIGITSIVGVTGNPGQTNYAASKAGMIG
FSKALAQELASRGVTVNCVAPGFIASPMTDALNEQQKAGILSTIPAGKLGEGADIAAACVYLAS.DQAGYVTGQTLHVNG
GMA
>SP|P06234|NODG_RHIME/9-243
ALVTGASGAIGGAIARVLHAQGAIVGLH.GTQIEKLETLATELGD.R...VKLFPANLANRDEVKALGQRAEADLEG.VD
ILVNNAGITKDGLFLHMADPDWDIVLEVNLTAMFRLTREITQQMIRRR.NGRIINVTSVAGAIGNPGQTNYCASKAGMIG
FSKSLAQEIATRNITVNCVAPGFIESAMTDKLNHKQKEKIMVAIPIHRMGTGTEVASAVAYLAS.DHAAYVTGQTIHVNG
GMA
>GP|15620312|gb|AAL03721.1/16-246
SLITGASGGIGGAIARLLHKLGSHVIIS.GSNEEKLQSLGKVVKD.N...YTIEVCNLADKEECRNLISKASK.....LD
ILVCNAGITSDTLAIRMKDEDFDKVIDINLKANFILNREAIKKMIQNR.YGRIINISSIVGISGNPGQANYCASKAGLIG
MTKSLSYEVATRGITVNTVAPGFIKSDMTDKLNEKQREAIVQKIPLGTYGMPEDVAHAVAFLAS.DQASYITGQTIHVNG
GML
>SP|P57432|FABG_BUCAI/8-242
AFITGANQGIGKAIAKKLIKKGIQVIGT.STTEDGVKRINDYLEG.N...GFGFVLNLKNIDSITEKIQEIYKKKH.SID
ILINNAGIKEDNLLVNMKSTEWDDVIKTNLSSVFHLVKSVIRSMIKKR.QGRIITIGSVIAYTGNKGQVNYSASKSGLIG
FHKSLALEVASKGITVNIVSPGLIKTNFTEKLNSIQYQKYLSNIPMKRFGQKEEVADAVIFLAS.KKASYITGHTLHVNG
GMY