HMM Seed Alignment: TIGR01648
Download Alignment>GP|8574043|emb|CAB94755.1/2-586
ESNHKSG......DG.....LSGTQKEAALRALVQRTGYSLVQENGQRKYGGPPPG..WDAAPPERGCEIFIGKLPRDLF
EDELIPLCEKIGKIYEMRMMMD.FNGNNRGYAFVTFSNKVEAKNAIKQLNNYEIRNGRLLGVCASVDNCRLFVGGIPKTK
KREEILSEMKKVTEGVVDVIVYPSAADKTKNRGFAFVEYESHRAAAMARRKLLPGRIQLWGHGIAVDWAEPEVEVDEDTM
SSVKILYVRNLMLSTSEEMIEKEFNNIKPGAVERVKKIRDYAFVHFSNREDAVEAMKALNGKVLDGSPIEVTLAKPVDKD
SYVRYTRGTGGRGTMLQGEYTYSLGQVYDPTTTYLGAPVFYAPQTYAAIPSLHFPATKGHLSNRAIIRAPSVRG...AAG
VRGLGG.....RGYLAYTGLGRG..YQVKGDKREDKLYDILPG..MELTPMNPVTLKPQGIKLAPQILEEICQ.KNNWGQ
P.VYQLHSAIGQDQRQLFLYKITIPALASQNPAI.HPFTPPKLSAFVDEAKTYAAEYTLQTLG.IPTDGGD.GTMATAAA
AATAFPGYAVPNATAPVS..AAQLKQAVTL.......GQDLAAYTTYEVYPTFAVTARGDGYG.TF
>GP|15488668|gb|AAH13481.1/11-590
NSDPTVGSSTKVPEG.....VAGAPNEAALLALIERTGYTMVQENGQRKYGGPPPG..WEGPHPQRGCEVFVGKIPRDVY
EDELVPVFETVGRIYELRLMMD.FDGKNRGYAFVMYCHKHEAKRAVRELNNYEIRPGRLLGVCCSVDNCRLFIGGIPKMK
KRGEILEEIAKVTEGVLNVIVYASAADKMKNRGFAFVEYESHRAAAMARRKLMPGRIQLWGHQIAVDWAEPEIDVDEDVM
QTVKILYVRNLMIETTEETIKKSFGQFNPGCVERVKKIRDYAFVHFTSREDAVHAMNNLNGTELEGSCLEVTLAKPVDKE
QYSRYQKAAKGGGGSAEAVAQ.QPSYVYSCDPYTLAYYGYPYNALIG..PNRDYFVKTGSIRGRGRGAAGN.R....TPG
PRGSYL.....GGYSAGRGIYSR..YHEGKGKQQEKGYELVPN..LEISPVNPVAIKP.GTVAIPAIGAQYSMF.QAAPA
P.......KIIEDGKIHTMEHMISPIAVQPDPATAAAAAAAAAAAAVIPAVSTPPPFQGRPITPVYTVAPNVQRIPTAGI
YGASYVPFAAP.ATATIAT.LQKN.AAAAV.......YGGYAGYIPQAFPAA.LQVPIHDVYQ.TY
>SP|O43390|ROR_HUMAN/106-628
RQREKQG..SKVQES.....TKG.PDEAKIKALLERTGYTLDVTTGQRKYGGPPPDSVYSGVQPGIGTEVFVGKIPRDLY
EDELVPLFEKAGPIWDLRLMMDPLSGQNRGYAFITFCGKEAAQEAVKLCDSYEIRPGKHLGVCISVANNRLFVGSIPKNK
TKENILEEFSKVTEGLVDVILYHQPDDKKKNRGFCFLEYEDHKSAAQARRRLMSGKVKVWGNVVTVEWADPVEEPDPEVM
AKVKVLFVRNLATTVTEEILEKSFSEF..GKLERVKKLKDYAFVHFEDRGAAVKAMDEMNGKEIEGEEIEIVLAKPPDKK
............RKERQAARQ.........ASRSTAYEDYYYHPP.........PRMPPPIRGRGRGGG...R......G
GYGYPP...DYYGYEDYYDDYYGYDYHDYRGGYEDPYYGYDDG........YAVRGRGGGRGGRGAPPPPRGR...GAPP
P...........RGR..........AGYSQRGAP...LGPPRGS...RGGRGGPAQ.QQRGRG.SRGSRGN..RGGNVGG
KRKA.DGYNQPDSKRRQTN.NQQNWGSQPIAQQPLQQGGDYSGNYG...YNN....DNQEFYQDTY