HMM Seed Alignment: TIGR01347

Download Alignment

>SP|P07016|ODO2_ECOLI/3-404
VDILVPDLPESVADATVATWHKKPGDAVVRDEVLVEIETDKVVLEVPASADGILDAVLEDEGTTVTSRQILGRLRE....
.....GNSAGKETSAKS.EEKASTPAQRQQA.....SLEEQNN...........DALSPAIRRLLAEHNLDASAIKGTGV
GGRLTR.EDVEKHLAK.....APAKESAPAAAA.PAAQPALAARSEKRVPMTRLRKRVAERLLEAKNSTAMLTTFNEVNM
KPIMDLRKQYGEAFEKRH.GIRLGFMSFYVKAVVEALKRYPEVNASIDG..DDVVYHNYFDVSMAVSTPRGLVTPVLRDV
DTLGMADIEKKIKELAVKGRDGKLTVEDLTGGNFTITNGGVFGSLMSTPIINPPQSAILGMHAIKDRPMAVN.GQVEILP
MMYLALSYDHRLIDGRESVGFLVTIKELLEDPTRLLLDV
>GP|39283|emb|CAA36678.1/3-399
IDIKAPTFPESIADGTVATWHKKPGEPVKRDELIVDIETDKVVMEVLAEADGVIAEIVKNEGDTVLSGELLGKLT.....
.....EGGAATAAPAA...APAPAAAAPAA........AEAP.............ILSPAARKIAEENAIAADSITGTGK
GGRVTK.EDAVAAAEAKKS.APAGQPAP.AATAAPLFA..AGDRVEKRVPMTRLRAKVAERLVEAQSSMAMLTTFNEVNM
KPVMELRAKYKDLFEKTHNGVRLGFMSFFVKAAVEALKRQPGVNASIDG..NDIVYHGYQDIGVAVSSDRGLVVPVLRNA
EFMSLAEIEGGINEFGKKAKAGKLTIEEMTGGTFTISNGGVFGSLLSTPIVNPPQTAILGMHKIQERPMAVN.GQVVILP
MMYLALSYDHRLIDGKEAVTFLVTMKDLLEDPARLLLDV
>OMNI|CC0340/2-402
ADINTPALGESVTEATVARWTKKVGEAVKKDEILVELETDKVSLEVASPADGVLSAIGAAEGATVVPGTVLGVVAEGAT.
.....ASAAPAAAPAPKAEAPKP...APAAP.....APAAAPAA..........APVSPAPARIAAESGLDLSKVAGTGK
DGRVTK.GDALAALEAR...ASAPAPAAAAAAPRALHE......REERVKMTRLRQTIARRLKEAQNSAAMLTTFNEVDM
SAVMALRAQYKDVFEKQH.GVKLGFMSFFVKAVVAALKAIPDVNAEIDG..QDVIYKNHYDIGVAVGTDKGLVVPVVRDA
DALNLAGIEKTIGDLGKRARNGQLAIEDMQGGTFTITNGGIYGSLMSTPILNAPQSGILGMHAIKERPMVIN.GKIEIRP
MMYLALSYDHRIVDGAGAVTFLVKVKEAIEDPQRLLLEL
>OMNI|NTL01XF01550/3-391
IEVKVPVLPESVSDATIASWHKKAGEIVKRDENIVDLETDKVVLEVPSPVDGVLKEIKFDTGSTVTSNQVLAIIEE....
.....GSIVAAPSPAPSPVIDQKPVAVSAPA.....AKSSVDS.............LPPGARFTATTEGIDPAQIEGSGR
RGAVTK.EDIINFAKQ.....NGAARAS.............GTRLEERVPMTRIRQRIAERLMQSKNSTAMLTTFNEINL
AKVSNIRKELQEEFQKAH.GIKLGFMSFFVKAAANALQRFPLVNASIDG..TDIIYHGYSDISIAVSTDKGLVTPVLRNV
ERMSFADIEHHIADYAKKARDGKLSLEELQGGTFTVTNGGTFGSLLSTPIVNPPQSAILGMHTIKERPIAEN.GHIVIAP
MMYVALSYDHRIIDGKDSVQFLVDIKNQLEAPGRMLFGL
>OMNI|NTL01BH2208/2-411
IEIKVPELAESITEGTIAQWLKKVGDHVSQGEYIAELETDKVNVEITAEHSGVIQELKREEGDTVEVGEVIAVLAEGD..
........SPTASTEQAEAPKEEKKVSTVA...SEEAAPAPGNR..........PVASPAARKLAREKGIDLEAVPTADP
LGRLRK.QDVASYEEKPA.ASAPAKAPEKKAAPAAANV.ESPGKPVERIKMSRRRQTIAKRLVEAQQTAAMLTTFNEVDM
SAVMELRKRRKDQFFEKHD.VKLGFMSFFTKAVIGALKEFPLLNAEIQG..DEILLKKYYDIGIAVSTDEGLVVPVVRDA
DRLGFAGIEREIMHLGKKARENKLSLSELQGGTFTITNGGVFGSLWSTPILNAPQVGILGMHKIQWRPVAIDEENFENRP
MMYIALSYDHRIVDGKEAVSFLVRVKEMLEDPESLLLDS
>OMNI|NTL01SA1292/2-422
PEVKVPELAESITEGTIAEWLKNVGDSVEKGEAILELETDKVNVEVVSEEAGVLSEQLASEGDTVEVGQAIAIIGEGSGN
ASKENSNDNTPQQNEETNNKKEETTNNSVDKAEVNQANDDNQQR..........INATPSARRYARENGVNLAEVSP.KT
NDVVRK.EDIDKKQQAPA.STQTTQQAPAKEEKKYNQY.P..TKPVIREKMSRRKKTAAKKLLEVSNNTAMLTTFNEVDM
TNVMELRKRKKEQFMKDHDGTKLGFMSFFTKASVAALKKYPEVNAEIDG..DDMITKQYYDIGVAVSTDDGLLVPFVRDC
DKKNFAEIEAEIANLAVKAREKKLGLDDMVNGSFTITNGGIFGSMMSTPIINGNQAAILGMHSIITRPIAIDQDTIENRP
MMYIALSYDHRIIDGKEAVGFLKTIKELIENPEDLLLES
>SP|P36957|ODO2_HUMAN/71-453
VTVKTPAFAESVTEGDVR.WEKAVGDTVAEDEVVCEIETDKTSVQVPSPANGVIEALLVPDGGKVEGGTPLFTLR.....
........KTGAAPAKAKPAEAP.AAAAPKA.....EPTAAAVP..........PPAAPIPTQ..MPPVPSPSQPPSGKP
.......VSAVKPTVAPP...LADAGAG....KG........LRSEHREKMNRMRQRIAQRLKEAQNTCAMLTTFNEIDM
SNIQEMRARHKEAFLKKH.NLKLGFMSAFVKASAFALQEQPVVNAVIDDTTKEVVYRDYIDISVAVATPRGLVVPVIRNV
EAMNFADIERTITELGEKARKNELAIEDMDGGTFTISNGGVFGSLFGTPIINPPQSAILGMHGIFDRPVAIG.GKVEVRP
MMYVALTYDHRLIDGREAVTFLRKIKAAVEDPRVLLLDL
>SP|P19262|ODO2_YEAST/74-463
TSIEVPPMAESLTEGSLKEYTKNVGDFIKEDELLATIETDKIDIEVNSPVSGTVTKLNFKPEDTVTVGEELAQVE.....
........PGEAPAEGSGESKPE.PTEQAEP.....SQGVAARE..........NSSEETASK..KEAAPKKEAAPKKEV
TEP..KKADQPKKTVSK.....AQEPPVASNSFTP..F....PRTETRVKMNRMRLRIAERLKESQNTAASLTTFNEVDM
SALMEMRKLYKDEIIKKT.GTKFGFMGLFSKACTLAAKDIPAVNGAIEG..DQIVYRDYTDISVAVATPKGLVTPVVRNA
ESLSVLDIENEIVRLSHKARDGKLTLEDMTGGTFTISNGGVFGSLYGTPIINSPQTAVLGLHGVKERPVTVN.GQIVSRP
MMYLALTYDHRLLDGREAVTFLKTVKELIEDPRKMLLW.
>OMNI|NTL01BA00290/4-420
INILVPDLPESISDATVVKWHKKIGDTVHCDDNIVDIETDKVMLEVSSPCDGILQSILEKEGKVVISQQTLGEINK....
.....STVVDNHLSNNHIIEKEDNLLKKEEK.....YITTEEKKEIEYLLKDNHKHLTPSMRRSVKIHNINNGFLNQVIE
TSKKTNFENIIKEEKK....ESNQILFNHNIFNANENNKNNNNKVTNRVKMTRLRQRIAERLLDSKNNTAMLTTFHEVNM
KPIILLRKKYGEDFEKKH.NVRIGFMSFFVKAVIQALKNFPEINAYIDQ..TDIVFYKNFDISIAISTPRGLITPVIRNA
DTMTMAEIEKKIKDFSIKGLQNKINIKELMGGNFTITNGGVFGSLMSTPIINPPQTAILGMHVIQERPVVVN.GQIKILP
MMYLALSYDHRLIDGKESVGFLINIKNILEDFNRIAIDV