HMM Seed Alignment: TIGR01193

Download Alignment

>SP|Q10418|MESD_LEUME/16-722
QVDERDCGVAALAMILAHYKTRLSLAKLRDLAKTDMEGTTALGIVKAANALDFETMPIQADLSLFDKKDLPYPFIAHVIK
EGKYPHYYVVYGMKGDQLLIADPDNTVGKTKMTKAHFNEEWTGVSIFIAPNPTYKPTKEKKRSLTSFIPVITRQKLLVIN
IVIAALLVTLVSILGSYYLQGIIDTYIPNNMKNTLGIVSLGLIFAYVIQQLLSYARDYLLIVMGQRLSIDIILSYIKHIF
ELPMSFFATRRTGEIVSRFTDANAIIEALASTMLSVFLDLGILVIVGTVLVVQNSTLFLISLIAIPAYALVVWLFMRPFS
KMNNDQMQAGSMLSSSIIEDINGVETIKALNSEATAYHKIDHEFVTYLEKSFVYAKTEAVQNAIKSLLQLSLNVVILWVG
AQLVMTNKISVGQLITYNALLGFFTDPLQNIINLQTKLQQASVANNRLNEVYLVDSEFKDSHQMTEKITPNSSLVADHIT
YKYGFGAPAIDDVSLTITAGEKIALVGISGSGKSTLVKLLVNFF..QPESGTISLGPTPLANLDKHELRGHINYLPQEPF
IFSGSIMENLLLGAKPGTTQEDIIRAVEIAEIKDDIEKMSQGFGTELA.ESGNISGGQKQRIALARAILVDSPVLILDES
TSNLDVLTEKKIIDNLMKLTEKTIIFVAHRLTISQRVDRILTMQSGKIIEDGTHDTLLKAGGFYASLFNH
>SP|Q00564|LCNC_LACLA/11-715
QVDEMDCGCAALSMILKSYGTEKSLASLRLLAGTTIEGTSALGIKKAAEILEFSVQALRTDASLFEMKNAPYPFIAHVIK
DQKYPHYYVITGANKNSVFIADPDPTIKMTKLSKEAFLSEWTGISLFLSTTPSYHPTKEKASSLLSFIPIITRQKKVILN
IVIASFIVTLINILGSYYLQSMIDSYIPNALMGTLGIISVGLLLTYIIQQVLEFAKAFLLNVLSQRLAIDVILSYIRHIF
QLPMSFFSTRRTGEITSRFSDASSILDAIASTILSLFLDLTIVVMTGLILGLQNMQLFLLVLLAIPLYIVVIIIFTPLFE
KQNHEVMQTNAVLNSSIIEDINGIETIKALASEQERYQKIDYEFASYLKKAFTLQKSEAIQGLIKAIIQLTLSVTILWFG
ATLVISQKITLGQLITFNALLSYFTNPITNIINLQTKLQKARVANERLNEVYLVPSEFEEKK..TELSLSHFNLNMSDIS
YQYGFGRKVLSEIELSIKENEKLTIVGMSGSGKSTLVKLLVNFF..QPTSGTITLGGIDLQQFDKHQLRRLINYLPQQPY
IFTGSILDNLLLGANENASQEEILKAVELAEIRADIEQMQLGYQTELSSDASSLSGGQKQRIALARALLSPAKILILDEA
TSNLDMITEKKILKNLLPL.DKTIIFIAHRLSVAEMSHRIIVVDQGKVIESGSHVDLLAQNGFYEQLYHN
>SP|P36497|PEDD_PEDAC/13-722
QVDENDCGLAALNMILKYYGSDYMLAHLRQLAKTTADGTTVLGLVKAAKHLNLNAEAVRADMDALTASQLPLPVIVHVFK
KNKLPHYYVVYQVTENDLIIGDPDPTVKTTKISKSQFAKEWTQIAIIIAPTVKYKPIKESRHTLIDLVPLLIKQKRLIGL
IITAAAITTLISIAGAYFFQLIIDTYLPHLMTNRLSLVAIGLIVAYAFQAIINYIQSFFTIVLGQRLMIDIVLKYVHHLF
DLPMNFFTTRHVGEMTSRFSDASKIIDALGSTTLTLFLDMWILLAVGLFLAYQNINLFLCSLVVVPIYISIVWLFKKTFN
RLNQDTMESNAVLNSAIIESLSGIETIKSLTGEATTKKKIDTLFSDLLHKNLAYQKADQGQQAIKAATKLILTIVILWWG
TFFVMRHQLSLGQLLTYNALLAYFLTPLENIINLQPKLQAARVANNRLNEVYLVESEFSKSREITALEQLNGDIEVNHVS
FNYGYCSNILEDVSLTIPHHQKITIVGMSGSGKTTLAKLLVGFFEPQEQHGEIQINHHNISDISRTILRQYINYVPQEPF
IFSGSVLENLLLGSRPGVTQQMIDQACSFAEIKTDIENLPQGYHTRLSESGFNLSGGQKQRLSIARALLSPAQCFIFDES
TSNLDTITEHKIVSKLLFMKDKTIIFVAHRLNIASQTDKVVVLDHGKIVEQGSHRQLLNYNGYYARLIHN
>GP|18093683|emb|CAD20391.1/14-720
QVDEDDCGIAALNMIFKNFGSEYSLSKLRFLAKTSQQGTTIFGLIKAAEELNLEANALQADMGIFKDENLMLPIIAHVLK
QGKVLHYYVVFDVSKDFLIIGDPDPTIGITEISKKDFENEWTGNFITFSKGKNFVSEKQRNNSLLKFIPILRQQKSLIFW
IAFAAILLMIISIAGSLFLEQLVDIYIPHKNMDTLGIISICLIGAYLLQAVMTYFQNFLLTIFGQNLSRKIILNYINHLF
ELPMSFFSTRRVGEIVSRFTDASKIIDALASTILTLFLDVWMLVTISIVLVFLNTKLFMISLVSIPVYSVIIYAFKNTFN
GLNHKSMENAALLNSAIIENVTGIETVKSLTSEEFSYNQITDRFENFLNSSLRYTIADQGQQALKVGLKLILIVFILWAG
AIQVMRGNLTVGRLLAFNALVTYFLNPLENIINLQPKLQTARVANIRLNEVLLVDSEFNRGG.RDSSTNLNGDIVFQDVE
FSYGYGSNVLHNINIKIQKNSSTTIVGMSGSGKSTLAKLMVGFY..QAGSGQILLNGKLIDNIDRHALRQSITYVPQEPV
MFAGTILENLIMQNKRNLSIDKVKEACRIAEIDKDIENFPMGYDTDISEHGSSISVGQKQRLSIARSLLTESNVLLFDES
TSSLDTITEQRIIENLLNLNDKTLIFVAHRLSVAKQTENIIVMDHGGIVETGSHDKLILENGYYKELCTV
>GP|3849842|emb|CAA11805.1/8-714
QVDNKDCGIAALSMIMKKYNTNISLSKLRQLAHTDLNGTTVLGLTKAAEYFKFETKVINANENFLEDNTFEAPFIVHVVK
NEILAHYYVIYEITKNHILVADPDSDVGIFKMKKEDFYEQWTGIAMFIFPSLEYTPISLKENSFKKFFPLILEKKKLVVI
TFIAAIIVLIIQIASTFYLQKIIDVYIPQKMNGTITIISLGMIIIYIYQQIFSFIQINSMNQLSQSLTSDIVLTYIKHVL
KLPMSFFSTRRTGEIISRFTDVSSIVDAISSVIISIFLDMSMIIIVSFFLLRQNMLLFCLILLSIPVYAIIIISFFRPFK
KLSTDAMQANSIMSSSIIEDLNGISTIKSLGVEDERFSKIESEFGDYLNKEFKNIQTRYVQMALKTVTNLILNVVVLWTG
SYLVITGKVTLGQVITFSLLISYFLTPLENIINLQPKLQAAKVAYNRLNEVYLVNGEEINKKK.SYTNNLLGDIQINKLS
YSYGLNDEILSDITLQIKMNSVTCLVGPSGSGKTTLAKLLVKFY..DARHGEILLNGFSLKDIDIGTLRQFINYLPQDPY
IFDGTILDNLLIGAKEKVEEDELWAVLDIVEIKDEIKKMPLGLQTSLSVENTTISGGQKQRIALARTLLTDSKVLVLDEV
TSQLDLLLERKIVNNLVNIQHKTIIFIAHRLEVAKKSDKIIALSEGKVIEQGEYKELIDRKGFFYSLIHA