HMM Seed Alignment: TIGR01123

Download Alignment

>OMNI|DR1626/49-358
WDAGTLTEDNQIHLAEGSTALHYGQQCFEGLKAYRCADGSINLFRPDQNAARMRMSCRRLLMPELSDEQFIDACLQVVRA
NEHFLPPYGTGGSLYLRPFVIGVGDNIGVRTAP..EFIFSVFCVPVGPYFKGG.LTP..TNFITSDYDRAAPHGTGAAKV
GGNYAASLLP.GYEAKK....RDFADVIYLDPATHTTIEEAGAANFFAITQDG...QKFVTPQSPSILPSITKYSLLWLA
EHRLGLEVEEGDIRIDELGKFSEAG......ACGTAAVITPIGGIQHGDDFHVFYSESEPGPVTRRLYDELVGIQYGDKE
APEGWIVKV
>OMNI|HI1193/29-342
WDEGKLTTDSTLHIHEGSTALHYGQQCFEGLKAYRCKDGSINLFRPQANAERMQRTADRLLMPRVPTELFVRACKEVVKA
NQDWLGPYGSGATLYLRPFLIGVGENIGVKTAP..EFIFSVFCCPVGAYFKGG.LAP..SNFITTDYDRAAPMGTGGVKV
GGNYAASLLPHELAAEQGTPERKFADAIYLDPKTHTKIEEVGAANFFGITKD....NKFITPKSESILPSITKYSLLHIA
KERLGMEAIEGDVYIDQLDQFVEAG......ACGTAAVITPVGGIQHNGKFHVFDSETEVGPVTRRLYDELTGIQFGDIE
APEGWIVKV
>OMNI|NT01HP1585/32-339
WSQGELVSENALQLSEGSPVLHYGQACFEGLKAYRSQKGKALLFRPLENAKRLQTSCERLLMPKVSEELFLKACAEVIKA
NQKWLAPYKSGASLYLRPFVIGVGDNLGVKPAS..EYLFIVFCAPVGAYFKGG.IEKGGARFITTAFDRAAPKGTGGVKV
GGNYAASLLAHKIATEQG.....YDDCIYLDPTTHTKIEEVGAANFFGITHD....DAFITPHSPSILPSVTRKSLMVLA
KEHLKLKVEEREILIDELGAFKEAG......ACGTAAIITPIKEIAHNNKSYSFEAP...GNITKQLYDLLLSIQQGEQE
APKDWIFEV
>OMNI|NT01XF2245/47-360
WHDAQVRAYGPLLLDPAAAVLHYGQEIFEGIKAYRHADGSIWTFRPEANARRLQRSAKRLVLPELPVELFTESLRQLIAV
DARWVPSAP.EASLYFRPFMIATEAYLGVRAAQ..HAAYYLIASPAGPYFAKG.VAP.VSIWLSTDCARAALGGTGAVKC
GGNYAASLLPQQVAQAQG.....CSQVLFLDPVEGKYLEELGGMNVFLVYTDG...TLVTPALSGSILEGITRESILQLA
RD.RGMCVEERKVAIEEWKEGVVSGAISEVFACGTAAVITPIGELKAEGFSVGNINA.PPGEVTLSLRKELTDIQYGRLP
DRYGWMTYL
>OMNI|NT02MT2597/50-367
WHNARVIPYGPIELDPSAIVLHYAQEVFEGLKAYRWADGSIVSFRADANAARLRSSARRLAIPELPDAVFIESLRQLIAV
DKAWVPGAGGEEALYLRPFIFATEPGLGVRPAT..QYRYLLIASPAGAYFKGG.IAP.VSVWVSTEYVRACPGGTGAAKF
GGNYAASLLAQAEAAENG.....CDQVVWLDAVERRYIEEMGGMNIFFVLGSGGSARLVTPELSGSLLPGITRDSLLQLA
ID.AGFAVEERRIDIDEWQKKAAAGEITEVFACGTAAVITPVARVRHGASEFRIADG.QPGEVTMALRDTLTGIQRGTFA
DTHGWMARL
>OMNI|NT01BS0271/50-363
WHHPRIAPYAPLTLDPSSSVFHYGQAVFEGLKAYRTDDGRVLLFRPDQNIKRLNRSCERMSMPPLDEELVLEALTQLVEL
EKDWVPKEK.GTSLYIRPFVIATEPSLGVKASR..SYTFMIVLSPVGSYYGDDQLKP.VRIYVEDEYVRAVNGGVGFAKT
AGNYAASLQAQRKANELG.....YDQVLWLDAIEKKYVEEVGSMNIFFVIN.G...EAVTPALSGSILSGVTRASAIELI
RS.WGIPVREERISIDEVYAASARGELTEVFGTGTAAVVTPVGELNIHGKTVIVGDG.QIGDLSKKLYETITDIQLGKVK
GPFNWTVEV
>OMNI|NMB0337/27-331
WQPTEWQSSQDLSLAPGAHALHYGSECFEGLKAFRQADGKIVLFRPTANIARMRQSADILHLPRPETEAYLDALIKLVKR
AADEIP..DAPAALYLRPTLIGTDPVIGKAGSPSETALLYILASPVGDYFKVG.SPV..KILVETEHIRCAPH.MGRVKC
GGNYASAMHWVLKAKAEYG.....ANQVLFCPNGD..VQETGASNFILINGD....EIITKPLTDEFLHGVTRDSVLTVA
KD.LGYTVSERNFTVDELKAAVENGAE..AILTGTAAVISPVTSFVIGGKEIEVKSQ....ERGYAIRKAITDIQYGLAE
DKYGWLVEV