HMM Seed Alignment: TIGR01007

Download Alignment

>SP|P39851|CAPB_STAAU/23-226
EKFRGIRSNIMFSNAENEIKSLLITSEKSASGKSILSANIAVTYAQAGYKTLIIDGDMRKPTQHYIFDLPN.NSGLSNLI
INKTTYSDSIKETRV.ENLNVLTAGPTPPNPSELIASSKFATIFNELLNHYDFIVIDTPPINTVTDAQVYARIVKNCVLV
IDAEKNNKSEVKKAKGLLTKAGGKVLGAVLNKMPIDKNSS.YYYYYG
>GP|1773341|gb|AAC46085.1/23-226
EKFRGIRSNIMFSKANGEVKRLLVTSEKPGAGKSTVVSNVAITYAQAGYKTLVIDGDMRKPTQNYIFNEQN.NNGLSSLI
IGRTTMSEAITSTEI.ENLDLLTAGPVPPNPSELIGSERFKELVDLFNKRYDIIIVDTPPVNTVTDAQLYARAIKDSLLV
IDSEKNDKNEVKKAKALMEKAGSNILGVILNKTKVDKSSS.YYHYYG
>GP|2072439|gb|AAC45229.1/26-229
EQYRTIRTTIDFKMADQGIKSFLVTSSETDEGKTTVSANIAVAFAQQGKKVLLIDGDLRKPTVNITFKVQN.RVGLTNIL
MHQSSIEDAIQGTRLSENLTIITSGPIPPNPSELLASSAMKNLIDSVSDFFDVVLIDIPPLSAVTDAQILSSYVGGVVLV
VRAYETKKESLAKTKKKLEQVNANILGVVLHGVDSSDSPS.YY.YYG
>GP|3320389|gb|AAC38747.1/19-222
EYYNALCTNLQLSGDG..LKVFSITSVKIGEGKSTTSANIAWAFARAGYKTLLIDGDIRNSVMLGVFKARNKITGLTEFL
SGTTDLSQGLCDTNI.ENLFVIQAGSVSPNPTALLQSKNFTTMLETLRKYFDYIIVDTAPVGVVIDAAIITRNCDASILV
TEAGEINRRDIQKAKEQLEHTGKPFLGIVLNKFDTSVDKYGSYGNYG
>GP|3907602|gb|AAC78666.1/19-222
EYYNALCTNLQLSGDD..LKVFSITSVKAGEGKTTTSTNIAWAFARAGYKTLLIDADMRNSVMSGVFKSRERITGLTEFL
SGTTDLSQGLCDTNI.ENLFVIQAGSVSPNPTALLQSKNFTTMLETLRKYFDYIVVDTAPVGVVIDAAIIMQKCDASILV
TKAGETKRRDLQKAKEQLEQTGKSCLGVVLNKLDTSVEKYGSYGSYG
>SP|Q54520|CPD2_STRPN/19-222
EYYNALCTNIQLSGDK..LKVISVTSVNPGEGKTTTSVNIARSFARAGYKTLLIDGDTRNSVMSGFFKSREKITGLTEFL
SGTADLSHGLCDTNI.ENLFVVQSGTVSPNPTALLQSKNFNDMIETLRKYFDYIIVDTAPIGIVIDAAIITQKCDASILV
TATGEVNKRDVQKAKQQLEQTGKLFLGVVFNKLDISVDKYGVYGFYG
>SP|Q04663|CPSC_STRAG/19-222
EYFNAIRTNIQFSGKE..NKILAIASVREGEGKSTTSTSLALSLAQAGFKTLLIDADTRNSVMSGTFKATGTIKGLTNYL
SGNADLGDIICETNV.PRLMVVPSGKVPPNPTALLQNAYFNKMIEAIKNIFDYIIIDTPPIGLVVDAAIIANACDGFILV
TQAGRIKRNYVEKAKEQMEQSGSKFLGIILNKVNESVATYGDYGNYG
>GP|3411124|gb|AAC31162.1/19-222
EYYNTIRTNIQFSGAQ..MKVIAISSVEAREGKSTTSVNLAISFASVGLRTLLIDADTRNSVLSGTFKSNEPYKGLSNFL
SGNADLNETICQTDI.SGLDVIASGPVPPNPTSLLQNDNFRHLMEVARSRYDYVIIDTPPIGMFIDAAIIAHQADASLLV
TAAGKIKRRFVTKAVEQLEQSGSQFLGVVLNKVDMTVDKYGSYGSYG