HMM Seed Alignment: TIGR01005

Download Alignment

>PIR|S37031|S37031/25-786
DGFIDLDRLVAAVFRRARLVAAFVVLFIALGAAYLLFATPYYTSMTQILLDENLSKYAEEEPTPVN...SQMLDTQIASA
VEILKSGELALRVVDKLKLSENDTILNPPRSPVDMVKEWLKTATGLFS..GGPDVTEEAARNGRRQKAAAIIQQSLAVER
VSRSSVVAVAFRSSDPLLAATIARGYASAYLTDQLNANFEATERASVWLQERLTDLQQRSQAAALEVAHFRAENGLTAA.
RGELMSEQQMADLNSQLIVAQADTASASARYDQYKSIVDQGPENAVKNATISSKEGDNSVIRDLRTRYLTVGKREREVSD
NFGADHPQAVCSAPSRRMSRAQIYQELQQLTASYKNEYEVAQSREESLRKSIQGIAGKTSDASEQLVQLRELEQKAAALK
TLYESYLGRYEQATQQQ..SFPIAKARVISEAGVPVSPSSPKKTMTLALSAVLGMMVGGAYAAFLEFRERTFRLEGNIRS
ILGHRSLGYVPLLGTRMKKKAQLVHAHFGSVKRHDE.AVDDTMPFQRLSRIVVDAPRSTFAETFRNAKLACDQMLAGSES
R.VIAIASALPDEGKSIIAANFAALLAASGKRTLLIDADIRKPGLTQMITPAPRTGLVETLIGEASWPAGIKVDQRTKLA
ILPAGGASHQRHQSNELLASPAMANLIENARNAFDYVVVDLAALAPVVDAKAFAPLADGIL.FVVEWGRTPSRLVRDLLH
SEPLINSKVLGVILNKTDMNELG.....KYSDFDGAEKYRHRYGKYYVENTITENTAA
>SP|Q45409|EPB2_RALSO/15-750
ENELDLVRYLDVLVANRWLIAGIAAAVMLLGAAYAFLARPVYEADIMVQVEDNPNSAKSLLGDVSS...LFDVKTDANAE
IEILRSRMVVGKAVDNLHLYITAKPR...YFP..LIGAWISSRATRLSEPGLFGLGGYVWGTESIDVDGFDVPEALEGQP
FKLIVLGNGRYRLENKSLDAPIEGVVGEPLEAKQSIGTIQLQVNNLTAKAGATFELERDSRLKTMEMLQDKLKIAEKGK.
QSGIIG.ASLDGTNPALTAAIMNQIATEYVAQNIKRKAEEAERSLVFLDGLLPQLKLELERAEMKYNEMRNLRGTFDLSE
EGKAFLQESVTVETSLQELKQKRAELLTRFTSSHPGVQAIDQQIS.VMSGKVNSMTRRLKSLPNIEQDTVRLMRDVQVDN
ELYVSLLNDMQQLKLVK..AGKVGNVRLVDGAAVPEEPVKPKKLTVTPLAGVLGVVLGVMAAFVRNALFGGITDPQDIEE
HTGLSVYATVPLSDTQVDLSGQLTTRKRG...............QYLLARRVPDDPS...IEALRSLRTALQFAMQDAGN
N.LVVLTGPTPGVGKSFVSANLAAVIATGGKRVLLIDADMRKGYLHQYFGKDRKPGLLDLLAGNRSIEQVVHREVVPGLD
FIATG...LFPHNPSELLLNPRMVELMDTFRSQYDLVLVDTPPVLAVADTAILAARAGLVL.LVTRFERSTLGEIRETIK
QLQHANVDVRGVVFNALDPNTY......RYGYGSRYGRYRYVQYGYTSNSKPPEAESA
>OMNI|NTL02ML6644/9-760
DVDVDLRQLFASLARNWLRILLFVLVVTGLAFAFASFATKHYKAQTQVEIAPRESVYTRPAGSNNDGDKPILDEQGVATQ
VQIISSNEILKQVAQKLGLARLPEFD....ET..INMSALSRVLILLG......LKNDPMDVPADERVLKKMREKLNVFG
VEKTRIIAIEFSSEDPKLAAAIPDAIAAAYIAGQGAAKSESNTAAADFLAPEIADLSKQVRDAEAKVAAYRAQSDLLMGG
NNATLATQQLAELSTELSRVRANRAAAEGTADSVRKALQNGGSLDSLPEVLSS.....DLIQRLRERQAELRATIADLST
TMLDNHPRVRAAKSQLADLDAQIRSEAQKIMKGLLMQADAAKARESQLVSDVNQLKAASAQAGEQQVDLDALQRDAAAKR
QQLELYLTNYREAASRQDRNYVPVDARVASPASVPSEPYFPKVGPIVGAAAAASLLLAAIFTLLRELFSGRAMRPAPGAR
FAPIDEVAMPATARRQPDAPEPSARPEPAVASAFADRDAETQWPEAVAEPEMAAQPRPVAEPELAVKEEPVAEAKSVAEP
EPVVETQRPRSVLGEIDIEKAAEKLIASGAARAIFVSPEGDEAAASAILVAREVS...D..AGLRVLLLDLTASGAASRP
MLDSG....LFPGITDLLASQAQFSDVIHADLYSDCHVIPVGTADPVRAMRAADRLPIIMQSLTTAYDLVVVECGPADAQ
GISRLGGEATEVFLSMLEPDDEVTKAAVKLIESGYPDLTLVTPIGHEPPGTPGRRSAA