HMM Seed Alignment: TIGR00795
Download Alignment>SP|P33231|LLDP_ECOLI/1-544
MNLWQQNYDPAGNIWLSSLIASLPILFFFFALIKLKLKGYVAASWTVAIALAVALLFYKMPVANALASVVYGFFYGLWPI
AWIIIAAVFVYKISVKTGQFDIIRSSILSITPDQRLQMLIVGFCFGAFLEGAAGFGAPVAITAALLVGLGFKPLYAAGLC
LIVNTAPVAFGAMGIPILVAGQVTGID......................SFEIGQMVGRQLPFMTIIVLFWIMAIMDG.W
RGIKETWPAVVVAGGSFAIAQYLSSNFIGPELPDIISSLVSLLCLTLFLKR.WQPVRVFRFGDLGASQVDMTLAH..TG.
.....YTAGQVLRAWTPFLFLTATVTLWSIPPFKALFASGGALYEWVINIPVPYLDKLVARMPPVVS..EATAYAAVFKF
DWFSATGTAILFAALLS.IVWLKMKPSDAISTFGSTLKELALPIYSIGMVLA.FAFISNYSGLSSTLALALAH.TGHAFT
FFSPFLGWLGVFLTGSDTSSNALFAALQATAAQQIGVSDLLLVAANTTGGVTGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESDLFRF
TVKHSLIFTCIVGVITTLQAY
>SP|Q46839|GLCA_ECOLI/1-552
MVTWTQMYMPMGGLGLSALVALIPIIFFFVALAVLRLKGHVAGAITLILSILIAIFAFKMPIDMAFAAAGYGFIYGLWPI
AWIIVAAVFLYKLTVASGQFDIIRSSVISITDDQRLQVLLIGFSFGALLEGAAGFGAPVAITGALLVGLGFKPLYAAGLC
LIANTAPVAFGALGVPILVAGQVTGID......................PFHIGAMAGRQLPFLSVLVPFWLVAMMDG.W
KGVKETWPAALVAGGSFAVTQFFTSNYIGPELPDITSALVSIVSLALFLKV.WRPKNTETAISMGQSAGAMVVNKPSSGG
PVPSEYSLGQIIRAWSPFLILTVLVTIWTMKPFKALFAPGGAFYSLVINFQIPHLHQQVLKAAPIVA..QPTPMDAVFKF
DPLSAGGTAIFIAAIIS.IFILGVGIKKGIGVFAETLISLKWPILSIGMVLA.FAFVTNYSGMSTTLALVLAG.TGVMFP
FFSPFLGWLGVFLTGSDTSSNALFGSLQSTTAQQINVSDTLLVAANTSGGVTGKMISPQSIAVACAATGMVGRESELFRY
TVKHSLIFASVIGIITLLQAY
>OMNI|NTL01HP00127/1-538
.MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLALSILIALFVYKMPVQMVSASFFYGFLYGLWPI
AWIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILSLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLC
LIANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIP......................ELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDG.F
RGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLSSNYLGPQLPDIISALVSLVATTLFLKF.WQPKHIFTSN..GKEPTISTEKH.....
......HICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFKEGGALAFSNFAFEFNSISQKIFKTVPIVT..EATNFPVVFKL
PLILTTGTSIFLAALLS.VFLLRVKISDAIGVFGATLKEMRLPILTIGVVLA.FAYVANYSGMSATLALALAD.TGHVFT
FLSPMVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFLAANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRF
TVKYSIALAIIMGIVFTLIAY
>OMNI|HP0140/1-538
.MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFVSLIVFKLKGYSAGFLSLLLSIIIALFVYKMPAQMVSASFFYGFLYGLWPI
AWIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLC
LIANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIP......................ELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDG.F
RGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLSSNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKF.WQPKRIFTSN..GKEPTINTEKH.....
......HICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFKEGGALAFSSFAFEFSSISQKIFKTVPIVT..EATNFPVVFKL
PLILTTGTSIFLAAILS.VFLLRVKISDAIGVFGATLKEMRLPILTIGVVLA.FAYVANYSGMSATLALALAD.TGHVFT
FFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFLAANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRF
TVKYSIVLAIIMGIVFTLIAY
>OMNI|HP0141/1-541
MLEFHQIYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYTAAFLSVALSAVIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI
AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYSAGLC
LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVP......................AILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDG.F
KGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFLSSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKF.WQPKAIFRSD..GKAASFTKSNH.....
......HICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALFEKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVSFPVVFKF
LLINTVGTSIFLAALVS.MLVLRVRVSDALSVFGETLKEMRYPILTIGLVLS.FAYVSNYSGISSTLALALTH.TGLAFT
FFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEVLTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKF
TVKYSLIFVAIMGVVISAIAY
>OMNI|NTL01HP00128/1-541
MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYTAAFLSVALSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI
AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYSAGLC
LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVP......................AILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDG.F
KGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFLSSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKF.WQPKTIFRSD..GKAISFTKTNH.....
......HICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALFEKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVNFPVVFKL
LLINTVGTSIFLAALVS.MLVLRVRVSDALSVFGETLKEMRYPILTIGLVLS.FAYVSNYSGISSTLALALTH.TGLAFT
FFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEVLTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKF
TVKYSLIFVAIMGVVISAIAY
>SP|P55910|YCGC_BACSU/1-471
.....................................................................MLGIGSGLWPI
GYIVLMAVWLYKIAVKTGKFTIIRSSIAGISPDQRLQLLLIGFCFNAFLEGAAGFGVPIAISAALLVELGFKPLKAAALC
LIANAASGAFGAIGIPVITGAQIGDLS......................ALELSRTLMWTLPMISFLIPFLLVFLLDR.M
KGIKQTWPALLVVSGGYTAVQTLTMAVLGPELANILAALFSMGGLAFFLRK.WQPKEIYREE..GAGDAGEKKAY.....
......RAADIARAWSPFYILTAAITIWSLPAFKALFQEGGLLYQSTLLFKMPFLHQQIMKMPPIAP..SAMPLDAVFKV
DLLSATGTAILAAVIVTGLVSKKFSSRDAFASLKETGKELWVPIMTICFVMG.FANLANFAGLSSSIGLALAR.TGDLFP
FVSPVLGWIGVFITGSVVSNNALFGHLQVVTGAQIGAGSDLLLAANTAGGVMAKLVSPQSIAIAAAAVGQTGKESKLFKR
TVPYSLILLLIICIWTFTLAR
>OMNI|BB0604/1-500
....MNSYD........FITALVPIILIIIGLGIIKKPAYYVIPISLIATVAIVIFYKNLGIVNTSLAMLEGALMGIWPI
ATVIIAAIFTYKMSEDQKDIETIKNILSNVSSDRRIIVLLVAWGFGNFLEGVAGYGTAVAIPVSILIAMGFEPFFACLIC
LIMNTSSTAYGSVGIPITSLAQATNLD......................VNIVSSEIAFQLILPTLTIPFVLVILTGGGI
KGLKGVFLLTLLSGMSMAISQVFISKTLGPELPAILGSILSMTITIVYARF.FGNKETTERQ...SKNTISLSKG.....
...........IIACSPYILIVTFIVLVS.P....LFNK...IHEYLKTFQS......TISIYPEAN.......PLHFK.
.WIISPGFLIILATTIS.YSIRGVPMLKQLKIFTLTLKKMALSSFIIICIVA.ISRLMTHSGMIRDLANGISIITGKFGP
LFSPLIGAIGTFLTGSDTVSNVLFGPLQTQMAENIGANPYWLAAANTTGATGGKMISPQNITIATTTAGLIGQEGKLLSK
TIIYALYYILATGLLVYLV..
>OMNI|AF0806/1-537
...............MDAIVAATPILLVLFLMAGLRMSAMKAMPIGWLVTVIIALFYWKMPPEWIAAATIKGTLS.ALDI
LLVVFGAVYLYYDARLSGATRAITRGIMGLSADRRIQAG.IAFLLVTFFEGAAGFGTPGAIVGPLLVGIGFPPAIAAPLV
LIFDSSPVSFGAVGIPVWGGLGSSLDSPVVKEVLESYGYTLKQFLYTDVTFWTATLHGIMAVFIPLLGAVFMVKWSGGKV
SDVKDAAPSLLLAGLSFAIPYWILAASLGPEFPSLLGGIIGLVIYSATLKAGFVPKTSWDFA..KKHEAGEESER.....
....IEKEFSILEAMVPYVLVSLGLVLTRTVPAINQFVTTNLVIGISGILGTSLS..HTYKLLYNPG........TIFII
AVLISNAVSRLSPKHTA.....RALKTTAIGVAPAAIALVFAVSLSQIMMNS.GNNLSGMPSMLKVMAVSLANATGLGYI
MLAVFVGILGAYMSGSNTVSNILFGGFQFEIANATGLPKTIILALQNVGGAVGNMICVHNVVAVCTTCGILGQEGDVIRK
NLVPATIYAIVVSVVAAIAVF
>SP|Q57251|YC18_HAEIN/1-527
..............MLSFILSIFPIVLLIYLMVKRNALPSYVALPWVATLVMGVHLLHFNTDIVTISANVVSAIIAVQTP
ITVIFGAILFNRFSEISGATNIMRKWLGNINPNPVAQLMIIGWAFAFMIEGASGFGTPAAIAAPILVGLGFHPLKVAMLA
LIMNSVPVSFGAVGTPTWFGFGALKLS...................EDMILEIGSITAFIHSIAALIIPLLALRILVN.W
DDIRKNIVFIYISVLGCVVPYFLIAQVN.YEFPSLVGGAIGLFISVWAANR..NIGLAKVTN...TLDNNAVSAG.....
.........EVVKALFPTGLLIAFLIVTRIHQLPFKAMMNDATIWFSTTLGSLGLFEISKGLIFSLKNIFGSNVSSSYKL
LYVPALIPFVITVLIAIPFFKISSSNVKQILVSSLQQSKNPFIALIGALVMVNLMLVGGEHSMVKIIGRTFAEISGSNWT
IFSSFLGAIGSFFSGSNTVSNLTFGSVQLSTAETTGISVALVLALQSVGGAMGNMVCINNIVAVSSVLNISNQEGTIIKK
TIIPMIIYGIIAALGALFLVP