HMM Seed Alignment: TIGR00513

Download Alignment

>OMNI|NTL01EC00185/1-319
.....MSLNFLDFEQPIAELEAKIDSLTAVSRQDEKLDINIDEEVHRLREKSVELTRKIFADLGAWQIAQLARHPQRPYT
LDYVRLAFDEFDELAGDRAYADDKAIVGGIARLDGRPVMIIGHQKGRETKEKIRRNFGMPAPEGYRKALRLMQMAERFKM
PIITFIDTPGAYPGVGAEERGQSEAIARNLREMSRLGVPVVCTVIGEGGSGGALAIGVGDKVNMLQYSTYSVISPEGCAS
ILWKSADKAPLAAEAMGIIAPRLKELKLIDSIIPEPLGGAHRNPEAMAASLKAQLLADLADLDVLSTEDLKNRRYQRLMS
YGYA..........
>SP|P43872|ACCA_HAEIN/1-315
.....MNQEYLDFELPIAELEAKIEALRAAS..DD..KVDLTDEIKRLQKKSNELTKKTFANLDAWQVSRMARHPNRPYT
LDYIEHIFTEFEELAGDRAFADDKAIVGGLARLDGRPVMVIGHQKGRSVKEKVQRNFGMPAPEGYRKALRLMEMAERFKL
PIITFIDTPGAYPGIGAEERGQAEAIARNLREMAQLTVPVICTVIGEGGSGGALAIGVGDKVNMLQYSTYSVISPEGCAS
ILWKSAEKASTAAEVMGLTASRLKELNLIDSIVQEPLGGAHRSYLEIAENLKLRLKEDLAELDELSKEELLNRRYERLMS
YGYC..........
>SP|O34847|ACCA_BACSU/1-325
......VAPRLEFEKPVIELQTKIAELKKFTQ.DS..DMDLSAEIERLEDRLAKLQDDIYKNLKPWDRVQIARLADRPTT
LDYIEHLFTDFFECHGDRAYGDDEAIVGGIAKFHGLPVTVIGHQRGKDTKENLVRNFGMPHPEGYRKALRLMKQADKFNR
PIICFIDTKGAYPGRAAEERGQSEAIAKNLFEMAGLRVPVICIVIGEGGSGGALGLGVGNHLHMLENSTYSVISPEGAAA
LLWKDSSLAKKAAETMKITAPDLKELGIIDHMIKEVKGGAHHDVKLQASYMDETLKQSLKTLLKLSEEELVQQRYEKYKA
IGKVSVEDQYIGVN
>SP|P74638|ACCA_SYNY3/1-326
MSKSERRVFLLDFEKPLYELEEKINQIRELAE.EK..NVDVSEQLSQLESRAEQLRQEIFSNLNPSQRLQLARHPRRPST
LDYIQAIADDWFEMHGDRGGYDDPALVGGVARLGTRPVVIMGHQKGRDTKDNVARNFGMAAPNGYRKALRLMEHADRFGM
PIITFIDTPGAWAGIDAEKLGQGEAIAVNLREMFRLDVPILCTVIGEGGSGGALGIGVGDRVLMLENAVYTVATPEACAA
ILWKDAKKSDKAAIALKITADDLAKLQIIDGIIPEPKGAAHANPLGAAAKLKEALLFHLNTLAQLTPQERKQLRYDKFRH
LGQFLETAV.....
>SP|O25283|ACCA_HELPY/1-312
......MAVYLDFENHIKEIQNEIELALIRG..DE.......DAKEILEKRLDKEVKSIYSNLTDFQKLQLARHPDRPYA
MDYIDLILKDKYEVFGDRHYNDDKAIVCFVGKIDNVPVVVIGEEKGRGTKNKLLRNFGMPNPCGYRKALKMAKFAEKFNL
PILMLVDTAGAYPGIGAEERGQSEAIAKNLQEFASLKVPTISVIIGEGGSGGALAIAVADKLAMMEYSIFSVISPEGCAA
ILWDDPSKTEVAIKAMKITPRDLKEAGLIDDIILEPSKGAHRDKFSAANTIKEYFLDALRTIQQD..PHFLDNRYQKLMS
LGSFVESMN.....