HMM Seed Alignment: TIGR00436

Download Alignment

>SP|P43728|ERA_HAEIN/11-282
GFIAIVGRPNVGKSTLLNKILGQKISITSRKAQTTRHRIVGIKTEGAYQ.EIYVDTPGLHIEEKRAINRLMNRAASSAIG
DVDLIIFVVDGTHWNAD.DEMVLNKLRNAKAPVVLAINKVDNIKNKDDLLPFITDLSSKFNFA..HIVPISAQRGNNVHE
LEKIVRQSLREGVHHFPEDYVTDRSQRFMASEIIREKLMR.FTGEELPYSVTVEIEQFKVN.ERGTYEINGLILVEREGQ
KKMVIGAGGQKIKTIGMEARADMERLFDNKVHLELWVK
>SP|P06616|ERA_ECOLI/9-280
GFIAIVGRPNVGKSTLLNKLLGQKISITSRKAQTTRHRIVGIHTEGAYQ.AIYVDTPGLHMEEKRAINRLMNKAASSSIG
DVELVIFVVEGTRWTPD.DEMVLNKLREGKAPVILAVNKVDNVQEKADLLPHLQFLASQMNFL..DIVPISAETGLNVDT
IAAIVRKHLPEATHHFPEDYITDRSQRFMASEIIREKLMR.FLGAELPYSVTVEIERFVSN.ERGGYDINGLILVEREGQ
KKMVIGNKGAKIKTIGIEARKDMQEMFEAPVHLELWVK
>SP|P42182|ERA_BACSU/9-279
GFVSIIGRPNVGKSTFLNRVIGQKIAIMSDKPQTTRNKVQGVLTTGTSQ.TIFIDTPGIHKP.KHKLGDFMMKVAQNTLK
EVDLILFMINAEEGYGKGDEFIIEKLQTMSTPVFLIVNKIDKI.HPDQLLLLIDEYRKRYPFK..EIVPISALEGNNIET
LLAQIEAYLPEGPQFYPSDQVTDHPERFIISELIREKVLH.LTREEIPHSIAVAIESIKGQ.DNGSVHVAATIVVERDSQ
KGIVIGKKGSLLKEVGKRARADIEALLGSRVYLELWVK
>SP|Q55526|ERA_SYNY3/23-294
GFVAIVGRPNVGKSTLMNQLVGQKIAITSPVAQTTRNRLQGIITTPSSQ.IILLDTPGIHKP.HHELGRVLVKNAIQAIH
SVDLVVFLVDSSATLGRGDRFVVDLLQKTDGPVVVGLNKQDQQ.PPDQREELNASYETLTENHGWPCFKFSALTGEGLSN
FQSALEARLDPGPYYYPPDLVTDQPERFIMAELIREQILL.LTRQEVPHSVAIAIEKVEET.PER.TNVFAAITVERGSQ
KGIIIGQKGSMLQAIGTAARQQIQKLISGDVYLKLFVK
>SP|O51604|ERA_BORBU/4-273
GFAAILGRPSTGKSTLLNSICGHKISIISPIPQTTRNNIKGIFTDDRGQ.IIFIDTPGFHLS.KKKFNIAMMKNIHSSIG
EVELILYIIDIQDKPGEEENKMLEIIKNSKIKFLVILNKIDLKNTKIKEITQFLKEKGIEDS...NIIKISAEKKINTEE
LKNKIYENFSEGPLYYPQEYYTDQEINFRISEIIREKAIEN.LKEELPY..SLYVDIDTLENKKGSLFIRANIFVANESQ
KGIIVGKNGKEIKSIGERARKTIAKIFETKCNLFLQVK
>SP|P75210|ERA_MYCPN/4-276
IRIGVLGLTNAGKSTLVNQLHKANNLLVSPMNNTTLLAVSTNTITHEKQNITFIDVPGFSEK.RHSSYELISQEIRKALS
GIDVLLLVVRSDQQQKL..PLLQTQLQPLKRYRDLTRVLLINN.FFDVVLQAEDKQAIVLDFKPQAVLETDLLHFDATSF
WNQFNEVKLQANEFRKDVEFLDADTDNFKILEALREQIIK.YCSEEIPHVVRLEIVDKSFDQAKNLLKLHLSISVPKLSQ
KKIIIGRNAQMVKKIGMQMRQKLLEYYDCNVFVELFVR
>SP|P47627|ERA_MYCGE/4-276
LKVGVLGPTNAGKSTLINFLHNDDSLMVSSMNNTTLLSISTEVINQANKNIVFIDVPGFTEK.KHSNYELITKEIRKALS
GIDVLLLVVRSDQNNKI..EFLKTQLQQLKRYQNLTRIFLINK.FHQKSLSEVNKAIILEEFKPQKTIEINLLKFDKNLF
WSIFKQVELRYNIFRKDINFIDANNDDFKILEGLREQIIF.YCKNEIPHIARIEIIEKSFNKEKNLLKIHLVISVPKLSQ
KKIIIGKNAEMIKAIGIATRKKLLNHFDCDIFIDIFVK